140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2456 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2456  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  590  1e-168  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1140  protein of unknown function DUF6 transmembrane  76.71 
 
 
301 aa  356  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113288 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3989  protein of unknown function DUF6 transmembrane  66.55 
 
 
306 aa  290  2e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0917  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.28 
 
 
312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.28 
 
 
312 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0199053  normal  0.550765 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4095  hypothetical protein  42.66 
 
 
286 aa  205  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2347  hypothetical protein  49.45 
 
 
330 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1302  hypothetical protein  43.55 
 
 
304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.730648  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2371  hypothetical protein  41.89 
 
 
302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2268  hypothetical protein  44.09 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1738  hypothetical protein  43.37 
 
 
302 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2350  hypothetical protein  43.37 
 
 
302 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2116  hypothetical protein  44.33 
 
 
301 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363277  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2386  hypothetical protein  43.73 
 
 
302 aa  195  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0952  hypothetical protein  43.77 
 
 
302 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0929  hypothetical protein  42.23 
 
 
302 aa  192  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50488  normal  0.616383 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1315  integral membrane protein, DUF6  43.24 
 
 
302 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349562  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1951  hypothetical protein  43.24 
 
 
302 aa  192  8e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1002  hypothetical protein  43.24 
 
 
302 aa  192  8e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0862  hypothetical protein  43.24 
 
 
302 aa  192  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0286  hypothetical protein  43.24 
 
 
302 aa  192  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2511  hypothetical protein  47.97 
 
 
327 aa  192  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1164  integral membrane protein  43.24 
 
 
302 aa  192  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.766304  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1155  integral membrane protein  43.24 
 
 
302 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3554  hypothetical protein  40.99 
 
 
297 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2732  hypothetical protein  43.66 
 
 
289 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5689  hypothetical protein  42.29 
 
 
302 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2949  hypothetical protein  43.73 
 
 
288 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0987  hypothetical protein  45.58 
 
 
313 aa  186  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.0533863 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1845  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.34 
 
 
287 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.278563 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3085  hypothetical protein  42.61 
 
 
289 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0254  hypothetical protein  46.24 
 
 
290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.663739  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.34 
 
 
314 aa  179  7e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.594073  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4264  hypothetical protein  43.7 
 
 
295 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0105351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3061  hypothetical protein  42.25 
 
 
289 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.608952  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4790  hypothetical protein  43.7 
 
 
295 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.430049  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4886  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.47 
 
 
295 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240403  normal  0.615803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2148  transporter of the DMT superfamily  46.4 
 
 
316 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0829  hypothetical protein  45.23 
 
 
295 aa  176  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0472723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5402  hypothetical protein  44.53 
 
 
295 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3482  hypothetical protein  44.53 
 
 
295 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4884  hypothetical protein  44.53 
 
 
295 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951172  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0259  hypothetical protein  40.58 
 
 
286 aa  175  8e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3844  hypothetical protein  48.15 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3086  hypothetical protein  43.84 
 
 
300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2978  conserved hypothetical protein membrane protein  40.14 
 
 
287 aa  173  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2052  hypothetical protein  42.25 
 
 
288 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0282096  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2334  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.61 
 
 
287 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0523768  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0746  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.07 
 
 
320 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48150  hypothetical protein  41.61 
 
 
287 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3728  hypothetical protein  43.94 
 
 
315 aa  172  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4837  hypothetical protein  44.2 
 
 
284 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0184  hypothetical protein  43.77 
 
 
313 aa  171  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.482363  normal  0.823558 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0402  hypothetical protein  46.62 
 
 
311 aa  168  9e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2662  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.61 
 
 
287 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301286  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3724  hypothetical protein  44.49 
 
 
295 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.212991 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3540  hypothetical protein  44.24 
 
 
308 aa  168  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7474  putative inner membrane transport protein of unknown function  44.41 
 
 
286 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.450113 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0914  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.01 
 
 
287 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.583051  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1891  hypothetical protein  42.36 
 
 
287 aa  165  9e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.829047  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6291  hypothetical protein  43.12 
 
 
305 aa  165  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0524409  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4235  hypothetical protein  42.63 
 
 
318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7209  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.49 
 
 
298 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266487  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0969  hypothetical protein  41.25 
 
 
290 aa  162  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0637  hypothetical protein  40.84 
 
 
300 aa  158  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.64 
 
 
299 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00112924  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4589  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.89 
 
 
295 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0264  hypothetical protein  42.11 
 
 
295 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1783  drug/metabolite family efflux pump  44.94 
 
 
295 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000148908 
 
 
-
 
NC_004310  BR1893  hypothetical protein  42.52 
 
 
285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4219  hypothetical protein  45.88 
 
 
295 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4736  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.52 
 
 
296 aa  151  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0137287 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4436  hypothetical protein  44.52 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.785068 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2213  hypothetical protein  40 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139395  normal  0.292035 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2011  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.84 
 
 
284 aa  142  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.87899  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0052  hypothetical protein  37.92 
 
 
301 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1075  hypothetical protein  48.43 
 
 
317 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00290318 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1638  hypothetical protein  31.88 
 
 
298 aa  130  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2611  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.54 
 
 
282 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.593978  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  29.33 
 
 
293 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  28.12 
 
 
315 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  27.27 
 
 
303 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  25.7 
 
 
303 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  25.96 
 
 
303 aa  53.1  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  25.96 
 
 
303 aa  53.1  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  26.32 
 
 
303 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.45 
 
 
340 aa  53.1  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.3 
 
 
319 aa  52.8  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  25.96 
 
 
303 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  25.96 
 
 
303 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.91 
 
 
292 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  25.95 
 
 
303 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.48 
 
 
305 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.48 
 
 
305 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  24.23 
 
 
306 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.86 
 
 
292 aa  50.4  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  24.57 
 
 
304 aa  50.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  22.78 
 
 
307 aa  50.1  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  26.87 
 
 
303 aa  50.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  23.46 
 
 
306 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>