149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2213 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2213  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139395  normal  0.292035 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.32 
 
 		 312 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0199053  normal  0.550765 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1302  hypothetical protein  41.37 
 
 		 304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.730648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0917  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.32 
 
 		 312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2116  hypothetical protein  42.72 
 
 		 301 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363277  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5689  hypothetical protein  42.58 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0952  hypothetical protein  43.56 
 
 		 302 aa  192  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2371  hypothetical protein  41.94 
 
 		 302 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2268  hypothetical protein  42.53 
 
 		 302 aa  188  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1315  integral membrane protein, DUF6  43.27 
 
 		 302 aa  188  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349562  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2386  hypothetical protein  42.21 
 
 		 302 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1951  hypothetical protein  43.27 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1002  hypothetical protein  43.27 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0862  hypothetical protein  43.27 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1155  integral membrane protein  43.27 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1164  integral membrane protein  43.27 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.766304  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0286  hypothetical protein  43.27 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0929  hypothetical protein  41.94 
 
 		 302 aa  186  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50488  normal  0.616383 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1738  hypothetical protein  41.83 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2350  hypothetical protein  41.83 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0746  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.98 
 
 		 320 aa  182  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7209  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.13 
 
 		 298 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266487  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2978  conserved hypothetical protein membrane protein  42.16 
 
 		 287 aa  178  9e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6291  hypothetical protein  46.99 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0524409  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0987  hypothetical protein  42.26 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.0533863 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2511  hypothetical protein  44.1 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4264  hypothetical protein  43.7 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0105351 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4790  hypothetical protein  42.86 
 
 		 295 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.430049  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2949  hypothetical protein  39.52 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4886  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.83 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240403  normal  0.615803 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3085  hypothetical protein  39.58 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2662  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.75 
 
 		 287 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2732  hypothetical protein  38.89 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3061  hypothetical protein  38.83 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.608952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3482  hypothetical protein  43.65 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4884  hypothetical protein  43.65 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5402  hypothetical protein  43.65 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0969  hypothetical protein  42.47 
 
 		 290 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3728  hypothetical protein  41.58 
 
 		 315 aa  167  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3554  hypothetical protein  38.14 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_004310  BR1893  hypothetical protein  40.77 
 
 		 285 aa  166  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1891  hypothetical protein  43.73 
 
 		 287 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.829047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4095  hypothetical protein  37.54 
 
 		 286 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2052  hypothetical protein  39.86 
 
 		 288 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0282096  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1638  hypothetical protein  38.61 
 
 		 298 aa  165  9e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2611  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4837  hypothetical protein  43.26 
 
 		 284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4436  hypothetical protein  41.96 
 
 		 332 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785068 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3086  hypothetical protein  39.86 
 
 		 300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0829  hypothetical protein  42.8 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0472723 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2334  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.6 
 
 		 287 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0523768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3724  hypothetical protein  43.08 
 
 		 295 aa  162  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.212991 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.61 
 
 		 314 aa  161  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.594073  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0184  hypothetical protein  40.52 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.482363  normal  0.823558 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48150  hypothetical protein  41.44 
 
 		 287 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1783  drug/metabolite family efflux pump  43.77 
 
 		 295 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000148908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0914  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.14 
 
 		 287 aa  159  7e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.583051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0254  hypothetical protein  38.62 
 
 		 290 aa  159  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.663739  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0402  hypothetical protein  39.53 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0259  hypothetical protein  39.18 
 
 		 286 aa  155  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2347  hypothetical protein  39.29 
 
 		 330 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1845  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.32 
 
 		 287 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.278563 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3540  hypothetical protein  38.33 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2148  transporter of the DMT superfamily  40.14 
 
 		 316 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3844  hypothetical protein  42.25 
 
 		 314 aa  149  7e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4235  hypothetical protein  38.11 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0264  hypothetical protein  46.39 
 
 		 295 aa  139  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0052  hypothetical protein  42.05 
 
 		 301 aa  139  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4736  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.45 
 
 		 296 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0137287 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2456  hypothetical protein  39.02 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7474  putative inner membrane transport protein of unknown function  39.21 
 
 		 286 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.450113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4589  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.08 
 
 		 295 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4219  hypothetical protein  38.61 
 
 		 295 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3989  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.64 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1140  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.27 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113288 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0637  hypothetical protein  34.6 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.98 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00112924  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1075  hypothetical protein  44.08 
 
 		 317 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00290318 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2011  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.32 
 
 		 284 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.87899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  30.6 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.73 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2202  membrane protein  25 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337301  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  32.97 
 
 		 286 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.8 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.593978  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.56 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  22.48 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.82 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5832  hypothetical protein  28.99 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.684234 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.76 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.76 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  27 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  28.46 
 
 		 297 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  26.09 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  27.48 
 
 		 299 aa  53.5  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.95 
 
 		 301 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6058  hypothetical protein  28.57 
 
 		 298 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  25.3 
 
 		 310 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  25.3 
 
 		 310 aa  52.4  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.95 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.47 
 
 		 325 aa  52.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  24.5 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>