113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2011 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2011  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 284 aa  526  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.87899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.77 
 
 		 299 aa  302  4.0000000000000003e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00112924  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0637  hypothetical protein  58.78 
 
 		 300 aa  295  8e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2148  transporter of the DMT superfamily  52.31 
 
 		 316 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2662  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.12 
 
 		 287 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4264  hypothetical protein  42.15 
 
 		 295 aa  178  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0105351 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4790  hypothetical protein  42.15 
 
 		 295 aa  178  9e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.430049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1075  hypothetical protein  54.26 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00290318 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5689  hypothetical protein  40.93 
 
 		 302 aa  175  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3724  hypothetical protein  42.49 
 
 		 295 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.212991 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3554  hypothetical protein  38.6 
 
 		 297 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0929  hypothetical protein  40.93 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50488  normal  0.616383 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5402  hypothetical protein  42.91 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2268  hypothetical protein  40.21 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1738  hypothetical protein  40.57 
 
 		 302 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2350  hypothetical protein  40.57 
 
 		 302 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3086  hypothetical protein  41.91 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3482  hypothetical protein  42.08 
 
 		 295 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4884  hypothetical protein  42.08 
 
 		 295 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0829  hypothetical protein  44.03 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0472723 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2511  hypothetical protein  46.07 
 
 		 327 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2386  hypothetical protein  39.86 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.97 
 
 		 312 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0199053  normal  0.550765 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2371  hypothetical protein  40.21 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2347  hypothetical protein  44.65 
 
 		 330 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1155  integral membrane protein  40.21 
 
 		 302 aa  168  9e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7209  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.6 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266487  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0917  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.62 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1315  integral membrane protein, DUF6  39.86 
 
 		 302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349562  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6291  hypothetical protein  42.15 
 
 		 305 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0524409  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4886  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.47 
 
 		 295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240403  normal  0.615803 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4095  hypothetical protein  37.5 
 
 		 286 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2334  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.3 
 
 		 287 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0523768  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1951  hypothetical protein  39.86 
 
 		 302 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1002  hypothetical protein  39.86 
 
 		 302 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0862  hypothetical protein  39.86 
 
 		 302 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1164  integral membrane protein  39.86 
 
 		 302 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.766304  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0286  hypothetical protein  39.86 
 
 		 302 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2116  hypothetical protein  39.5 
 
 		 301 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363277  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7474  putative inner membrane transport protein of unknown function  45.13 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.450113 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2732  hypothetical protein  42.11 
 
 		 289 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0952  hypothetical protein  38.79 
 
 		 302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3085  hypothetical protein  39.13 
 
 		 289 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0259  hypothetical protein  35.51 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4837  hypothetical protein  40.07 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1893  hypothetical protein  40.71 
 
 		 285 aa  159  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0969  hypothetical protein  39.13 
 
 		 290 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1891  hypothetical protein  41.91 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.829047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3061  hypothetical protein  40.16 
 
 		 289 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.608952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2978  conserved hypothetical protein membrane protein  37.5 
 
 		 287 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2949  hypothetical protein  41.98 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1783  drug/metabolite family efflux pump  44.02 
 
 		 295 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000148908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0914  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.81 
 
 		 287 aa  156  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.583051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3540  hypothetical protein  40.36 
 
 		 308 aa  155  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216262 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0987  hypothetical protein  44.64 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.0533863 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2052  hypothetical protein  40.17 
 
 		 288 aa  155  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0282096  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2456  hypothetical protein  42.75 
 
 		 312 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1845  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.06 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.278563 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0264  hypothetical protein  42.75 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48150  hypothetical protein  39.93 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0254  hypothetical protein  38.24 
 
 		 290 aa  153  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.663739  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.59 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.594073  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1302  hypothetical protein  35.9 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.730648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3844  hypothetical protein  44.59 
 
 		 314 aa  146  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1140  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.2 
 
 		 301 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113288 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0184  hypothetical protein  39.93 
 
 		 313 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.482363  normal  0.823558 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1638  hypothetical protein  36.33 
 
 		 298 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2611  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4436  hypothetical protein  43.31 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785068 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3989  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.26 
 
 		 306 aa  136  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4219  hypothetical protein  44.27 
 
 		 295 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4736  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.92 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0137287 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2213  hypothetical protein  39.44 
 
 		 308 aa  133  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139395  normal  0.292035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4589  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.48 
 
 		 295 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0746  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.96 
 
 		 320 aa  129  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3728  hypothetical protein  40.75 
 
 		 315 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0402  hypothetical protein  39.16 
 
 		 311 aa  128  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4235  hypothetical protein  37.19 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0052  hypothetical protein  33.19 
 
 		 301 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.79 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  30.77 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.19 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.593978  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  30.05 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  20.31 
 
 		 307 aa  53.5  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.62 
 
 		 310 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  24.86 
 
 		 305 aa  50.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  28.25 
 
 		 341 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  30.5 
 
 		 310 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  24.23 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0474  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.83 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.72 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  21.6 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1111  hypothetical protein  30.1 
 
 		 300 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  29.5 
 
 		 310 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  27.65 
 
 		 289 aa  47  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  22.54 
 
 		 296 aa  46.2  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.68 
 
 		 301 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  30.96 
 
 		 309 aa  45.8  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  20.97 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4504  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.05 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.96 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>