120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2371 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2371  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1738  hypothetical protein  99.34 
 
 		 302 aa  577  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2350  hypothetical protein  99.34 
 
 		 302 aa  577  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5689  hypothetical protein  97.02 
 
 		 302 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2386  hypothetical protein  95.7 
 
 		 302 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0929  hypothetical protein  94.7 
 
 		 302 aa  555  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50488  normal  0.616383 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2268  hypothetical protein  95.36 
 
 		 302 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1951  hypothetical protein  87.38 
 
 		 302 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121613  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1315  integral membrane protein, DUF6  87.04 
 
 		 302 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349562  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0952  hypothetical protein  88.04 
 
 		 302 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1002  hypothetical protein  87.38 
 
 		 302 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0862  hypothetical protein  87.38 
 
 		 302 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1164  integral membrane protein  87.38 
 
 		 302 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.766304  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0286  hypothetical protein  87.38 
 
 		 302 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1155  integral membrane protein  86.71 
 
 		 302 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2116  hypothetical protein  83.28 
 
 		 301 aa  484  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363277  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1302  hypothetical protein  68.54 
 
 		 304 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.730648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0917  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.66 
 
 		 312 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.66 
 
 		 312 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0199053  normal  0.550765 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2347  hypothetical protein  53.64 
 
 		 330 aa  248  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2511  hypothetical protein  53.67 
 
 		 327 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0987  hypothetical protein  49.66 
 
 		 313 aa  241  9e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.0533863 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0184  hypothetical protein  45.27 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.482363  normal  0.823558 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4790  hypothetical protein  48.89 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.430049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3482  hypothetical protein  49.26 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4884  hypothetical protein  49.26 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5402  hypothetical protein  49.26 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4264  hypothetical protein  48.52 
 
 		 295 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0105351 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4095  hypothetical protein  41.87 
 
 		 286 aa  208  9e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3724  hypothetical protein  46.1 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.212991 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3554  hypothetical protein  43.94 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0829  hypothetical protein  49.63 
 
 		 295 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0472723 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.49 
 
 		 314 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.594073  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1638  hypothetical protein  40.54 
 
 		 298 aa  198  7e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2611  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2978  conserved hypothetical protein membrane protein  41.98 
 
 		 287 aa  198  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7209  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.39 
 
 		 298 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266487  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3540  hypothetical protein  44.48 
 
 		 308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6291  hypothetical protein  46.1 
 
 		 305 aa  196  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0524409  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3844  hypothetical protein  47.83 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2732  hypothetical protein  40.48 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4886  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.44 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240403  normal  0.615803 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1845  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.03 
 
 		 287 aa  191  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.278563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3061  hypothetical protein  40.92 
 
 		 289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.608952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4436  hypothetical protein  46.46 
 
 		 332 aa  189  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785068 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3085  hypothetical protein  41.25 
 
 		 289 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2949  hypothetical protein  40.14 
 
 		 288 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0746  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.51 
 
 		 320 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3728  hypothetical protein  43.28 
 
 		 315 aa  186  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3086  hypothetical protein  42.36 
 
 		 300 aa  186  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0969  hypothetical protein  42.7 
 
 		 290 aa  185  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4235  hypothetical protein  42.17 
 
 		 318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2662  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.79 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2334  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.21 
 
 		 287 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0523768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2456  hypothetical protein  40.2 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0402  hypothetical protein  41.53 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0259  hypothetical protein  39.29 
 
 		 286 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48150  hypothetical protein  41.87 
 
 		 287 aa  179  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1783  drug/metabolite family efflux pump  44.95 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000148908 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2052  hypothetical protein  41.48 
 
 		 288 aa  176  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0282096  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0254  hypothetical protein  39.73 
 
 		 290 aa  176  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.663739  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0264  hypothetical protein  44.19 
 
 		 295 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2213  hypothetical protein  41.94 
 
 		 308 aa  175  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139395  normal  0.292035 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4837  hypothetical protein  40.78 
 
 		 284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1893  hypothetical protein  40.82 
 
 		 285 aa  172  6.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0914  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.81 
 
 		 287 aa  168  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.583051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1140  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.03 
 
 		 301 aa  167  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113288 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1891  hypothetical protein  41.52 
 
 		 287 aa  165  9e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.829047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7474  putative inner membrane transport protein of unknown function  43.53 
 
 		 286 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.450113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2148  transporter of the DMT superfamily  40.56 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4219  hypothetical protein  43.43 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4589  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.03 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0052  hypothetical protein  35.86 
 
 		 301 aa  155  8e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3989  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.03 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4736  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.49 
 
 		 296 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0137287 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.59 
 
 		 299 aa  145  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00112924  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2011  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.21 
 
 		 284 aa  132  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.87899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0637  hypothetical protein  32.99 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1075  hypothetical protein  42.59 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00290318 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.34 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.593978  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  31.6 
 
 		 286 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  29.39 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  33.17 
 
 		 402 aa  53.5  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  30.92 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.55 
 
 		 292 aa  50.8  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.17 
 
 		 286 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  32.76 
 
 		 308 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  28.62 
 
 		 286 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.49 
 
 		 290 aa  49.7  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  30.05 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  26.87 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  29.76 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.58 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.36 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  27.21 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  33.66 
 
 		 353 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  33.66 
 
 		 356 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.69 
 
 		 314 aa  46.2  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  33.66 
 
 		 356 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  29.44 
 
 		 303 aa  46.6  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  29.18 
 
 		 314 aa  46.2  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>