111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4589 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4589  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
295 aa  553  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4219  hypothetical protein  97.97 
 
 
295 aa  449  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4736  protein of unknown function DUF6 transmembrane  86.82 
 
 
296 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0137287 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4095  hypothetical protein  64.44 
 
 
286 aa  345  4e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3554  hypothetical protein  62.8 
 
 
297 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4837  hypothetical protein  65.71 
 
 
284 aa  329  3e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2662  protein of unknown function DUF6 transmembrane  66.43 
 
 
287 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301286  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3086  hypothetical protein  61.82 
 
 
300 aa  323  3e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0254  hypothetical protein  68.35 
 
 
290 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.663739  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2334  protein of unknown function DUF6 transmembrane  66.79 
 
 
287 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0523768  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3724  hypothetical protein  67.25 
 
 
295 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.212991 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2732  hypothetical protein  61.89 
 
 
289 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3085  hypothetical protein  62.24 
 
 
289 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48150  hypothetical protein  62.94 
 
 
287 aa  313  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3061  hypothetical protein  60.84 
 
 
289 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.608952  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2949  hypothetical protein  61.89 
 
 
288 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0969  hypothetical protein  63.79 
 
 
290 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4790  hypothetical protein  64.79 
 
 
295 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.430049  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4264  hypothetical protein  64.44 
 
 
295 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0105351 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2052  hypothetical protein  62.24 
 
 
288 aa  305  5.0000000000000004e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0282096  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2978  conserved hypothetical protein membrane protein  61.27 
 
 
287 aa  305  5.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3482  hypothetical protein  65.85 
 
 
295 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4884  hypothetical protein  65.85 
 
 
295 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951172  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5402  hypothetical protein  65.85 
 
 
295 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1845  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.54 
 
 
287 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.278563 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4886  protein of unknown function DUF6 transmembrane  66.54 
 
 
295 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240403  normal  0.615803 
 
 
-
 
NC_004310  BR1893  hypothetical protein  65 
 
 
285 aa  296  3e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1783  drug/metabolite family efflux pump  67.48 
 
 
295 aa  292  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000148908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0914  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.08 
 
 
287 aa  292  4e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.583051  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1891  hypothetical protein  63.29 
 
 
287 aa  288  9e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.829047  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0829  hypothetical protein  64.44 
 
 
295 aa  286  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0472723 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7474  putative inner membrane transport protein of unknown function  62.86 
 
 
286 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.450113 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0259  hypothetical protein  55.9 
 
 
286 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6291  hypothetical protein  62.09 
 
 
305 aa  276  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0524409  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7209  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.57 
 
 
298 aa  268  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266487  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0264  hypothetical protein  58.7 
 
 
295 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2116  hypothetical protein  42.96 
 
 
301 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363277  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2386  hypothetical protein  43.36 
 
 
302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2268  hypothetical protein  43.36 
 
 
302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0917  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.08 
 
 
312 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5689  hypothetical protein  43.01 
 
 
302 aa  199  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0929  hypothetical protein  43.36 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50488  normal  0.616383 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.75 
 
 
312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0199053  normal  0.550765 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2371  hypothetical protein  42.31 
 
 
302 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1738  hypothetical protein  42.31 
 
 
302 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2350  hypothetical protein  42.31 
 
 
302 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2347  hypothetical protein  49.44 
 
 
330 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3540  hypothetical protein  45.13 
 
 
308 aa  188  9e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216262 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1302  hypothetical protein  43.48 
 
 
304 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.730648  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0952  hypothetical protein  45 
 
 
302 aa  188  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0987  hypothetical protein  47.74 
 
 
313 aa  187  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.0533863 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1315  integral membrane protein, DUF6  45.36 
 
 
302 aa  185  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349562  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1951  hypothetical protein  45.36 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1002  hypothetical protein  45.36 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0862  hypothetical protein  45.36 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1164  integral membrane protein  45.36 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.766304  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0286  hypothetical protein  45.36 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1155  integral membrane protein  45.36 
 
 
302 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3728  hypothetical protein  44.48 
 
 
315 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2511  hypothetical protein  49.24 
 
 
327 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0637  hypothetical protein  41.91 
 
 
300 aa  179  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2456  hypothetical protein  44.79 
 
 
312 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4235  hypothetical protein  44.6 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4436  hypothetical protein  48.25 
 
 
332 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.785068 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0184  hypothetical protein  42.76 
 
 
313 aa  170  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.482363  normal  0.823558 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.55 
 
 
314 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.594073  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0402  hypothetical protein  44.21 
 
 
311 aa  169  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1638  hypothetical protein  36.9 
 
 
298 aa  163  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2611  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0746  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.24 
 
 
320 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2148  transporter of the DMT superfamily  41.72 
 
 
316 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3844  hypothetical protein  46.26 
 
 
314 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1140  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.83 
 
 
301 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.32 
 
 
299 aa  155  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00112924  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3989  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.93 
 
 
306 aa  150  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2213  hypothetical protein  39.26 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139395  normal  0.292035 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0052  hypothetical protein  39.71 
 
 
301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2011  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.65 
 
 
284 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.87899  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1075  hypothetical protein  44.21 
 
 
317 aa  132  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00290318 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0515  hypothetical protein  31.05 
 
 
301 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  22.22 
 
 
303 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  21.79 
 
 
303 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  30.66 
 
 
294 aa  50.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  30.99 
 
 
322 aa  49.7  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.04 
 
 
282 aa  49.7  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.593978  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  28.99 
 
 
299 aa  49.7  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.41 
 
 
314 aa  48.9  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  21.37 
 
 
303 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  20.26 
 
 
303 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.88 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  29.55 
 
 
325 aa  46.6  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  24.17 
 
 
315 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  22.69 
 
 
304 aa  46.2  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  21.37 
 
 
303 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  21.79 
 
 
303 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  29.25 
 
 
301 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  20.94 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  26.24 
 
 
287 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.05 
 
 
305 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.05 
 
 
305 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.94 
 
 
312 aa  45.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>