111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2052 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2052  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  558  1e-158  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0282096  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3061  hypothetical protein  77.43 
 
 		 289 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.608952  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2949  hypothetical protein  75.69 
 
 		 288 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2732  hypothetical protein  75.69 
 
 		 289 aa  407  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3085  hypothetical protein  76.39 
 
 		 289 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48150  hypothetical protein  73.87 
 
 		 287 aa  396  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1891  hypothetical protein  79.37 
 
 		 287 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.829047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4095  hypothetical protein  67.48 
 
 		 286 aa  380  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3554  hypothetical protein  69.37 
 
 		 297 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2334  protein of unknown function DUF6 transmembrane  69.58 
 
 		 287 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0523768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2662  protein of unknown function DUF6 transmembrane  69.58 
 
 		 287 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0914  protein of unknown function DUF6 transmembrane  70.28 
 
 		 287 aa  366  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.583051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0259  hypothetical protein  67.37 
 
 		 286 aa  362  3e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0969  hypothetical protein  68.53 
 
 		 290 aa  348  5e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1845  protein of unknown function DUF6 transmembrane  66.2 
 
 		 287 aa  345  4e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.278563 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2978  conserved hypothetical protein membrane protein  63.73 
 
 		 287 aa  335  5e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1893  hypothetical protein  66.9 
 
 		 285 aa  335  7e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4790  hypothetical protein  65.8 
 
 		 295 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.430049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4264  hypothetical protein  65.8 
 
 		 295 aa  332  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0105351 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3724  hypothetical protein  63.76 
 
 		 295 aa  331  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.212991 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4837  hypothetical protein  63.6 
 
 		 284 aa  328  8e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0254  hypothetical protein  64.56 
 
 		 290 aa  325  6e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.663739  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3482  hypothetical protein  65.51 
 
 		 295 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4884  hypothetical protein  65.51 
 
 		 295 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5402  hypothetical protein  65.51 
 
 		 295 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4886  protein of unknown function DUF6 transmembrane  65.19 
 
 		 295 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240403  normal  0.615803 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0829  hypothetical protein  64.46 
 
 		 295 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0472723 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3086  hypothetical protein  56.84 
 
 		 300 aa  301  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1783  drug/metabolite family efflux pump  65.03 
 
 		 295 aa  296  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000148908 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7474  putative inner membrane transport protein of unknown function  61.19 
 
 		 286 aa  285  9e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.450113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4736  protein of unknown function DUF6 transmembrane  66.26 
 
 		 296 aa  275  6e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0137287 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4589  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.14 
 
 		 295 aa  275  8e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4219  hypothetical protein  64.54 
 
 		 295 aa  275  9e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0264  hypothetical protein  59.18 
 
 		 295 aa  267  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7209  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.12 
 
 		 298 aa  267  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266487  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6291  hypothetical protein  56.68 
 
 		 305 aa  260  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0524409  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.88 
 
 		 312 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0199053  normal  0.550765 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0917  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.88 
 
 		 312 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2116  hypothetical protein  43.4 
 
 		 301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363277  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2347  hypothetical protein  47.96 
 
 		 330 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2511  hypothetical protein  46.27 
 
 		 327 aa  199  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5689  hypothetical protein  42.22 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0929  hypothetical protein  42.59 
 
 		 302 aa  193  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50488  normal  0.616383 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0987  hypothetical protein  43.92 
 
 		 313 aa  192  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.0533863 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1738  hypothetical protein  41.48 
 
 		 302 aa  188  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2350  hypothetical protein  41.48 
 
 		 302 aa  188  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2371  hypothetical protein  41.48 
 
 		 302 aa  188  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1302  hypothetical protein  42.22 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.730648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2386  hypothetical protein  41.33 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2268  hypothetical protein  41.33 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1315  integral membrane protein, DUF6  41.9 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349562  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0952  hypothetical protein  42.96 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1951  hypothetical protein  42.96 
 
 		 302 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1002  hypothetical protein  42.96 
 
 		 302 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0862  hypothetical protein  42.96 
 
 		 302 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1164  integral membrane protein  42.96 
 
 		 302 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.766304  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0286  hypothetical protein  42.96 
 
 		 302 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1155  integral membrane protein  41.9 
 
 		 302 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0184  hypothetical protein  44.48 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.482363  normal  0.823558 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2213  hypothetical protein  40.75 
 
 		 308 aa  176  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139395  normal  0.292035 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1638  hypothetical protein  39.85 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2611  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3540  hypothetical protein  42.03 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216262 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0402  hypothetical protein  41.78 
 
 		 311 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4436  hypothetical protein  45.14 
 
 		 332 aa  169  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785068 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.24 
 
 		 314 aa  169  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.594073  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2456  hypothetical protein  42.25 
 
 		 312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0746  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.18 
 
 		 320 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0637  hypothetical protein  38.38 
 
 		 300 aa  166  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2148  transporter of the DMT superfamily  38.69 
 
 		 316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3989  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.38 
 
 		 306 aa  161  9e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3728  hypothetical protein  40.67 
 
 		 315 aa  161  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3844  hypothetical protein  43.17 
 
 		 314 aa  159  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4235  hypothetical protein  40.49 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1140  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.7 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.82 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00112924  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0052  hypothetical protein  38.27 
 
 		 301 aa  129  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2011  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.92 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.87899  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1075  hypothetical protein  40.74 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00290318 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.4 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.593978  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.38 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  21.85 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  20.82 
 
 		 299 aa  53.1  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  26.15 
 
 		 287 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.68 
 
 		 300 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  23.12 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  24.29 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.4 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  25.51 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  26.12 
 
 		 286 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  20.52 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0610  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.29 
 
 		 313 aa  46.6  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.371435  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3388  hypothetical protein  26.17 
 
 		 321 aa  46.2  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  26.69 
 
 		 330 aa  46.2  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  22.92 
 
 		 303 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 		 286 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  23.48 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  27.64 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  23.48 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  23.48 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  26.2 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309026 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>