139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0184 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0184  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  594  1e-169  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.482363  normal  0.823558 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3540  hypothetical protein  63.21 
 
 		 308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216262 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4235  hypothetical protein  61.06 
 
 		 318 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0402  hypothetical protein  60 
 
 		 311 aa  301  8.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0746  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.05 
 
 		 320 aa  298  7e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3728  hypothetical protein  58.02 
 
 		 315 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.93 
 
 		 314 aa  269  4e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.594073  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4436  hypothetical protein  57.38 
 
 		 332 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785068 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3844  hypothetical protein  59.32 
 
 		 314 aa  260  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.15 
 
 		 312 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0199053  normal  0.550765 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0917  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.25 
 
 		 312 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2371  hypothetical protein  45.95 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5689  hypothetical protein  45.67 
 
 		 302 aa  225  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1738  hypothetical protein  45.61 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2350  hypothetical protein  45.61 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0929  hypothetical protein  44.59 
 
 		 302 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50488  normal  0.616383 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2386  hypothetical protein  44.59 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2268  hypothetical protein  44.59 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2116  hypothetical protein  43.29 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363277  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0987  hypothetical protein  46.47 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.0533863 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0952  hypothetical protein  46.62 
 
 		 302 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1315  integral membrane protein, DUF6  46.28 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349562  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1951  hypothetical protein  46.28 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1002  hypothetical protein  46.28 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0862  hypothetical protein  46.28 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1164  integral membrane protein  46.28 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.766304  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0286  hypothetical protein  46.28 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1155  integral membrane protein  46.28 
 
 		 302 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2732  hypothetical protein  46.48 
 
 		 289 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1302  hypothetical protein  43.69 
 
 		 304 aa  203  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.730648  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2949  hypothetical protein  45.55 
 
 		 288 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4095  hypothetical protein  42.96 
 
 		 286 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0259  hypothetical protein  46.69 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3085  hypothetical protein  45.55 
 
 		 289 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3061  hypothetical protein  44.48 
 
 		 289 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.608952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2511  hypothetical protein  44.44 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2347  hypothetical protein  43.73 
 
 		 330 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3554  hypothetical protein  42.56 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4790  hypothetical protein  46.74 
 
 		 295 aa  185  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.430049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2052  hypothetical protein  44.48 
 
 		 288 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0282096  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1845  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.59 
 
 		 287 aa  183  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.278563 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4264  hypothetical protein  46.77 
 
 		 295 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0105351 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4886  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.45 
 
 		 295 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240403  normal  0.615803 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5402  hypothetical protein  47.89 
 
 		 295 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3482  hypothetical protein  47.89 
 
 		 295 aa  178  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4884  hypothetical protein  47.89 
 
 		 295 aa  178  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3724  hypothetical protein  43.69 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.212991 
 
 
-
 
NC_004310  BR1893  hypothetical protein  43.61 
 
 		 285 aa  175  7e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3086  hypothetical protein  42.81 
 
 		 300 aa  176  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0969  hypothetical protein  43.23 
 
 		 290 aa  172  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1638  hypothetical protein  37.71 
 
 		 298 aa  172  6.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2611  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6291  hypothetical protein  45.56 
 
 		 305 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0524409  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1783  drug/metabolite family efflux pump  47.06 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000148908 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0829  hypothetical protein  47.98 
 
 		 295 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0472723 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2978  conserved hypothetical protein membrane protein  40.88 
 
 		 287 aa  169  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7209  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.04 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266487  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48150  hypothetical protein  43.99 
 
 		 287 aa  164  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2662  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.25 
 
 		 287 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2334  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.92 
 
 		 287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0523768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0254  hypothetical protein  42.5 
 
 		 290 aa  162  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.663739  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2456  hypothetical protein  43.77 
 
 		 312 aa  162  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2213  hypothetical protein  40.29 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139395  normal  0.292035 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0914  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.15 
 
 		 287 aa  159  7e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.583051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4837  hypothetical protein  43.42 
 
 		 284 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1891  hypothetical protein  46.88 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.829047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2148  transporter of the DMT superfamily  40.67 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3989  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.41 
 
 		 306 aa  149  7e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4589  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.27 
 
 		 295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4736  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.18 
 
 		 296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0137287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4219  hypothetical protein  45.53 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0264  hypothetical protein  42.65 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0052  hypothetical protein  36.88 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.05 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00112924  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1140  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.96 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7474  putative inner membrane transport protein of unknown function  39.18 
 
 		 286 aa  129  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.450113 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2011  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.93 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.87899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0637  hypothetical protein  35.59 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1075  hypothetical protein  43.59 
 
 		 317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00290318 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.24 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.56 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.593978  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.48 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2900  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.92 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.554893  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.29 
 
 		 286 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.58 
 
 		 305 aa  53.9  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1915  putative transmembrane protein  32.34 
 
 		 284 aa  52.8  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827932  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  29.19 
 
 		 297 aa  52.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  28.21 
 
 		 319 aa  52.8  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  26.15 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  29.3 
 
 		 302 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  29.3 
 
 		 302 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  28.93 
 
 		 287 aa  50.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.62 
 
 		 306 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.97 
 
 		 301 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  27.44 
 
 		 333 aa  49.3  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.17 
 
 		 301 aa  49.3  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.1 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  29.44 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  26.88 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  31.58 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.98 
 
 		 315 aa  48.5  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>