113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1155 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1155  integral membrane protein  100 
 
 
302 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1951  hypothetical protein  99.34 
 
 
302 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121613  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1315  integral membrane protein, DUF6  99.01 
 
 
302 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349562  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1002  hypothetical protein  99.34 
 
 
302 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0862  hypothetical protein  99.34 
 
 
302 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1164  integral membrane protein  99.01 
 
 
302 aa  567  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.766304  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0286  hypothetical protein  99.34 
 
 
302 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0952  hypothetical protein  95.02 
 
 
302 aa  527  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1738  hypothetical protein  86.71 
 
 
302 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2350  hypothetical protein  86.71 
 
 
302 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0929  hypothetical protein  87.38 
 
 
302 aa  512  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50488  normal  0.616383 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2371  hypothetical protein  86.71 
 
 
302 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5689  hypothetical protein  86.05 
 
 
302 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2386  hypothetical protein  86.05 
 
 
302 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2268  hypothetical protein  86.38 
 
 
302 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2116  hypothetical protein  80.67 
 
 
301 aa  471  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363277  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1302  hypothetical protein  69.8 
 
 
304 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.730648  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0917  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.01 
 
 
312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.01 
 
 
312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0199053  normal  0.550765 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2347  hypothetical protein  55.25 
 
 
330 aa  251  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0987  hypothetical protein  52.01 
 
 
313 aa  243  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.0533863 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2511  hypothetical protein  54.58 
 
 
327 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3554  hypothetical protein  45.83 
 
 
297 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3482  hypothetical protein  50 
 
 
295 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4884  hypothetical protein  50 
 
 
295 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951172  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4790  hypothetical protein  48.15 
 
 
295 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.430049  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0184  hypothetical protein  45.39 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.482363  normal  0.823558 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5402  hypothetical protein  50 
 
 
295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3724  hypothetical protein  47.52 
 
 
295 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.212991 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4095  hypothetical protein  45.77 
 
 
286 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4264  hypothetical protein  47.78 
 
 
295 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0105351 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0829  hypothetical protein  48.89 
 
 
295 aa  206  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0472723 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.33 
 
 
314 aa  202  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.594073  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3540  hypothetical protein  45.45 
 
 
308 aa  201  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216262 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2978  conserved hypothetical protein membrane protein  43.1 
 
 
287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3086  hypothetical protein  45.14 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1638  hypothetical protein  40.96 
 
 
298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2611  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2732  hypothetical protein  43.45 
 
 
289 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6291  hypothetical protein  48.87 
 
 
305 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0524409  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4886  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.82 
 
 
295 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240403  normal  0.615803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7209  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.61 
 
 
298 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266487  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1845  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.56 
 
 
287 aa  192  7e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.278563 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3844  hypothetical protein  49.16 
 
 
314 aa  190  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3085  hypothetical protein  44.57 
 
 
289 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3061  hypothetical protein  44.19 
 
 
289 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.608952  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2662  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.02 
 
 
287 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301286  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2949  hypothetical protein  42.76 
 
 
288 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2456  hypothetical protein  41.89 
 
 
312 aa  186  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4436  hypothetical protein  48.16 
 
 
332 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.785068 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3728  hypothetical protein  44.9 
 
 
315 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1783  drug/metabolite family efflux pump  47.4 
 
 
295 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000148908 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2334  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.02 
 
 
287 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0523768  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48150  hypothetical protein  41.92 
 
 
287 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0969  hypothetical protein  43.82 
 
 
290 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2052  hypothetical protein  42.96 
 
 
288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0282096  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0254  hypothetical protein  42.61 
 
 
290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.663739  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0746  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.1 
 
 
320 aa  179  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2213  hypothetical protein  43.91 
 
 
308 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139395  normal  0.292035 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4235  hypothetical protein  43.27 
 
 
318 aa  179  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4837  hypothetical protein  43.21 
 
 
284 aa  178  8e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0259  hypothetical protein  40.36 
 
 
286 aa  178  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0402  hypothetical protein  42.86 
 
 
311 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0914  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.3 
 
 
287 aa  176  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.583051  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0264  hypothetical protein  45.21 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1140  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.83 
 
 
301 aa  172  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113288 
 
 
-
 
NC_004310  BR1893  hypothetical protein  41.57 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2148  transporter of the DMT superfamily  41.96 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0052  hypothetical protein  38.97 
 
 
301 aa  164  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7474  putative inner membrane transport protein of unknown function  42.81 
 
 
286 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.450113 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1891  hypothetical protein  41.92 
 
 
287 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.829047  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.34 
 
 
299 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00112924  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3989  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.84 
 
 
306 aa  156  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4219  hypothetical protein  45.82 
 
 
295 aa  156  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4589  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.82 
 
 
295 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4736  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.12 
 
 
296 aa  150  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0137287 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2011  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.21 
 
 
284 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.87899  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0637  hypothetical protein  33.68 
 
 
300 aa  132  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1075  hypothetical protein  41.64 
 
 
317 aa  122  9e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00290318 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.78 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.593978  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0346  hypothetical protein  33.93 
 
 
302 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  31.72 
 
 
286 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.74 
 
 
314 aa  49.7  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  30.37 
 
 
309 aa  49.3  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.18 
 
 
292 aa  49.3  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  29.91 
 
 
309 aa  49.3  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  31.55 
 
 
397 aa  49.3  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  33.04 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  32.09 
 
 
402 aa  47.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  30.41 
 
 
303 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.77 
 
 
290 aa  47  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  30.7 
 
 
294 aa  46.6  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  28.68 
 
 
318 aa  46.2  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2202  membrane protein  24.62 
 
 
296 aa  45.8  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337301  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  28.5 
 
 
309 aa  45.8  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  28.5 
 
 
309 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  28.5 
 
 
309 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.97 
 
 
286 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2716  hypothetical protein  37.12 
 
 
329 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.596336  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  29.39 
 
 
286 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  28.5 
 
 
309 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>