130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2949 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2949  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2732  hypothetical protein  96.18 
 
 		 289 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3085  hypothetical protein  90.97 
 
 		 289 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3061  hypothetical protein  89.93 
 
 		 289 aa  494  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.608952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2052  hypothetical protein  75.69 
 
 		 288 aa  396  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0282096  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48150  hypothetical protein  71.18 
 
 		 287 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4095  hypothetical protein  65.97 
 
 		 286 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1891  hypothetical protein  73.61 
 
 		 287 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.829047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3554  hypothetical protein  66.32 
 
 		 297 aa  364  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2662  protein of unknown function DUF6 transmembrane  67.01 
 
 		 287 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2334  protein of unknown function DUF6 transmembrane  66.67 
 
 		 287 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0523768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0914  protein of unknown function DUF6 transmembrane  71.18 
 
 		 287 aa  352  4e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.583051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0259  hypothetical protein  65.16 
 
 		 286 aa  347  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1845  protein of unknown function DUF6 transmembrane  63.54 
 
 		 287 aa  338  4e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.278563 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3086  hypothetical protein  62.02 
 
 		 300 aa  331  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4264  hypothetical protein  65.68 
 
 		 295 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0105351 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4790  hypothetical protein  65.68 
 
 		 295 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.430049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4837  hypothetical protein  65.03 
 
 		 284 aa  328  8e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2978  conserved hypothetical protein membrane protein  61.54 
 
 		 287 aa  326  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3724  hypothetical protein  63.89 
 
 		 295 aa  326  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.212991 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0969  hypothetical protein  62.94 
 
 		 290 aa  323  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3482  hypothetical protein  64.93 
 
 		 295 aa  321  7e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4884  hypothetical protein  64.93 
 
 		 295 aa  321  7e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5402  hypothetical protein  64.93 
 
 		 295 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0254  hypothetical protein  63.73 
 
 		 290 aa  320  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.663739  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4886  protein of unknown function DUF6 transmembrane  66.32 
 
 		 295 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240403  normal  0.615803 
 
 
-
 
NC_004310  BR1893  hypothetical protein  63.89 
 
 		 285 aa  315  4e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0829  hypothetical protein  64.24 
 
 		 295 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0472723 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1783  drug/metabolite family efflux pump  66.67 
 
 		 295 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000148908 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7474  putative inner membrane transport protein of unknown function  61.81 
 
 		 286 aa  286  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.450113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4736  protein of unknown function DUF6 transmembrane  66.13 
 
 		 296 aa  267  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0137287 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4589  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64 
 
 		 295 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4219  hypothetical protein  64 
 
 		 295 aa  266  4e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7209  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.03 
 
 		 298 aa  261  6e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266487  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6291  hypothetical protein  55.63 
 
 		 305 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0524409  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0264  hypothetical protein  54.86 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2116  hypothetical protein  45.19 
 
 		 301 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363277  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.5 
 
 		 312 aa  208  8e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0199053  normal  0.550765 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0917  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.8 
 
 		 312 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5689  hypothetical protein  41.16 
 
 		 302 aa  201  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2347  hypothetical protein  48.3 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0929  hypothetical protein  41.16 
 
 		 302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50488  normal  0.616383 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2386  hypothetical protein  41.16 
 
 		 302 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2268  hypothetical protein  41.16 
 
 		 302 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2371  hypothetical protein  40.14 
 
 		 302 aa  195  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1302  hypothetical protein  42.16 
 
 		 304 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.730648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1738  hypothetical protein  40.14 
 
 		 302 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2350  hypothetical protein  40.14 
 
 		 302 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2511  hypothetical protein  47.15 
 
 		 327 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0184  hypothetical protein  44.13 
 
 		 313 aa  192  8e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.482363  normal  0.823558 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0952  hypothetical protein  43.79 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0987  hypothetical protein  46.18 
 
 		 313 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.0533863 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1315  integral membrane protein, DUF6  42.76 
 
 		 302 aa  188  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349562  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1951  hypothetical protein  42.76 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1002  hypothetical protein  42.76 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0862  hypothetical protein  42.76 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0286  hypothetical protein  42.76 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1155  integral membrane protein  42.76 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1164  integral membrane protein  42.76 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.766304  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3989  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.46 
 
 		 306 aa  176  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2456  hypothetical protein  43.73 
 
 		 312 aa  175  8e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2213  hypothetical protein  41.44 
 
 		 308 aa  175  9e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139395  normal  0.292035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2148  transporter of the DMT superfamily  40.14 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4436  hypothetical protein  45.26 
 
 		 332 aa  169  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785068 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0402  hypothetical protein  43.07 
 
 		 311 aa  169  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0746  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.04 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.44 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.594073  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3540  hypothetical protein  42.35 
 
 		 308 aa  166  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216262 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4235  hypothetical protein  40.21 
 
 		 318 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0637  hypothetical protein  39.79 
 
 		 300 aa  166  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1638  hypothetical protein  38.06 
 
 		 298 aa  165  9e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2611  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3728  hypothetical protein  38.41 
 
 		 315 aa  159  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1140  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.59 
 
 		 301 aa  155  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113288 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3844  hypothetical protein  43.3 
 
 		 314 aa  153  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.66 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00112924  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1075  hypothetical protein  43.53 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00290318 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2011  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.85 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.87899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0052  hypothetical protein  34.53 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.6 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.593978  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  28.46 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.42 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.26 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.26 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  26.35 
 
 		 300 aa  52.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  24.81 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  29.71 
 
 		 304 aa  50.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  25.31 
 
 		 303 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  23.43 
 
 		 303 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.66 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0439  hypothetical protein  25.8 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  27.56 
 
 		 286 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  28.57 
 
 		 326 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0694  hypothetical protein  26.51 
 
 		 313 aa  46.2  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  25.13 
 
 		 305 aa  46.2  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4244  PecM protein  32.08 
 
 		 335 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  24.9 
 
 		 303 aa  46.2  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2469  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.54 
 
 		 293 aa  45.8  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  28.57 
 
 		 294 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.13 
 
 		 286 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.79 
 
 		 314 aa  45.8  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>