119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7209 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7209  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 298 aa  554  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266487  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6291  hypothetical protein  88.09 
 
 		 305 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0524409  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3724  hypothetical protein  63.18 
 
 		 295 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.212991 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3554  hypothetical protein  57.44 
 
 		 297 aa  299  5e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2334  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.65 
 
 		 287 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0523768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4790  hypothetical protein  61.73 
 
 		 295 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.430049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4095  hypothetical protein  57.54 
 
 		 286 aa  295  9e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0969  hypothetical protein  60.65 
 
 		 290 aa  294  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2662  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.93 
 
 		 287 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4264  hypothetical protein  61.37 
 
 		 295 aa  292  6e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0105351 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3482  hypothetical protein  62.82 
 
 		 295 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4884  hypothetical protein  62.82 
 
 		 295 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5402  hypothetical protein  62.82 
 
 		 295 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4886  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.82 
 
 		 295 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240403  normal  0.615803 
 
 
-
 
NC_004310  BR1893  hypothetical protein  59.21 
 
 		 285 aa  282  4.0000000000000003e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1845  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.43 
 
 		 287 aa  281  1e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.278563 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0829  hypothetical protein  63.18 
 
 		 295 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0472723 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1891  hypothetical protein  63.9 
 
 		 287 aa  279  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.829047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3086  hypothetical protein  56.12 
 
 		 300 aa  278  8e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2978  conserved hypothetical protein membrane protein  57.45 
 
 		 287 aa  277  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48150  hypothetical protein  59.93 
 
 		 287 aa  276  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2052  hypothetical protein  58.12 
 
 		 288 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0282096  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3085  hypothetical protein  57.04 
 
 		 289 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2949  hypothetical protein  55.28 
 
 		 288 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1783  drug/metabolite family efflux pump  63.9 
 
 		 295 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000148908 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4837  hypothetical protein  57.04 
 
 		 284 aa  267  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0914  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.48 
 
 		 287 aa  265  5e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.583051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2732  hypothetical protein  54.23 
 
 		 289 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3061  hypothetical protein  54.58 
 
 		 289 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.608952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0264  hypothetical protein  61.11 
 
 		 295 aa  254  8e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0259  hypothetical protein  50.7 
 
 		 286 aa  253  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0254  hypothetical protein  56.36 
 
 		 290 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.663739  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4219  hypothetical protein  58.95 
 
 		 295 aa  241  9e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7474  putative inner membrane transport protein of unknown function  56.68 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.450113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4589  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.57 
 
 		 295 aa  238  9e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4736  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.23 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0137287 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0917  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.49 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.15 
 
 		 312 aa  222  6e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0199053  normal  0.550765 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5689  hypothetical protein  49.29 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0929  hypothetical protein  48.42 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50488  normal  0.616383 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2371  hypothetical protein  47.22 
 
 		 302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1738  hypothetical protein  47.22 
 
 		 302 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2350  hypothetical protein  47.22 
 
 		 302 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2268  hypothetical protein  48.94 
 
 		 302 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2386  hypothetical protein  48.59 
 
 		 302 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0952  hypothetical protein  49.29 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2511  hypothetical protein  48.57 
 
 		 327 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2116  hypothetical protein  46.59 
 
 		 301 aa  205  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363277  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0987  hypothetical protein  49.15 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.0533863 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1315  integral membrane protein, DUF6  47.57 
 
 		 302 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349562  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1164  integral membrane protein  48.93 
 
 		 302 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.766304  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1951  hypothetical protein  48.93 
 
 		 302 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1002  hypothetical protein  48.93 
 
 		 302 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0862  hypothetical protein  48.93 
 
 		 302 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0286  hypothetical protein  48.93 
 
 		 302 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1155  integral membrane protein  48.93 
 
 		 302 aa  202  8e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2347  hypothetical protein  46.86 
 
 		 330 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3540  hypothetical protein  46.95 
 
 		 308 aa  195  9e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216262 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2213  hypothetical protein  47.13 
 
 		 308 aa  193  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139395  normal  0.292035 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1638  hypothetical protein  39.64 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2611  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1302  hypothetical protein  42.81 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.730648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0637  hypothetical protein  41.18 
 
 		 300 aa  176  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2148  transporter of the DMT superfamily  43.21 
 
 		 316 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4436  hypothetical protein  44.18 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785068 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0184  hypothetical protein  44.48 
 
 		 313 aa  169  6e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.482363  normal  0.823558 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.36 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00112924  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3728  hypothetical protein  43.27 
 
 		 315 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0402  hypothetical protein  42.7 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.96 
 
 		 314 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.594073  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3989  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.48 
 
 		 306 aa  155  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2456  hypothetical protein  41.58 
 
 		 312 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0746  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.26 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3844  hypothetical protein  44.93 
 
 		 314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4235  hypothetical protein  41.36 
 
 		 318 aa  149  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1140  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.04 
 
 		 301 aa  149  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113288 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1075  hypothetical protein  44.49 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00290318 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2011  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.22 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.87899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0052  hypothetical protein  35.11 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.66 
 
 		 282 aa  75.5  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.593978  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  30.57 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.21 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.56 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  29.5 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  31.34 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.29 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  26.35 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.33 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  31.15 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.25 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.25 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  30.45 
 
 		 316 aa  53.9  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.45 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  26.21 
 
 		 303 aa  53.5  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  25.61 
 
 		 303 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  25.4 
 
 		 303 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.04 
 
 		 349 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.97 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  24.9 
 
 		 287 aa  50.8  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  25.61 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>