171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1140 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1140  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
301 aa  560  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113288 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2456  hypothetical protein  76.71 
 
 
312 aa  382  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3989  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.14 
 
 
306 aa  283  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0917  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.08 
 
 
312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.08 
 
 
312 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0199053  normal  0.550765 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4095  hypothetical protein  43.84 
 
 
286 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3554  hypothetical protein  44.93 
 
 
297 aa  199  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1302  hypothetical protein  46.28 
 
 
304 aa  195  7e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.730648  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2116  hypothetical protein  46.74 
 
 
301 aa  195  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363277  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0952  hypothetical protein  46.76 
 
 
302 aa  193  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.4 
 
 
314 aa  192  7e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.594073  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2371  hypothetical protein  44.03 
 
 
302 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1738  hypothetical protein  45.29 
 
 
302 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2350  hypothetical protein  45.29 
 
 
302 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4886  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.2 
 
 
295 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240403  normal  0.615803 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2386  hypothetical protein  46.21 
 
 
302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1951  hypothetical protein  47.83 
 
 
302 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121613  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2268  hypothetical protein  46.21 
 
 
302 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1002  hypothetical protein  47.83 
 
 
302 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0862  hypothetical protein  47.83 
 
 
302 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1164  integral membrane protein  47.83 
 
 
302 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.766304  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0286  hypothetical protein  47.83 
 
 
302 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1155  integral membrane protein  47.83 
 
 
302 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2949  hypothetical protein  43.01 
 
 
288 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1315  integral membrane protein, DUF6  47.46 
 
 
302 aa  188  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349562  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2347  hypothetical protein  49.43 
 
 
330 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2511  hypothetical protein  48.75 
 
 
327 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2732  hypothetical protein  42.65 
 
 
289 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0987  hypothetical protein  46.28 
 
 
313 aa  187  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.0533863 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0929  hypothetical protein  46.57 
 
 
302 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50488  normal  0.616383 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3844  hypothetical protein  51.85 
 
 
314 aa  186  6e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1845  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.13 
 
 
287 aa  186  6e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.278563 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2334  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.52 
 
 
287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0523768  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5689  hypothetical protein  45.13 
 
 
302 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2662  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.88 
 
 
287 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301286  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2978  conserved hypothetical protein membrane protein  41.32 
 
 
287 aa  182  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3085  hypothetical protein  41.26 
 
 
289 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3540  hypothetical protein  45.72 
 
 
308 aa  181  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216262 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4790  hypothetical protein  47.1 
 
 
295 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.430049  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4264  hypothetical protein  47.1 
 
 
295 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0105351 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3724  hypothetical protein  47.86 
 
 
295 aa  179  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.212991 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3061  hypothetical protein  40.56 
 
 
289 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.608952  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48150  hypothetical protein  43.86 
 
 
287 aa  179  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7209  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.88 
 
 
298 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266487  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0914  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.38 
 
 
287 aa  179  5.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.583051  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3728  hypothetical protein  46.67 
 
 
315 aa  179  7e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0254  hypothetical protein  46.59 
 
 
290 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.663739  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3086  hypothetical protein  43.48 
 
 
300 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2148  transporter of the DMT superfamily  45.32 
 
 
316 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0969  hypothetical protein  44.83 
 
 
290 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2052  hypothetical protein  41.7 
 
 
288 aa  176  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0282096  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0746  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.74 
 
 
320 aa  176  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0402  hypothetical protein  47.86 
 
 
311 aa  175  9e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5402  hypothetical protein  47.49 
 
 
295 aa  175  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0829  hypothetical protein  47.95 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0472723 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4235  hypothetical protein  48.93 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3482  hypothetical protein  47.49 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4884  hypothetical protein  47.49 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951172  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4837  hypothetical protein  43.84 
 
 
284 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1893  hypothetical protein  44.36 
 
 
285 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1783  drug/metabolite family efflux pump  50.2 
 
 
295 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000148908 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0259  hypothetical protein  40.58 
 
 
286 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0184  hypothetical protein  44.96 
 
 
313 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.482363  normal  0.823558 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1891  hypothetical protein  43.9 
 
 
287 aa  169  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.829047  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6291  hypothetical protein  47.21 
 
 
305 aa  168  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0524409  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7474  putative inner membrane transport protein of unknown function  45.16 
 
 
286 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.450113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.73 
 
 
299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00112924  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0264  hypothetical protein  45.86 
 
 
295 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4589  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.48 
 
 
295 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4219  hypothetical protein  46.67 
 
 
295 aa  159  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0637  hypothetical protein  41.31 
 
 
300 aa  159  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2213  hypothetical protein  41.51 
 
 
308 aa  152  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139395  normal  0.292035 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4736  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.76 
 
 
296 aa  150  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0137287 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4436  hypothetical protein  46.55 
 
 
332 aa  149  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.785068 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0052  hypothetical protein  41.47 
 
 
301 aa  142  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1075  hypothetical protein  48.43 
 
 
317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00290318 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1638  hypothetical protein  33.8 
 
 
298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2611  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2011  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.2 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.87899  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.26 
 
 
282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.593978  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.23 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.23 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  30.28 
 
 
326 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  30.28 
 
 
294 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  30.28 
 
 
294 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  28.26 
 
 
321 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  29.68 
 
 
300 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.7 
 
 
340 aa  56.2  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.79 
 
 
301 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  28.04 
 
 
293 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  28.04 
 
 
292 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  29.04 
 
 
294 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  28.04 
 
 
293 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2376  hypothetical protein  29.35 
 
 
295 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0860299  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.83 
 
 
315 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  27.54 
 
 
343 aa  53.9  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.8 
 
 
290 aa  53.1  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  22.18 
 
 
307 aa  53.1  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  24.81 
 
 
303 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.09 
 
 
293 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.45 
 
 
301 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>