116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2116 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2116  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363277  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5689  hypothetical protein  84.62 
 
 		 302 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2386  hypothetical protein  83.95 
 
 		 302 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2371  hypothetical protein  83.28 
 
 		 302 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2268  hypothetical protein  83.61 
 
 		 302 aa  484  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1738  hypothetical protein  83.28 
 
 		 302 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2350  hypothetical protein  83.28 
 
 		 302 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0929  hypothetical protein  82.94 
 
 		 302 aa  481  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50488  normal  0.616383 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0952  hypothetical protein  82.27 
 
 		 302 aa  462  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1951  hypothetical protein  81.33 
 
 		 302 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1002  hypothetical protein  81.33 
 
 		 302 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0862  hypothetical protein  81.33 
 
 		 302 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1164  integral membrane protein  81.33 
 
 		 302 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.766304  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0286  hypothetical protein  81.33 
 
 		 302 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1315  integral membrane protein, DUF6  80.33 
 
 		 302 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349562  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1155  integral membrane protein  80.67 
 
 		 302 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1302  hypothetical protein  69.46 
 
 		 304 aa  391  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.730648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2347  hypothetical protein  54.24 
 
 		 330 aa  254  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.99 
 
 		 312 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0199053  normal  0.550765 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0917  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.65 
 
 		 312 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2511  hypothetical protein  54.42 
 
 		 327 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0987  hypothetical protein  49.32 
 
 		 313 aa  229  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.0533863 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4790  hypothetical protein  48.52 
 
 		 295 aa  222  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.430049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4095  hypothetical protein  45.94 
 
 		 286 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3554  hypothetical protein  46.15 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3482  hypothetical protein  47.78 
 
 		 295 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4264  hypothetical protein  47.78 
 
 		 295 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0105351 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4884  hypothetical protein  47.78 
 
 		 295 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5402  hypothetical protein  47.78 
 
 		 295 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3724  hypothetical protein  46.64 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.212991 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0184  hypothetical protein  42.95 
 
 		 313 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.482363  normal  0.823558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2732  hypothetical protein  45.56 
 
 		 289 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3061  hypothetical protein  44.89 
 
 		 289 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.608952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0829  hypothetical protein  48.15 
 
 		 295 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0472723 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1845  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.84 
 
 		 287 aa  207  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.278563 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2978  conserved hypothetical protein membrane protein  42.27 
 
 		 287 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2949  hypothetical protein  45.19 
 
 		 288 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2052  hypothetical protein  43.4 
 
 		 288 aa  204  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0282096  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3085  hypothetical protein  44.81 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48150  hypothetical protein  46.1 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3540  hypothetical protein  43.29 
 
 		 308 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216262 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4886  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.44 
 
 		 295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240403  normal  0.615803 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2662  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.18 
 
 		 287 aa  198  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0259  hypothetical protein  41.55 
 
 		 286 aa  196  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6291  hypothetical protein  47.91 
 
 		 305 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0524409  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1638  hypothetical protein  40.96 
 
 		 298 aa  196  5.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2611  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3086  hypothetical protein  43.9 
 
 		 300 aa  196  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7209  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.79 
 
 		 298 aa  195  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266487  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.49 
 
 		 314 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.594073  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4837  hypothetical protein  44.69 
 
 		 284 aa  192  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3728  hypothetical protein  43.62 
 
 		 315 aa  192  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2334  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.42 
 
 		 287 aa  192  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0523768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0746  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.89 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0969  hypothetical protein  44.57 
 
 		 290 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2213  hypothetical protein  42.72 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139395  normal  0.292035 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1783  drug/metabolite family efflux pump  47.04 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000148908 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0254  hypothetical protein  42.71 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.663739  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4235  hypothetical protein  44.27 
 
 		 318 aa  181  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3844  hypothetical protein  47.16 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2456  hypothetical protein  42.91 
 
 		 312 aa  176  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0264  hypothetical protein  44.23 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4436  hypothetical protein  44.9 
 
 		 332 aa  175  8e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785068 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0914  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.61 
 
 		 287 aa  175  8e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.583051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0402  hypothetical protein  40.27 
 
 		 311 aa  175  9e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1891  hypothetical protein  44.24 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.829047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4219  hypothetical protein  45.42 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4589  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.02 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_004310  BR1893  hypothetical protein  41.39 
 
 		 285 aa  168  8e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2148  transporter of the DMT superfamily  41.26 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7474  putative inner membrane transport protein of unknown function  42.01 
 
 		 286 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.450113 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1140  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.74 
 
 		 301 aa  166  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113288 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0052  hypothetical protein  37.11 
 
 		 301 aa  163  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4736  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.42 
 
 		 296 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0137287 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3989  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.67 
 
 		 306 aa  157  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40 
 
 		 299 aa  152  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00112924  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0637  hypothetical protein  32.87 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2011  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.5 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.87899  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1075  hypothetical protein  41.67 
 
 		 317 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00290318 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.39 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.593978  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  32.24 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  32.24 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  31.43 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  30.92 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  30.92 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  30.52 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  30.89 
 
 		 397 aa  53.9  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.11 
 
 		 292 aa  49.7  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  30.7 
 
 		 402 aa  50.1  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  25.7 
 
 		 299 aa  50.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  23.67 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  27.96 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.1 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1917  permease of the drug/metabolite transporter  27.08 
 
 		 364 aa  47  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.31 
 
 		 314 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.17 
 
 		 335 aa  47.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0346  hypothetical protein  30.41 
 
 		 302 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  31.14 
 
 		 353 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  31.14 
 
 		 356 aa  45.8  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  31.14 
 
 		 356 aa  45.8  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>