144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2662 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2662  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
287 aa  548  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301286  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2334  protein of unknown function DUF6 transmembrane  90.94 
 
 
287 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0523768  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3554  hypothetical protein  77.89 
 
 
297 aa  427  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4095  hypothetical protein  75.17 
 
 
286 aa  422  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48150  hypothetical protein  69.58 
 
 
287 aa  374  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1845  protein of unknown function DUF6 transmembrane  71.33 
 
 
287 aa  376  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.278563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3061  hypothetical protein  67.82 
 
 
289 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.608952  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3085  hypothetical protein  67.47 
 
 
289 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2732  hypothetical protein  67.47 
 
 
289 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3724  hypothetical protein  69.34 
 
 
295 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.212991 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2949  hypothetical protein  67.01 
 
 
288 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2052  hypothetical protein  69.58 
 
 
288 aa  363  2e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0282096  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4790  hypothetical protein  69.34 
 
 
295 aa  361  6e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.430049  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4264  hypothetical protein  68.99 
 
 
295 aa  361  8e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0105351 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0914  protein of unknown function DUF6 transmembrane  68.29 
 
 
287 aa  359  3e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.583051  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4886  protein of unknown function DUF6 transmembrane  70.73 
 
 
295 aa  358  8e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240403  normal  0.615803 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2978  conserved hypothetical protein membrane protein  67.25 
 
 
287 aa  355  5.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1891  hypothetical protein  70.73 
 
 
287 aa  355  6.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.829047  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4837  hypothetical protein  67.38 
 
 
284 aa  350  1e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3086  hypothetical protein  65.03 
 
 
300 aa  350  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5402  hypothetical protein  68.29 
 
 
295 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3482  hypothetical protein  68.29 
 
 
295 aa  348  4e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4884  hypothetical protein  68.29 
 
 
295 aa  348  4e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951172  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0969  hypothetical protein  68.31 
 
 
290 aa  347  1e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0254  hypothetical protein  69.34 
 
 
290 aa  345  4e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.663739  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1893  hypothetical protein  68.53 
 
 
285 aa  338  9e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1783  drug/metabolite family efflux pump  70.98 
 
 
295 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000148908 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0829  hypothetical protein  66.9 
 
 
295 aa  330  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0472723 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0259  hypothetical protein  59.79 
 
 
286 aa  325  4.0000000000000003e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7474  putative inner membrane transport protein of unknown function  63.99 
 
 
286 aa  302  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.450113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7209  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.11 
 
 
298 aa  285  8e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266487  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4589  protein of unknown function DUF6 transmembrane  67.57 
 
 
295 aa  285  9e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6291  hypothetical protein  60.65 
 
 
305 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0524409  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4219  hypothetical protein  67.31 
 
 
295 aa  281  9e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4736  protein of unknown function DUF6 transmembrane  66.67 
 
 
296 aa  279  4e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0137287 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0264  hypothetical protein  58.93 
 
 
295 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2347  hypothetical protein  54.58 
 
 
330 aa  219  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0917  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.72 
 
 
312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.37 
 
 
312 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0199053  normal  0.550765 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2116  hypothetical protein  47.18 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363277  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2511  hypothetical protein  51.87 
 
 
327 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1302  hypothetical protein  44.09 
 
 
304 aa  203  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.730648  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0987  hypothetical protein  48.78 
 
 
313 aa  200  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.0533863 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1315  integral membrane protein, DUF6  47.37 
 
 
302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349562  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2386  hypothetical protein  43.48 
 
 
302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2268  hypothetical protein  43.48 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1951  hypothetical protein  47.02 
 
 
302 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121613  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1738  hypothetical protein  43.14 
 
 
302 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2350  hypothetical protein  43.14 
 
 
302 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1002  hypothetical protein  47.02 
 
 
302 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0862  hypothetical protein  47.02 
 
 
302 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1164  integral membrane protein  47.02 
 
 
302 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.766304  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0286  hypothetical protein  47.02 
 
 
302 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2371  hypothetical protein  43.79 
 
 
302 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1155  integral membrane protein  47.02 
 
 
302 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5689  hypothetical protein  43.82 
 
 
302 aa  195  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0952  hypothetical protein  46.32 
 
 
302 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2148  transporter of the DMT superfamily  45.26 
 
 
316 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0929  hypothetical protein  43.82 
 
 
302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50488  normal  0.616383 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1638  hypothetical protein  41.38 
 
 
298 aa  188  8e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2611  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0637  hypothetical protein  41.67 
 
 
300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3540  hypothetical protein  44.07 
 
 
308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216262 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.79 
 
 
314 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.594073  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4436  hypothetical protein  46.53 
 
 
332 aa  182  7e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.785068 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2213  hypothetical protein  43.61 
 
 
308 aa  180  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139395  normal  0.292035 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3844  hypothetical protein  46.43 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2456  hypothetical protein  42.61 
 
 
312 aa  170  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0184  hypothetical protein  42.25 
 
 
313 aa  168  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.482363  normal  0.823558 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3728  hypothetical protein  44.36 
 
 
315 aa  166  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3989  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.09 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0402  hypothetical protein  42.05 
 
 
311 aa  163  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0746  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.91 
 
 
320 aa  159  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1140  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.88 
 
 
301 aa  155  8e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113288 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4235  hypothetical protein  41.55 
 
 
318 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2011  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.78 
 
 
284 aa  152  8e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.87899  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.44 
 
 
299 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00112924  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1075  hypothetical protein  45.56 
 
 
317 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00290318 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0052  hypothetical protein  34.66 
 
 
301 aa  122  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.82 
 
 
282 aa  68.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.593978  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.88 
 
 
301 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.12 
 
 
310 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 
305 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  26.13 
 
 
303 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 
305 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  25.68 
 
 
303 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  27.82 
 
 
303 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  27.41 
 
 
303 aa  52.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  28.79 
 
 
304 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  27.52 
 
 
304 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.11 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  25.33 
 
 
303 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.06 
 
 
298 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  25.23 
 
 
303 aa  50.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  25.68 
 
 
303 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  27.68 
 
 
286 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  25.23 
 
 
303 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  25.23 
 
 
303 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  25.23 
 
 
303 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  27.23 
 
 
287 aa  49.7  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  26.67 
 
 
303 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>