133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4837 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4837  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  532  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4095  hypothetical protein  68.55 
 
 		 286 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2662  protein of unknown function DUF6 transmembrane  67.38 
 
 		 287 aa  348  8e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301286  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2949  hypothetical protein  65.03 
 
 		 288 aa  345  4e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3085  hypothetical protein  64.56 
 
 		 289 aa  345  4e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2732  hypothetical protein  63.86 
 
 		 289 aa  345  5e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3724  hypothetical protein  67.02 
 
 		 295 aa  345  5e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.212991 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4790  hypothetical protein  67.92 
 
 		 295 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.430049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4264  hypothetical protein  67.55 
 
 		 295 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0105351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3061  hypothetical protein  62.46 
 
 		 289 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.608952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3482  hypothetical protein  67.38 
 
 		 295 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4884  hypothetical protein  67.38 
 
 		 295 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5402  hypothetical protein  67.38 
 
 		 295 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3554  hypothetical protein  61.13 
 
 		 297 aa  333  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2334  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.54 
 
 		 287 aa  333  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0523768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1845  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.77 
 
 		 287 aa  329  3e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.278563 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2052  hypothetical protein  63.83 
 
 		 288 aa  328  7e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0282096  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48150  hypothetical protein  63.6 
 
 		 287 aa  325  6e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0259  hypothetical protein  60.64 
 
 		 286 aa  318  5e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0829  hypothetical protein  66.31 
 
 		 295 aa  316  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0472723 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3086  hypothetical protein  60.42 
 
 		 300 aa  312  3.9999999999999997e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1891  hypothetical protein  65.6 
 
 		 287 aa  309  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.829047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4886  protein of unknown function DUF6 transmembrane  65.02 
 
 		 295 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240403  normal  0.615803 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0254  hypothetical protein  62.41 
 
 		 290 aa  308  5.9999999999999995e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.663739  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0969  hypothetical protein  61.84 
 
 		 290 aa  305  6e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0914  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.78 
 
 		 287 aa  303  2.0000000000000002e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.583051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7474  putative inner membrane transport protein of unknown function  64.64 
 
 		 286 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.450113 
 
 
-
 
NC_004310  BR1893  hypothetical protein  61.13 
 
 		 285 aa  297  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4589  protein of unknown function DUF6 transmembrane  65.71 
 
 		 295 aa  295  5e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2978  conserved hypothetical protein membrane protein  57.65 
 
 		 287 aa  295  7e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4219  hypothetical protein  66.07 
 
 		 295 aa  294  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4736  protein of unknown function DUF6 transmembrane  66.9 
 
 		 296 aa  293  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0137287 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1783  drug/metabolite family efflux pump  64.66 
 
 		 295 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000148908 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6291  hypothetical protein  58.84 
 
 		 305 aa  275  6e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0524409  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7209  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.04 
 
 		 298 aa  260  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266487  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0264  hypothetical protein  58.87 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2116  hypothetical protein  44.69 
 
 		 301 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363277  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.91 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0199053  normal  0.550765 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0917  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.91 
 
 		 312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5689  hypothetical protein  42.05 
 
 		 302 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2347  hypothetical protein  46.77 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0929  hypothetical protein  42.05 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50488  normal  0.616383 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2511  hypothetical protein  46.77 
 
 		 327 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1315  integral membrane protein, DUF6  43.21 
 
 		 302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349562  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1738  hypothetical protein  41.4 
 
 		 302 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2350  hypothetical protein  41.4 
 
 		 302 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2371  hypothetical protein  40.78 
 
 		 302 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2386  hypothetical protein  41.75 
 
 		 302 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2268  hypothetical protein  41.75 
 
 		 302 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1951  hypothetical protein  43.21 
 
 		 302 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1002  hypothetical protein  43.21 
 
 		 302 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0862  hypothetical protein  43.21 
 
 		 302 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0286  hypothetical protein  43.21 
 
 		 302 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1164  integral membrane protein  43.21 
 
 		 302 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.766304  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0952  hypothetical protein  42.86 
 
 		 302 aa  188  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1155  integral membrane protein  43.21 
 
 		 302 aa  188  8e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1302  hypothetical protein  42.86 
 
 		 304 aa  183  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.730648  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3989  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.56 
 
 		 306 aa  182  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.59 
 
 		 314 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.594073  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0987  hypothetical protein  45.67 
 
 		 313 aa  182  6e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.0533863 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3540  hypothetical protein  41.67 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216262 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3728  hypothetical protein  46.15 
 
 		 315 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1638  hypothetical protein  39.35 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2611  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0637  hypothetical protein  40.44 
 
 		 300 aa  177  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2213  hypothetical protein  45.68 
 
 		 308 aa  176  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139395  normal  0.292035 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4235  hypothetical protein  43.01 
 
 		 318 aa  176  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4436  hypothetical protein  46.48 
 
 		 332 aa  175  6e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785068 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0402  hypothetical protein  45.8 
 
 		 311 aa  175  7e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2456  hypothetical protein  44.2 
 
 		 312 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0184  hypothetical protein  42.4 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.482363  normal  0.823558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2148  transporter of the DMT superfamily  42.14 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3844  hypothetical protein  46.24 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0746  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.58 
 
 		 320 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1140  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.84 
 
 		 301 aa  149  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.07 
 
 		 299 aa  135  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00112924  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0052  hypothetical protein  39.29 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2011  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.07 
 
 		 284 aa  132  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.87899  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1075  hypothetical protein  42.7 
 
 		 317 aa  126  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00290318 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.6 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.593978  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  28.46 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  28.06 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  26.4 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  28.06 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  27.27 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  27.27 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  26.88 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  27.27 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  27.27 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  27.27 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  27.43 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.83 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  25.72 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  25.72 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  25.72 
 
 		 303 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  25.36 
 
 		 303 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  25.36 
 
 		 303 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  29.26 
 
 		 287 aa  53.1  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  25.72 
 
 		 303 aa  52.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  25.36 
 
 		 303 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>