More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2545 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2911  hypothetical protein  79.6 
 
 		 299 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.100063 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  78.26 
 
 		 299 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2383  hypothetical protein  62.21 
 
 		 299 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195914  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  52.17 
 
 		 299 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3034  hypothetical protein  52.19 
 
 		 298 aa  295  8e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4236  putative transport protein  57.76 
 
 		 297 aa  275  6e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172586  normal  0.870652 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8212  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.76 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.87 
 
 		 299 aa  114  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.418802  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4057  hypothetical protein  31.87 
 
 		 299 aa  112  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.365603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3051  hypothetical protein  28.57 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2852  hypothetical protein  27.96 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4618  hypothetical protein  32.71 
 
 		 298 aa  102  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  26.37 
 
 		 301 aa  99  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4695  hypothetical protein  32.58 
 
 		 293 aa  97.1  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658127  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  25.44 
 
 		 301 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  24.74 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  24.74 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  24.74 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.09 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  24.74 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.44 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  24.74 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0825  hypothetical protein  28.36 
 
 		 283 aa  93.6  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  25.56 
 
 		 283 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.87 
 
 		 293 aa  92.8  6e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0215  hypothetical protein  31.83 
 
 		 334 aa  88.2  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  33.82 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.88 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  26.67 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.18 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.12 
 
 		 317 aa  79  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2356  hypothetical protein  32.13 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469762  normal  0.368317 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  27.83 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.26 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2592  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.05 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0684948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  25.87 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  25.87 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2007  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.08 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.57 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  27.55 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.55 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1688  hypothetical protein  27.82 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.757189 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  27.55 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  27.55 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  27.55 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  30.9 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.61 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4560  hypothetical protein  29.43 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00353788  normal  0.103037 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  27.55 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  27.55 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  27.55 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0410  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.92 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  28.1 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  28.17 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1098  hypothetical protein  29.17 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100036  normal  0.664944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  29.6 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  26.67 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.28 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  27.95 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  28.17 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  28.96 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  27.74 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0395  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2455  hypothetical protein  30.1 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4022  hypothetical protein  30.59 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  26.87 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4020  DMT family permease  28.48 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000861601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1754  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.25 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.568137  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  26.32 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  27.08 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2759  hypothetical protein  30.71 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4094  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.66 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.466006  normal  0.380638 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  29.21 
 
 		 395 aa  62.4  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  23.61 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  25.35 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.44 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  26.1 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  25.33 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.97 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.28 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3272  hypothetical protein  28.78 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.96 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3388  hypothetical protein  27.12 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.26 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.65 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  27.57 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.16 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.65 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  26.1 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  30.3 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  30.3 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  33.02 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  31 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  24.6 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6034  hypothetical protein  28.95 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  31.53 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.62 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.82 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>