More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A6034 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6034  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  593  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2759  hypothetical protein  93.73 
 
 
303 aa  521  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2095  hypothetical protein  96.14 
 
 
311 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.734352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2707  hypothetical protein  96.14 
 
 
311 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2734  hypothetical protein  95.82 
 
 
311 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0592  hypothetical protein  96.25 
 
 
311 aa  488  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0579  integral membrane protein  74.03 
 
 
426 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431063  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0710  hypothetical protein  75.32 
 
 
312 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0696  hypothetical protein  75.32 
 
 
376 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0875  integral membrane protein  75 
 
 
312 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  74.34 
 
 
311 aa  417  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4020  DMT family permease  72.46 
 
 
330 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000861601  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2345  hypothetical protein  76.61 
 
 
272 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2733  multidrug ABC transporter permease  76.61 
 
 
272 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  61.13 
 
 
301 aa  334  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  60.91 
 
 
301 aa  334  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0395  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.84 
 
 
301 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0410  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.5 
 
 
301 aa  332  5e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200837  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0502  hypothetical protein  60.68 
 
 
301 aa  305  7e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.643088  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  50.16 
 
 
308 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  49.84 
 
 
303 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  50.16 
 
 
308 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  49.51 
 
 
303 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  49.84 
 
 
308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  49.04 
 
 
310 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3160  hypothetical protein  49.5 
 
 
302 aa  245  6e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1076  hypothetical protein  49.83 
 
 
304 aa  239  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.529368 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6431  hypothetical protein  47.67 
 
 
315 aa  236  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.275967  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3820  hypothetical protein  51.55 
 
 
308 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0410  hypothetical protein  51.53 
 
 
313 aa  232  6e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3388  hypothetical protein  47.8 
 
 
321 aa  230  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.8 
 
 
293 aa  229  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  46.31 
 
 
305 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2135  hypothetical protein  49.51 
 
 
314 aa  227  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0459408  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0138  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.69 
 
 
299 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  44.48 
 
 
304 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  45 
 
 
315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0519  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.45 
 
 
307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0122  hypothetical protein  47.1 
 
 
299 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  41.89 
 
 
307 aa  205  8e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0515  hypothetical protein  42.86 
 
 
301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  41.95 
 
 
317 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1123  hypothetical protein  45 
 
 
312 aa  190  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  35.45 
 
 
307 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0572  hypothetical protein  45.85 
 
 
324 aa  180  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.638735 
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  35.12 
 
 
307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2139  puative integral membrane protein  38.31 
 
 
297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.217486 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  35.59 
 
 
286 aa  173  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2295  hypothetical protein  41.31 
 
 
314 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0642  RhaT family protein  40.98 
 
 
314 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1801  hypothetical protein  40.5 
 
 
297 aa  156  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.655687 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0609  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  31.02 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  29.87 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  28.91 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.6 
 
 
304 aa  69.7  0.00000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  30.18 
 
 
303 aa  67.8  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  29.57 
 
 
311 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  29.49 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  30.7 
 
 
324 aa  67  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  30.14 
 
 
311 aa  65.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2873  hypothetical protein  29.14 
 
 
298 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604973  normal  0.0800404 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0653  hypothetical protein  26.3 
 
 
306 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.005138  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.47 
 
 
307 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.47 
 
 
309 aa  62.8  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.84 
 
 
296 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  26.17 
 
 
316 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  26.69 
 
 
294 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  26.8 
 
 
296 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  27.47 
 
 
314 aa  60.8  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  26.32 
 
 
304 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2089  hypothetical protein  27.95 
 
 
304 aa  60.8  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.920786  normal  0.915824 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4767  hypothetical protein  26.92 
 
 
306 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0878197  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.19 
 
 
291 aa  60.1  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.45 
 
 
299 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5328  DMT family transporter: drug/metabolite  28.24 
 
 
300 aa  59.7  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.681519  normal  0.112664 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  24.76 
 
 
305 aa  59.7  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4780  hypothetical protein  26.6 
 
 
304 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119859  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2409  hypothetical protein  26.23 
 
 
288 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.517139  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  32.46 
 
 
330 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.8 
 
 
312 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.22 
 
 
299 aa  58.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4642  hypothetical protein  27.24 
 
 
306 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0734055  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  32 
 
 
310 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  28.74 
 
 
286 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.41 
 
 
314 aa  58.9  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  32 
 
 
310 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  27.92 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.06 
 
 
340 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  29.8 
 
 
312 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2311  hypothetical protein  27.04 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000443541  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  27.92 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.65 
 
 
301 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0391  hypothetical protein  26.37 
 
 
330 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  27.92 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  29.7 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  27.92 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.21 
 
 
306 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  22.82 
 
 
301 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>