More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6431 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6431  hypothetical protein  100 
 
 
315 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.275967  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3388  hypothetical protein  55.52 
 
 
321 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  52.27 
 
 
303 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  51.95 
 
 
303 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0410  hypothetical protein  54.82 
 
 
313 aa  271  7e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1076  hypothetical protein  54.85 
 
 
304 aa  267  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.529368 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  50.49 
 
 
308 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  50.16 
 
 
308 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  50.16 
 
 
308 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  50 
 
 
310 aa  255  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2135  hypothetical protein  50.48 
 
 
314 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0459408  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0395  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.01 
 
 
301 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  48.17 
 
 
301 aa  239  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2295  hypothetical protein  48.11 
 
 
314 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0410  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.01 
 
 
301 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200837  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3820  hypothetical protein  50.81 
 
 
308 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0642  RhaT family protein  47.42 
 
 
314 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  43.65 
 
 
307 aa  229  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  46.13 
 
 
301 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2759  hypothetical protein  47.33 
 
 
303 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4020  DMT family permease  47.64 
 
 
330 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000861601  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.47 
 
 
311 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0579  integral membrane protein  46.64 
 
 
426 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431063  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0502  hypothetical protein  46.13 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.643088  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6034  hypothetical protein  47.67 
 
 
311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2095  hypothetical protein  46.69 
 
 
311 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.734352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2707  hypothetical protein  46.69 
 
 
311 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2734  hypothetical protein  46.69 
 
 
311 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0696  hypothetical protein  46.78 
 
 
376 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0710  hypothetical protein  46.78 
 
 
312 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0875  integral membrane protein  46.44 
 
 
312 aa  208  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0592  hypothetical protein  47.57 
 
 
311 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1123  hypothetical protein  46.05 
 
 
312 aa  186  5e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.47 
 
 
293 aa  185  8e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  37.42 
 
 
305 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  36.42 
 
 
304 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2733  multidrug ABC transporter permease  48.25 
 
 
272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  37.37 
 
 
315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2345  hypothetical protein  48.25 
 
 
272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0519  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.67 
 
 
307 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0138  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.69 
 
 
299 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3160  hypothetical protein  36.09 
 
 
302 aa  149  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  35.19 
 
 
317 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0515  hypothetical protein  36.91 
 
 
301 aa  143  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  31.88 
 
 
307 aa  136  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  31.19 
 
 
307 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0572  hypothetical protein  36.65 
 
 
324 aa  129  7.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.638735 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0122  hypothetical protein  36.17 
 
 
299 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  32.14 
 
 
286 aa  125  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2139  puative integral membrane protein  29.96 
 
 
297 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.217486 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1801  hypothetical protein  29.86 
 
 
297 aa  96.7  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.655687 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.02 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  23.13 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  27.16 
 
 
319 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  27.27 
 
 
315 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  31.48 
 
 
286 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.76 
 
 
291 aa  67  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  27.99 
 
 
299 aa  66.6  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  24.48 
 
 
311 aa  64.7  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  28.51 
 
 
304 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  31.37 
 
 
294 aa  63.5  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  28.47 
 
 
286 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  33.18 
 
 
286 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  27.18 
 
 
308 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  30.05 
 
 
311 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  27.67 
 
 
299 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  27.67 
 
 
299 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1780  SMR family transporter-like protein  25.6 
 
 
322 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  28.85 
 
 
287 aa  58.5  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  27.51 
 
 
299 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.57 
 
 
283 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  27 
 
 
299 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  27.51 
 
 
299 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.69 
 
 
299 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.11 
 
 
320 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  27.51 
 
 
299 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  31.18 
 
 
321 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  25.11 
 
 
314 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  27.93 
 
 
298 aa  58.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  31.35 
 
 
321 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  29.04 
 
 
304 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  28.09 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  24.14 
 
 
303 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.09 
 
 
286 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  24.14 
 
 
303 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.3 
 
 
300 aa  57  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.84 
 
 
293 aa  57  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.71 
 
 
287 aa  56.6  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.33 
 
 
312 aa  55.8  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  23.36 
 
 
317 aa  55.5  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  23.79 
 
 
303 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  29.44 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  27.87 
 
 
324 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4262  hypothetical protein  27.02 
 
 
298 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.98 
 
 
302 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.44 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  29.44 
 
 
310 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  26.62 
 
 
299 aa  55.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  27.33 
 
 
306 aa  53.9  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.41 
 
 
320 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>