More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1123 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1123  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  593  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  49.32 
 
 
303 aa  242  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  49.32 
 
 
303 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  48.68 
 
 
301 aa  231  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0395  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.97 
 
 
301 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0410  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.3 
 
 
301 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200837  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  48.64 
 
 
308 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  48.64 
 
 
308 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2135  hypothetical protein  50.34 
 
 
314 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0459408  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  49.49 
 
 
310 aa  223  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  47.96 
 
 
308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3388  hypothetical protein  46.76 
 
 
321 aa  220  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2759  hypothetical protein  47.97 
 
 
303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.7 
 
 
311 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  45.82 
 
 
301 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0410  hypothetical protein  50.34 
 
 
313 aa  217  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6431  hypothetical protein  46.71 
 
 
315 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.275967  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4020  DMT family permease  47.8 
 
 
330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000861601  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3820  hypothetical protein  49.29 
 
 
308 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  44.33 
 
 
307 aa  209  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0579  integral membrane protein  44.09 
 
 
426 aa  209  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431063  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0502  hypothetical protein  46.03 
 
 
301 aa  205  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.643088  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0696  hypothetical protein  44.37 
 
 
376 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6034  hypothetical protein  46.67 
 
 
311 aa  202  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0710  hypothetical protein  44.63 
 
 
312 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2734  hypothetical protein  46.33 
 
 
311 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0875  integral membrane protein  44.3 
 
 
312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0592  hypothetical protein  48.57 
 
 
311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2095  hypothetical protein  46.33 
 
 
311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.734352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2707  hypothetical protein  46.33 
 
 
311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1076  hypothetical protein  46.58 
 
 
304 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.529368 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2733  multidrug ABC transporter permease  45.64 
 
 
272 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2345  hypothetical protein  45.64 
 
 
272 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0515  hypothetical protein  41.14 
 
 
301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2295  hypothetical protein  43.62 
 
 
314 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  38.63 
 
 
305 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0642  RhaT family protein  42.95 
 
 
314 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3160  hypothetical protein  41.52 
 
 
302 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0519  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.6 
 
 
307 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  35.34 
 
 
304 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.22 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0138  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.57 
 
 
299 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0572  hypothetical protein  39.79 
 
 
324 aa  143  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.638735 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  36.07 
 
 
315 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  34.3 
 
 
317 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0122  hypothetical protein  39.49 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  32.36 
 
 
307 aa  132  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  32 
 
 
307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  32 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2139  puative integral membrane protein  33.58 
 
 
297 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.217486 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1801  hypothetical protein  35.93 
 
 
297 aa  113  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.655687 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  34.12 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  30.82 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  27.31 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.41 
 
 
310 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  28.65 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.68 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  28.62 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 
300 aa  64.3  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  30.35 
 
 
309 aa  62.8  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2061  hypothetical protein  30.56 
 
 
305 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359774  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.74 
 
 
312 aa  62.4  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  30.95 
 
 
301 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  27.63 
 
 
306 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0248  hypothetical protein  29.89 
 
 
301 aa  60.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0458948  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  27.24 
 
 
305 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  34.12 
 
 
310 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  28.57 
 
 
303 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  34.12 
 
 
310 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2616  hypothetical protein  28.63 
 
 
310 aa  59.7  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0513326  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  29.57 
 
 
341 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  29.61 
 
 
304 aa  59.3  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  31.79 
 
 
286 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2425  hypothetical protein  30.11 
 
 
313 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.61547  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  30.95 
 
 
299 aa  59.3  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.47 
 
 
299 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  29.93 
 
 
312 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.02 
 
 
304 aa  58.5  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  22.68 
 
 
312 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.23 
 
 
307 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0284  hypothetical protein  27.24 
 
 
296 aa  58.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2704  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.9 
 
 
297 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  26.25 
 
 
319 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.01 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.57 
 
 
312 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
317 aa  56.6  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 
291 aa  56.6  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  29.7 
 
 
289 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1850  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.4 
 
 
308 aa  56.2  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.152184  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  25.21 
 
 
304 aa  55.8  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3828  hypothetical protein  29.25 
 
 
311 aa  56.2  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.795304 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  28.43 
 
 
307 aa  55.8  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.8 
 
 
294 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  29.57 
 
 
312 aa  55.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  25.88 
 
 
306 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.6 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  27.27 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.69 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  28.1 
 
 
292 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  26.61 
 
 
314 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>