More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2045 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  587  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  50.18 
 
 
312 aa  256  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  44.93 
 
 
312 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  47.26 
 
 
304 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0878  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.77 
 
 
306 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.754226  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  40.29 
 
 
293 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0056  hypothetical protein  40.07 
 
 
293 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0122515  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3287  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.6 
 
 
288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504842  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1390  DMT family permease  39.71 
 
 
293 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.09 
 
 
294 aa  133  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0335  hypothetical protein  38.83 
 
 
289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.414942 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.99 
 
 
290 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  33.7 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2802  hypothetical protein  37.5 
 
 
305 aa  117  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.930073 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  32.57 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.03 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.05 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.53 
 
 
312 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  35.23 
 
 
296 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  30.42 
 
 
319 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  34.69 
 
 
298 aa  102  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.19 
 
 
317 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.03 
 
 
294 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.25 
 
 
302 aa  97.8  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  30.2 
 
 
306 aa  96.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.33 
 
 
291 aa  95.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  29.72 
 
 
300 aa  95.5  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4196  hypothetical protein  32.01 
 
 
293 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.43 
 
 
367 aa  94  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  33.44 
 
 
292 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  33.22 
 
 
297 aa  92.4  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  30.03 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.6 
 
 
340 aa  91.3  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.81 
 
 
312 aa  90.9  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  28.47 
 
 
285 aa  90.1  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  31.93 
 
 
319 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0009  hypothetical protein  31.56 
 
 
289 aa  89.4  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3864  hypothetical protein  31.2 
 
 
297 aa  89.4  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209657  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  29.7 
 
 
324 aa  88.6  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20640  hypothetical protein  33.67 
 
 
292 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14869  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.15 
 
 
321 aa  88.2  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0136  hypothetical protein  33.57 
 
 
308 aa  87.8  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.36 
 
 
317 aa  87.4  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.8 
 
 
330 aa  87.4  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  30.37 
 
 
296 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  31.69 
 
 
286 aa  86.7  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.55 
 
 
290 aa  86.3  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  32.97 
 
 
281 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.12 
 
 
290 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.82 
 
 
313 aa  85.1  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3137  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.79 
 
 
331 aa  85.5  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.24 
 
 
315 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31 
 
 
313 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.526494  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  31.07 
 
 
283 aa  84.3  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  29.55 
 
 
305 aa  84  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 
310 aa  84  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.72 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.427238  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3272  hypothetical protein  31.52 
 
 
314 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  29.25 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0738  hypothetical protein  29.75 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  31.23 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  31.52 
 
 
289 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0052  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.66 
 
 
313 aa  82  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175187  normal  0.588474 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  24.74 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2311  hypothetical protein  31.18 
 
 
303 aa  82.4  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000443541  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2810  hypothetical protein  30.52 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.834647  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2425  hypothetical protein  31.45 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.61547  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  30.25 
 
 
298 aa  80.9  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  31.67 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1398  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.43 
 
 
368 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.509319  decreased coverage  0.000513734 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  25.09 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2704  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.37 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  25.81 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.09 
 
 
301 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0373  hypothetical protein  32.08 
 
 
325 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1917  permease of the drug/metabolite transporter  28.22 
 
 
364 aa  80.1  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.13 
 
 
301 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.27 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1245  putative permease  29.89 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.499311  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  23.78 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  23.78 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  23.78 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  23.78 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  31.72 
 
 
301 aa  79  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  30.18 
 
 
293 aa  79  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  28.31 
 
 
301 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.58 
 
 
304 aa  79  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.12 
 
 
348 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3540  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.34 
 
 
313 aa  79  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0456  transporter, EamA family  24.92 
 
 
316 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0398  EamA family protein  24.92 
 
 
316 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  31.08 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0389  DMT family permease  24.92 
 
 
316 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  23.78 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  24.83 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0411  eama family protein  24.92 
 
 
316 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.22 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2902  hypothetical protein  29.7 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.22 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.87 
 
 
307 aa  77.4  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>