More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0710 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0875  integral membrane protein  99.68 
 
 
312 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0696  hypothetical protein  99.68 
 
 
376 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0710  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0579  integral membrane protein  94.87 
 
 
426 aa  550  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431063  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2733  multidrug ABC transporter permease  99.6 
 
 
272 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2345  hypothetical protein  99.6 
 
 
272 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2759  hypothetical protein  77.26 
 
 
303 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2734  hypothetical protein  75.32 
 
 
311 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2707  hypothetical protein  75.32 
 
 
311 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6034  hypothetical protein  75.32 
 
 
311 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2095  hypothetical protein  75.32 
 
 
311 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.734352  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0592  hypothetical protein  77.66 
 
 
311 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  70.76 
 
 
311 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4020  DMT family permease  70.1 
 
 
330 aa  394  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000861601  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  60.6 
 
 
301 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0395  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.6 
 
 
301 aa  330  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0410  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.26 
 
 
301 aa  329  4e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200837  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  58 
 
 
301 aa  319  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0502  hypothetical protein  58.78 
 
 
301 aa  299  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.643088  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  51.85 
 
 
303 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  51.52 
 
 
303 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  49.84 
 
 
308 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  49.84 
 
 
308 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  49.19 
 
 
308 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  48.03 
 
 
310 aa  239  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3160  hypothetical protein  48.16 
 
 
302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6431  hypothetical protein  46.98 
 
 
315 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.275967  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  46.28 
 
 
305 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  44.16 
 
 
304 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1076  hypothetical protein  47.64 
 
 
304 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.529368 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3820  hypothetical protein  49.34 
 
 
308 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.78 
 
 
293 aa  223  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2135  hypothetical protein  47.44 
 
 
314 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0459408  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0138  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.04 
 
 
299 aa  215  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0519  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.79 
 
 
307 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3388  hypothetical protein  44.19 
 
 
321 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0410  hypothetical protein  47.12 
 
 
313 aa  209  5e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  43.19 
 
 
315 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  41.41 
 
 
307 aa  206  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0122  hypothetical protein  42.81 
 
 
299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  42.26 
 
 
317 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0515  hypothetical protein  43.1 
 
 
301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  36.12 
 
 
307 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0572  hypothetical protein  44.83 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.638735 
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  36.09 
 
 
307 aa  182  9.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1123  hypothetical protein  42.67 
 
 
312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  36.3 
 
 
286 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2295  hypothetical protein  39.6 
 
 
314 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0642  RhaT family protein  39.27 
 
 
314 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2139  puative integral membrane protein  35.22 
 
 
297 aa  157  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.217486 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1801  hypothetical protein  39.78 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.655687 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2873  hypothetical protein  31.23 
 
 
298 aa  79  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604973  normal  0.0800404 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.57 
 
 
312 aa  77  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0609  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.46 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  29.39 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  29.39 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  29.6 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  29.5 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  29.39 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  29.39 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  29.5 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  29.5 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.74 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  29.14 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  29.49 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  29.49 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  30.49 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  29.49 
 
 
294 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.85 
 
 
367 aa  69.3  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  29.9 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.31 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  26.82 
 
 
311 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2409  hypothetical protein  26.09 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.517139  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  30 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  26.5 
 
 
299 aa  64.3  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  26.97 
 
 
304 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  31.05 
 
 
310 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0526  transporter, EamA family  24.83 
 
 
330 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  30.34 
 
 
286 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0391  hypothetical protein  25.34 
 
 
330 aa  64.3  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  31.05 
 
 
310 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3425  hypothetical protein  28.72 
 
 
297 aa  63.5  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  29.78 
 
 
314 aa  63.2  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  28.62 
 
 
297 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2539  hypothetical protein  29.62 
 
 
300 aa  62.8  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.662204  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3681  hypothetical protein  24.75 
 
 
297 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.60204  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  30.15 
 
 
303 aa  62.4  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  27.27 
 
 
299 aa  62  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  27.04 
 
 
315 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2483  hypothetical protein  30.58 
 
 
293 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0867101 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 
299 aa  61.6  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2607  hypothetical protein  30.87 
 
 
295 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2612  hypothetical protein  30.58 
 
 
322 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.13 
 
 
306 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  28.95 
 
 
299 aa  60.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2664  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.22 
 
 
309 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  23.99 
 
 
304 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.48 
 
 
340 aa  60.1  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  28.08 
 
 
286 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  23.17 
 
 
301 aa  59.3  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>