More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0578 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
293 aa  566  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3160  hypothetical protein  54.98 
 
 
302 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0138  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.52 
 
 
299 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  49.14 
 
 
301 aa  240  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  48.3 
 
 
301 aa  238  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.23 
 
 
311 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  49.12 
 
 
305 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0395  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.14 
 
 
301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0410  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.8 
 
 
301 aa  232  5e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200837  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4020  DMT family permease  50.17 
 
 
330 aa  229  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000861601  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  47.9 
 
 
315 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  46.29 
 
 
304 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0696  hypothetical protein  46.78 
 
 
376 aa  222  6e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0710  hypothetical protein  46.78 
 
 
312 aa  222  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0579  integral membrane protein  46.78 
 
 
426 aa  222  6e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431063  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0875  integral membrane protein  46.44 
 
 
312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2759  hypothetical protein  48.65 
 
 
303 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0519  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0502  hypothetical protein  46.94 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.643088  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0122  hypothetical protein  50.18 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  41.72 
 
 
307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  41.03 
 
 
307 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  42.65 
 
 
286 aa  205  6e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6034  hypothetical protein  48.99 
 
 
311 aa  205  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  43.82 
 
 
317 aa  205  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2734  hypothetical protein  50.34 
 
 
311 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2095  hypothetical protein  49.32 
 
 
311 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.734352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2707  hypothetical protein  49.32 
 
 
311 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0410  hypothetical protein  45.45 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0572  hypothetical protein  43.37 
 
 
324 aa  199  5e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.638735 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0592  hypothetical protein  48.61 
 
 
311 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0515  hypothetical protein  44.4 
 
 
301 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6431  hypothetical protein  42.47 
 
 
315 aa  193  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.275967  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  44.25 
 
 
303 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  43.9 
 
 
303 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3388  hypothetical protein  42.76 
 
 
321 aa  190  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1076  hypothetical protein  42.27 
 
 
304 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.529368 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  42.11 
 
 
308 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  41.75 
 
 
308 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2135  hypothetical protein  45.05 
 
 
314 aa  176  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0459408  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  42.49 
 
 
308 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  40.81 
 
 
307 aa  172  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2733  multidrug ABC transporter permease  45.19 
 
 
272 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2345  hypothetical protein  45.19 
 
 
272 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  40.65 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3820  hypothetical protein  43.49 
 
 
308 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2295  hypothetical protein  40.27 
 
 
314 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0642  RhaT family protein  39.93 
 
 
314 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2139  puative integral membrane protein  40 
 
 
297 aa  155  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.217486 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1123  hypothetical protein  38.46 
 
 
312 aa  142  9e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1801  hypothetical protein  35.25 
 
 
297 aa  133  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.655687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  30.04 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.88 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  30.71 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2911  hypothetical protein  30.74 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.100063 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  31.86 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  29.29 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  28.15 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  28.62 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0609  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.44 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  27.92 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.18 
 
 
304 aa  67.4  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.4 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  32.59 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.14 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  25.89 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2616  hypothetical protein  24.69 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0513326  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.43 
 
 
292 aa  65.9  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  30 
 
 
300 aa  65.9  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0391  hypothetical protein  25.94 
 
 
330 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 
310 aa  63.2  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  27.78 
 
 
319 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.04 
 
 
305 aa  62.8  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.58 
 
 
321 aa  62.8  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4057  hypothetical protein  31.25 
 
 
299 aa  62.4  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.365603  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.25 
 
 
299 aa  62.4  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4695  hypothetical protein  31.48 
 
 
293 aa  62.4  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658127  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.98 
 
 
307 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4618  hypothetical protein  34.21 
 
 
298 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1850  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.83 
 
 
308 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.152184  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0375  hypothetical protein  25.82 
 
 
312 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00512602  normal  0.079664 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  27 
 
 
287 aa  61.6  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2311  hypothetical protein  28.24 
 
 
303 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000443541  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  28.99 
 
 
303 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.28 
 
 
349 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.29 
 
 
312 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.73 
 
 
299 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.418802  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2383  hypothetical protein  28 
 
 
299 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195914  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  26.88 
 
 
321 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.6 
 
 
382 aa  60.1  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  26.85 
 
 
299 aa  60.1  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.96 
 
 
290 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.23 
 
 
289 aa  60.1  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2401  hypothetical protein  28.03 
 
 
296 aa  60.1  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  27.24 
 
 
321 aa  59.7  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  28.96 
 
 
312 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  26.17 
 
 
304 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
320 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8212  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.94 
 
 
303 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>