137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0584 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 382 aa  766    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1364  hypothetical protein  87.46 
 
 		 325 aa  554  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2506  hypothetical protein  46.32 
 
 		 299 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0790  hypothetical protein  45.61 
 
 		 532 aa  265  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356616  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1984  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.18 
 
 		 305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.825306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2384  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.18 
 
 		 305 aa  249  6e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2187  hypothetical protein  45.33 
 
 		 308 aa  246  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0754091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  46.34 
 
 		 302 aa  241  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1225  hypothetical protein  47.74 
 
 		 306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1255  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.92 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.813345  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3877  hypothetical protein  41.78 
 
 		 320 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3210  hypothetical protein  44.75 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3236  hypothetical protein  43.9 
 
 		 325 aa  227  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2234  hypothetical protein  42.66 
 
 		 322 aa  226  7e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2881  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.38 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1079  hypothetical protein  44.06 
 
 		 323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.901985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  40 
 
 		 304 aa  192  6e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1985  integral membrane protein, DUF6  40.73 
 
 		 308 aa  188  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2236  hypothetical protein  39.22 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560501  normal  0.770615 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  33.33 
 
 		 302 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  36.92 
 
 		 281 aa  155  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.67 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.579422 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02208  hypothetical protein  32.17 
 
 		 313 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0562  hypothetical protein  30.16 
 
 		 328 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.368396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0331  hypothetical protein  25.77 
 
 		 322 aa  94.7  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.88 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  26.69 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  29.18 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.49 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.84 
 
 		 311 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.2 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.74 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  28.23 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  26.51 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.4 
 
 		 289 aa  65.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.76 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  27.34 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  26.05 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  26 
 
 		 302 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.56 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  23.28 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  25.91 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  23.3 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  22.99 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  26.09 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  23.3 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  26.09 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  23.1 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  23.81 
 
 		 303 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  25.33 
 
 		 289 aa  55.1  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.81 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.67 
 
 		 305 aa  53.9  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 		 298 aa  53.9  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  25.81 
 
 		 289 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  22.81 
 
 		 317 aa  53.9  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.83 
 
 		 298 aa  53.5  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1002  hypothetical protein  26.07 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.696154  normal  0.774388 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  25.75 
 
 		 309 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0371  hypothetical protein  23.48 
 
 		 315 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0749298  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.89 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.86 
 
 		 285 aa  51.6  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  23.24 
 
 		 325 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  24.6 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  24.79 
 
 		 402 aa  50.8  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2339  hypothetical protein  27.53 
 
 		 337 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0842181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  21.21 
 
 		 299 aa  50.1  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  24.92 
 
 		 305 aa  50.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0003  hypothetical protein  23.89 
 
 		 288 aa  49.7  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.83 
 
 		 310 aa  49.7  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  23.02 
 
 		 315 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  24.35 
 
 		 315 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  25.87 
 
 		 309 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.32 
 
 		 309 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.896113  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  25.87 
 
 		 309 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  25.87 
 
 		 309 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2106  hypothetical protein  26.4 
 
 		 288 aa  48.5  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.64 
 
 		 293 aa  48.9  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.41 
 
 		 303 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  26.18 
 
 		 309 aa  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  24.14 
 
 		 353 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  20.85 
 
 		 300 aa  48.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  21.86 
 
 		 302 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  21.86 
 
 		 302 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  26.04 
 
 		 297 aa  47.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  23.97 
 
 		 356 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  24.29 
 
 		 356 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  21.91 
 
 		 297 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  24.26 
 
 		 341 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  20.63 
 
 		 318 aa  47.4  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  23.97 
 
 		 356 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  23.97 
 
 		 356 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  24.29 
 
 		 356 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  23.97 
 
 		 356 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  24.08 
 
 		 304 aa  47  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.33 
 
 		 283 aa  46.6  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.15 
 
 		 313 aa  47  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.526494  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  21.94 
 
 		 316 aa  47  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1646  hypothetical protein  22.88 
 
 		 288 aa  46.6  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 307 aa  46.2  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0333  hypothetical protein  25.88 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.950508 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>