230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1079 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1079  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  625  1e-178  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.901985  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2234  hypothetical protein  80 
 
 
322 aa  462  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3877  hypothetical protein  73.08 
 
 
320 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3236  hypothetical protein  78.67 
 
 
325 aa  428  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3210  hypothetical protein  77.78 
 
 
309 aa  424  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1255  protein of unknown function DUF6 transmembrane  72.31 
 
 
316 aa  408  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.813345  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  65.45 
 
 
302 aa  367  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1225  hypothetical protein  64.92 
 
 
306 aa  357  1.9999999999999998e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2187  hypothetical protein  54.7 
 
 
308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0754091  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1984  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.96 
 
 
305 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.825306  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2384  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.48 
 
 
305 aa  279  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0790  hypothetical protein  48.73 
 
 
532 aa  271  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356616  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2506  hypothetical protein  48.32 
 
 
299 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1364  hypothetical protein  45.8 
 
 
325 aa  233  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2881  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.45 
 
 
306 aa  229  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  45.45 
 
 
304 aa  224  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.06 
 
 
382 aa  212  4.9999999999999996e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  44.29 
 
 
281 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1985  integral membrane protein, DUF6  46.67 
 
 
308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.33 
 
 
313 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.579422 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  34.25 
 
 
302 aa  169  5e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2236  hypothetical protein  39.66 
 
 
319 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560501  normal  0.770615 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02208  hypothetical protein  33.12 
 
 
313 aa  158  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0562  hypothetical protein  34.27 
 
 
328 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.368396  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0331  hypothetical protein  31.61 
 
 
322 aa  94  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.59 
 
 
310 aa  82  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  31.17 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  29.55 
 
 
289 aa  69.3  0.00000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  28.17 
 
 
304 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  28.64 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  30.17 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  27.62 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.92 
 
 
311 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  27.76 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  29.11 
 
 
312 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.24 
 
 
285 aa  64.7  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  26.8 
 
 
309 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  30.14 
 
 
330 aa  63.5  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 
292 aa  63.5  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  27.24 
 
 
309 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  30.73 
 
 
299 aa  63.2  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  28.16 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  22.46 
 
 
317 aa  62  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.72 
 
 
298 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  27.21 
 
 
309 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  27.21 
 
 
309 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  27.76 
 
 
308 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  27.12 
 
 
293 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  21.69 
 
 
296 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.22 
 
 
311 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.3 
 
 
296 aa  60.1  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  26.83 
 
 
305 aa  60.1  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  26.71 
 
 
302 aa  59.7  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.18 
 
 
295 aa  59.3  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1002  hypothetical protein  27.53 
 
 
312 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.696154  normal  0.774388 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1646  hypothetical protein  21.88 
 
 
288 aa  58.5  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  27.03 
 
 
299 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.59 
 
 
299 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  0.15573 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  27.02 
 
 
299 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  25.34 
 
 
305 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  26.61 
 
 
312 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  25.67 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  25.42 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  29.93 
 
 
293 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
289 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  29.86 
 
 
328 aa  57.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.16 
 
 
307 aa  57  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.84 
 
 
333 aa  57  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  26.32 
 
 
289 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  31.71 
 
 
309 aa  56.2  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  22.26 
 
 
303 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  28.75 
 
 
301 aa  55.8  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1646  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.53 
 
 
315 aa  55.8  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10380  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  26.01 
 
 
316 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142725  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  28.82 
 
 
319 aa  54.7  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  21.07 
 
 
303 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  24.35 
 
 
316 aa  53.5  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  25.33 
 
 
312 aa  53.5  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 
292 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  30 
 
 
353 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  27.75 
 
 
297 aa  53.1  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.76 
 
 
301 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0391  hypothetical protein  29.87 
 
 
331 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0346  hypothetical protein  29.91 
 
 
302 aa  53.1  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.85 
 
 
310 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 
289 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  29.73 
 
 
356 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 
298 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  25.36 
 
 
294 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2227  hypothetical protein  21.28 
 
 
305 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000184555  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  28.28 
 
 
341 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  29.73 
 
 
356 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  25.61 
 
 
293 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  29.73 
 
 
356 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  25.61 
 
 
293 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  22.58 
 
 
329 aa  51.2  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  27.39 
 
 
325 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  25.99 
 
 
345 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  29.73 
 
 
356 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  29.73 
 
 
356 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>