More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_27470 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  100 
 
 		 289 aa  556  1e-157  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  38.63 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  37.76 
 
 		 312 aa  158  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  37.77 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  37.41 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.66 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  36.33 
 
 		 397 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  38.31 
 
 		 302 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  39.34 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  37.41 
 
 		 309 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  36.59 
 
 		 309 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  36.69 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  36.69 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.17 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  32.99 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  32.99 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  34.26 
 
 		 353 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  34.26 
 
 		 356 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  34.26 
 
 		 356 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  34.26 
 
 		 356 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  34.26 
 
 		 356 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  34.26 
 
 		 356 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  34.26 
 
 		 356 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.83 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1002  hypothetical protein  33.33 
 
 		 312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.696154  normal  0.774388 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5553  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.59 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.32 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.31 
 
 		 310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.65 
 
 		 333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0003  hypothetical protein  27.84 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  29.86 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  30.36 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  30.77 
 
 		 294 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  30.53 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.04 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.53 
 
 		 285 aa  96.3  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.85 
 
 		 289 aa  91.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  28.33 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  27.95 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  32.84 
 
 		 316 aa  89.7  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1833  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.78 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.40235  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.04 
 
 		 313 aa  89  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.579422 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  25.27 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  30.8 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  29.73 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  24.71 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3236  hypothetical protein  28.71 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1985  integral membrane protein, DUF6  28.47 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  28.94 
 
 		 315 aa  79  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3210  hypothetical protein  29.7 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  27.46 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.69 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  29.09 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  28.98 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  28.79 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  27.2 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  24.44 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  28.41 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.7 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  26.46 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3877  hypothetical protein  27.91 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.57 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  0.15573 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  26.42 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1255  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.15 
 
 		 316 aa  72.4  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.813345  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.77 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.67 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4191  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.86 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.168223  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2384  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.61 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1984  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.43 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.825306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.14 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2234  hypothetical protein  27.06 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0790  hypothetical protein  26.21 
 
 		 532 aa  69.3  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356616  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2506  hypothetical protein  25.26 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1079  hypothetical protein  29.55 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.901985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1225  hypothetical protein  27.8 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  26.39 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  24.63 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.91 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.953682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  25.38 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.89 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.896113  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  26.3 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  28.22 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2187  hypothetical protein  27.33 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0754091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  28.57 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  25.44 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  25.87 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.32 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.66 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  25.19 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  27.56 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1442  hypothetical protein  27.88 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.231485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  24.24 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  24.58 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  24.24 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.47 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  24.18 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  25.66 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0562  hypothetical protein  26.78 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.368396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.97 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  26.13 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>