105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4450 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 299 aa  593  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  0.15573 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4191  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.6 
 
 		 298 aa  245  6e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.168223  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4861  hypothetical protein  30.54 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3769  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  32.67 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.547255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1545  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  32.13 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0256706  decreased coverage  0.0067742 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3349  hypothetical protein  32.34 
 
 		 302 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000303507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5181  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.52 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3418  drug/metabolite exporter family protein  32.34 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000357503  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3697  hypothetical protein  32.34 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3369  drug/metabolite exporter family protein  32.34 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00811973  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2366  hypothetical protein  31.18 
 
 		 298 aa  136  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.309949  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3704  transporter, drug/metabolite exporter family  32.34 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3680  transporter, drug/metabolite exporter family  32.34 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2318  hypothetical protein  32.98 
 
 		 302 aa  136  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000243844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4746  drug/metabolite transporter family membrane protein  28.94 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5146  hypothetical protein  28.94 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4902  hypothetical protein  28.94 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4765  drug/metabolite transporter family membrane protein  28.94 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5277  hypothetical protein  28.94 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0069  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  29.3 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5190  hypothetical protein  27.84 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5175  hypothetical protein  27.84 
 
 		 300 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2668  hypothetical protein  31.93 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.314138  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.72 
 
 		 312 aa  112  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0369938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1102  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  26.82 
 
 		 328 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.62 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000893438  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1175  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.31 
 
 		 327 aa  97.8  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.160476  normal  0.169958 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1713  hypothetical protein  25.42 
 
 		 321 aa  97.1  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.95 
 
 		 296 aa  89  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  24.48 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.35 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  28.03 
 
 		 309 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  28.28 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.25 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  27.18 
 
 		 397 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.55 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02208  hypothetical protein  26.46 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  26.14 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  27.74 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.36 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  27.74 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  27.74 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  27.59 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  27.5 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  25.61 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  26.57 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0196  hypothetical protein  23.26 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  28.24 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  25.68 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  26.92 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.78 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.54 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  24.58 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.3 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.34 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0742  hypothetical protein  27.88 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  27.91 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.579422 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  24.82 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.34 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4399  hypothetical protein  25.9 
 
 		 308 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  26.47 
 
 		 305 aa  52.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  26.3 
 
 		 308 aa  52.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  24.63 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0331  hypothetical protein  26.33 
 
 		 322 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  22.18 
 
 		 327 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1079  hypothetical protein  25.2 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.901985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1985  integral membrane protein, DUF6  25.78 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  23.9 
 
 		 402 aa  50.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.18 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  24.62 
 
 		 303 aa  49.7  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  24.15 
 
 		 308 aa  48.9  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0003  hypothetical protein  24.1 
 
 		 288 aa  49.3  0.00009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0371  hypothetical protein  22.9 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0749298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  23.9 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2930  protein of unknown function DUF6 transmembrane  19.91 
 
 		 316 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4331  hypothetical protein  28.33 
 
 		 316 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2187  hypothetical protein  25.78 
 
 		 308 aa  47  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0754091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  23.49 
 
 		 315 aa  47  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  24.74 
 
 		 308 aa  46.6  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2802  hypothetical protein  24.72 
 
 		 278 aa  46.6  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10684  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0911  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.77 
 
 		 294 aa  46.2  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0168694  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  24.05 
 
 		 294 aa  46.6  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1364  hypothetical protein  24.25 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1646  hypothetical protein  20.77 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0837  threonine and homoserine efflux system  23.46 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0124814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.76 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  27.53 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.88 
 
 		 289 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0962  threonine and homoserine efflux system  23.46 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0232509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.69 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.296277  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00780  threonine and homoserine efflux system  23.46 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2829  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.46 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0520778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0870  threonine and homoserine efflux system  23.46 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096225  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0883  threonine and homoserine efflux system  23.46 
 
 		 295 aa  43.9  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000921417  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2830  threonine and homoserine efflux system  23.46 
 
 		 295 aa  43.9  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2535  threonine and homoserine efflux system  23.46 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000316984  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00797  hypothetical protein  23.46 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1002  hypothetical protein  24.82 
 
 		 312 aa  43.1  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.696154  normal  0.774388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  28.08 
 
 		 309 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>