47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2668 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2668  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  565  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.314138  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4861  hypothetical protein  43.71 
 
 
300 aa  242  5e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1545  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  44.29 
 
 
304 aa  239  5e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0256706  decreased coverage  0.0067742 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3697  hypothetical protein  44.07 
 
 
302 aa  237  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3769  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  44.07 
 
 
302 aa  238  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.547255  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3704  transporter, drug/metabolite exporter family  44.07 
 
 
302 aa  237  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3680  transporter, drug/metabolite exporter family  44.07 
 
 
302 aa  237  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3418  drug/metabolite exporter family protein  44.07 
 
 
302 aa  237  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000357503  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3369  drug/metabolite exporter family protein  44.07 
 
 
302 aa  237  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00811973  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3349  hypothetical protein  44.48 
 
 
302 aa  236  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000303507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5181  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  43.01 
 
 
300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2318  hypothetical protein  42.37 
 
 
302 aa  230  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000243844  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5190  hypothetical protein  42.76 
 
 
300 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5146  hypothetical protein  42.27 
 
 
300 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4765  drug/metabolite transporter family membrane protein  42.76 
 
 
300 aa  223  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4746  drug/metabolite transporter family membrane protein  42.27 
 
 
300 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5175  hypothetical protein  42.61 
 
 
300 aa  223  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4902  hypothetical protein  42.27 
 
 
300 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5277  hypothetical protein  42.27 
 
 
300 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0069  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  43.36 
 
 
300 aa  222  6e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1713  hypothetical protein  40.46 
 
 
321 aa  204  1e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165922  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1102  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  36.21 
 
 
328 aa  170  3e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.99 
 
 
312 aa  156  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0369938  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 
319 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000893438  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1175  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.22 
 
 
327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.160476  normal  0.169958 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.93 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  0.15573 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4191  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.45 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.168223  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2366  hypothetical protein  29.56 
 
 
298 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.309949  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0366  membrane protein  64.86 
 
 
79 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.57 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.42 
 
 
295 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  23.92 
 
 
302 aa  65.9  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.74 
 
 
313 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.579422 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.79 
 
 
309 aa  60.8  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.15 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.8 
 
 
310 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0331  hypothetical protein  21.65 
 
 
322 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.07 
 
 
298 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1861  hypothetical protein  24.68 
 
 
297 aa  46.2  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.654734  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  25.35 
 
 
302 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2875  threonine and homoserine efflux system  25.9 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00290146  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4738  hypothetical protein  23.9 
 
 
295 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5553  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.33 
 
 
332 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2802  hypothetical protein  26.89 
 
 
278 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10684  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.03 
 
 
310 aa  43.5  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  20.64 
 
 
327 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.56 
 
 
311 aa  42.7  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.273134 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>