39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1175 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1175  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
327 aa  638    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.160476  normal  0.169958 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  65.18 
 
 
312 aa  388  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0369938  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1545  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  37.38 
 
 
304 aa  178  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0256706  decreased coverage  0.0067742 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3349  hypothetical protein  37.88 
 
 
302 aa  176  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000303507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3769  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  38.23 
 
 
302 aa  176  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.547255  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3697  hypothetical protein  37.88 
 
 
302 aa  176  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3418  drug/metabolite exporter family protein  37.88 
 
 
302 aa  176  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000357503  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3369  drug/metabolite exporter family protein  37.88 
 
 
302 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00811973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3680  transporter, drug/metabolite exporter family  37.88 
 
 
302 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3704  transporter, drug/metabolite exporter family  37.88 
 
 
302 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1102  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  36.17 
 
 
328 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2318  hypothetical protein  36.69 
 
 
302 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000243844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5181  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  32.04 
 
 
300 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4861  hypothetical protein  32.04 
 
 
300 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5175  hypothetical protein  32.14 
 
 
300 aa  143  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2668  hypothetical protein  34.13 
 
 
292 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.314138  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0069  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  31.05 
 
 
300 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4746  drug/metabolite transporter family membrane protein  31.79 
 
 
300 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5190  hypothetical protein  31.79 
 
 
300 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5146  hypothetical protein  31.79 
 
 
300 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4902  hypothetical protein  31.79 
 
 
300 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4765  drug/metabolite transporter family membrane protein  31.79 
 
 
300 aa  139  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5277  hypothetical protein  31.79 
 
 
300 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4191  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.91 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.168223  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1713  hypothetical protein  30.92 
 
 
321 aa  123  5e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165922  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.31 
 
 
299 aa  122  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  0.15573 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2366  hypothetical protein  28.1 
 
 
298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.309949  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.06 
 
 
319 aa  97.4  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000893438  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.18 
 
 
310 aa  60.8  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5553  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.21 
 
 
332 aa  53.1  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3877  hypothetical protein  26.98 
 
 
320 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  26.37 
 
 
290 aa  50.8  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  22.34 
 
 
317 aa  49.7  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  24.34 
 
 
315 aa  46.2  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  27.51 
 
 
317 aa  45.8  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.54 
 
 
310 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.44 
 
 
298 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  27.27 
 
 
309 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  26.94 
 
 
309 aa  42.4  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>