40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1102 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1102  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  100 
 
 
328 aa  652    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3769  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  36.94 
 
 
302 aa  202  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.547255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1545  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  37.07 
 
 
304 aa  203  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0256706  decreased coverage  0.0067742 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3418  drug/metabolite exporter family protein  37.26 
 
 
302 aa  202  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000357503  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3697  hypothetical protein  36.94 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3704  transporter, drug/metabolite exporter family  36.94 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3680  transporter, drug/metabolite exporter family  36.94 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3369  drug/metabolite exporter family protein  36.94 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00811973  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2318  hypothetical protein  37.07 
 
 
302 aa  199  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000243844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5181  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  34.43 
 
 
300 aa  197  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4861  hypothetical protein  35.08 
 
 
300 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3349  hypothetical protein  37.46 
 
 
302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000303507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0069  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  34.43 
 
 
300 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5277  hypothetical protein  34.44 
 
 
300 aa  185  8e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4902  hypothetical protein  34.44 
 
 
300 aa  185  8e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5146  hypothetical protein  34.44 
 
 
300 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5175  hypothetical protein  34.44 
 
 
300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4746  drug/metabolite transporter family membrane protein  34.44 
 
 
300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4765  drug/metabolite transporter family membrane protein  34.44 
 
 
300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5190  hypothetical protein  34.1 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1713  hypothetical protein  35.17 
 
 
321 aa  181  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165922  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.08 
 
 
312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0369938  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2668  hypothetical protein  36.21 
 
 
292 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.314138  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1175  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.48 
 
 
327 aa  160  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.160476  normal  0.169958 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2366  hypothetical protein  30.96 
 
 
298 aa  126  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.309949  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.82 
 
 
299 aa  116  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  0.15573 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4191  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.38 
 
 
298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.168223  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.18 
 
 
319 aa  88.2  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000893438  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  27.78 
 
 
293 aa  55.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 
311 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.73 
 
 
309 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  29.55 
 
 
315 aa  50.1  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.7 
 
 
296 aa  49.7  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.36 
 
 
310 aa  47.4  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  33.33 
 
 
312 aa  46.2  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
312 aa  46.2  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0366  membrane protein  39.39 
 
 
79 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  25.27 
 
 
397 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  25.52 
 
 
305 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  24.47 
 
 
309 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>