55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2366 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2366  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  576  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.309949  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3349  hypothetical protein  39.13 
 
 
302 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000303507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1545  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  39.13 
 
 
304 aa  182  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0256706  decreased coverage  0.0067742 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3769  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  39.13 
 
 
302 aa  182  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.547255  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3369  drug/metabolite exporter family protein  38.8 
 
 
302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00811973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3680  transporter, drug/metabolite exporter family  38.8 
 
 
302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3418  drug/metabolite exporter family protein  38.8 
 
 
302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000357503  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3704  transporter, drug/metabolite exporter family  38.8 
 
 
302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3697  hypothetical protein  38.8 
 
 
302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4861  hypothetical protein  36.86 
 
 
300 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5181  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  35.49 
 
 
300 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2318  hypothetical protein  38.51 
 
 
302 aa  177  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000243844  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4191  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.27 
 
 
298 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.168223  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5146  hypothetical protein  36.26 
 
 
300 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5277  hypothetical protein  36.26 
 
 
300 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4902  hypothetical protein  36.26 
 
 
300 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4765  drug/metabolite transporter family membrane protein  36.26 
 
 
300 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4746  drug/metabolite transporter family membrane protein  35.9 
 
 
300 aa  170  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5175  hypothetical protein  35.9 
 
 
300 aa  169  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5190  hypothetical protein  36.26 
 
 
300 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0069  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  34.91 
 
 
300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.28 
 
 
299 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  0.15573 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1713  hypothetical protein  31.19 
 
 
321 aa  145  9e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165922  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.51 
 
 
312 aa  144  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0369938  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1102  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  32.29 
 
 
328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2668  hypothetical protein  29.72 
 
 
292 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.314138  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1175  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.57 
 
 
327 aa  108  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.160476  normal  0.169958 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.81 
 
 
319 aa  85.9  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000893438  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.55 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  25.26 
 
 
317 aa  61.2  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.95 
 
 
296 aa  55.8  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  26.09 
 
 
296 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  24.5 
 
 
302 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
284 aa  54.3  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  23.91 
 
 
289 aa  52  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  25.44 
 
 
304 aa  50.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  24.15 
 
 
303 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.61 
 
 
298 aa  50.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.66 
 
 
295 aa  50.4  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0366  membrane protein  39.73 
 
 
79 aa  50.1  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  23.96 
 
 
300 aa  50.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.79 
 
 
298 aa  49.3  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.17 
 
 
285 aa  48.5  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0003  hypothetical protein  24.13 
 
 
288 aa  48.5  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  25.09 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1861  hypothetical protein  24.54 
 
 
297 aa  47.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.654734  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.85 
 
 
282 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317569  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.7 
 
 
310 aa  46.6  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0911  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.38 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0168694  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  23.69 
 
 
315 aa  44.3  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  23.3 
 
 
300 aa  43.5  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  20.42 
 
 
315 aa  42.7  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1985  integral membrane protein, DUF6  19.6 
 
 
308 aa  42.7  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1833  protein of unknown function DUF6 transmembrane  19.8 
 
 
291 aa  42.4  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.40235  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0634  DMT family permease  27.92 
 
 
300 aa  42.7  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.190735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>