More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0341 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  584  1e-166  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  94.39 
 
 
303 aa  555  1e-157  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  95.61 
 
 
296 aa  555  1e-157  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0003  hypothetical protein  63.76 
 
 
288 aa  363  2e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  34.06 
 
 
294 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  31.01 
 
 
302 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.15 
 
 
298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.12 
 
 
298 aa  133  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.35 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  34.69 
 
 
308 aa  129  6e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  34 
 
 
308 aa  125  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29 
 
 
309 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.896113  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  30 
 
 
289 aa  105  8e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  27.65 
 
 
309 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  27.65 
 
 
309 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  30.48 
 
 
316 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  26.6 
 
 
397 aa  99  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.12 
 
 
311 aa  96.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_002950  PG0333  hypothetical protein  29.66 
 
 
302 aa  97.1  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.950508 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  28.23 
 
 
402 aa  96.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  27.3 
 
 
309 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  26.67 
 
 
309 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  25.96 
 
 
309 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  25.96 
 
 
309 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.95 
 
 
310 aa  89  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  28.28 
 
 
356 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  28.28 
 
 
356 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  28.28 
 
 
356 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  28.28 
 
 
356 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  27.93 
 
 
353 aa  85.5  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  27.93 
 
 
356 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1833  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.89 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.40235  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  27.93 
 
 
356 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.03 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  24.73 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  25 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  24.1 
 
 
305 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  26.46 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  24.75 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.51 
 
 
282 aa  79  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317569  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  24.03 
 
 
300 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 
289 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5553  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.17 
 
 
332 aa  73.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  24.66 
 
 
304 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  24 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1002  hypothetical protein  24.5 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.696154  normal  0.774388 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.38 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  23.13 
 
 
317 aa  65.5  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00780  threonine and homoserine efflux system  28.22 
 
 
295 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2829  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.22 
 
 
295 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0520778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0870  threonine and homoserine efflux system  28.22 
 
 
295 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096225  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2830  threonine and homoserine efflux system  28.22 
 
 
295 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2535  threonine and homoserine efflux system  28.22 
 
 
295 aa  64.7  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000316984  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  25.89 
 
 
324 aa  65.1  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00797  hypothetical protein  28.22 
 
 
295 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0962  threonine and homoserine efflux system  28.22 
 
 
299 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0232509  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0883  threonine and homoserine efflux system  28.22 
 
 
295 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000921417  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0837  threonine and homoserine efflux system  28.22 
 
 
295 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0124814  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  23.37 
 
 
302 aa  63.9  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3425  hypothetical protein  25.84 
 
 
292 aa  63.5  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.17 
 
 
313 aa  62.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.579422 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0320  hypothetical protein  24.91 
 
 
310 aa  60.1  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.87 
 
 
289 aa  59.7  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  27.57 
 
 
298 aa  59.7  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.44 
 
 
307 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.810804  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.34 
 
 
296 aa  59.3  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02208  hypothetical protein  25.09 
 
 
313 aa  58.9  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2881  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.6 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.61 
 
 
333 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2234  hypothetical protein  20.42 
 
 
322 aa  58.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1515  hypothetical protein  23.96 
 
 
273 aa  57.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.910638  normal  0.799854 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.82 
 
 
310 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1991  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.72 
 
 
300 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  25.91 
 
 
294 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.72 
 
 
300 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.618176 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0269  hypothetical protein  26.75 
 
 
583 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  20.83 
 
 
315 aa  56.6  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  26.67 
 
 
312 aa  56.2  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01032  Transporter involved in threonine and homoserine efflux  33.33 
 
 
290 aa  56.2  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.614417  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1079  hypothetical protein  21.74 
 
 
323 aa  56.6  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.901985  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  27.24 
 
 
294 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2766  hypothetical protein  27.34 
 
 
281 aa  55.8  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830467  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  27.18 
 
 
294 aa  55.8  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1300  threonine and homoserine efflux system  28.83 
 
 
295 aa  55.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.332206  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3236  hypothetical protein  20.22 
 
 
325 aa  55.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0350  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.64 
 
 
290 aa  55.5  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.92 
 
 
296 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.296277  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  26.87 
 
 
294 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1985  integral membrane protein, DUF6  24.67 
 
 
308 aa  54.3  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  31.86 
 
 
288 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  24.32 
 
 
281 aa  53.9  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  22.87 
 
 
293 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.82 
 
 
290 aa  54.3  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  23.17 
 
 
302 aa  53.1  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  26.01 
 
 
287 aa  52.8  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  24.63 
 
 
296 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.58 
 
 
292 aa  52.8  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.81 
 
 
283 aa  52.4  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  26.59 
 
 
294 aa  52.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>