137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1515 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1515  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  527  1e-149  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.910638  normal  0.799854 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1225  hypothetical protein  28.88 
 
 
274 aa  97.1  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000294223  normal  0.640031 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  29.68 
 
 
294 aa  89  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  27.94 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  27.76 
 
 
317 aa  83.2  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  27.6 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  26.39 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.52 
 
 
296 aa  69.3  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.72 
 
 
311 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.7 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  26.81 
 
 
294 aa  65.9  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  28.35 
 
 
316 aa  65.1  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  25.08 
 
 
315 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.17 
 
 
309 aa  63.2  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.73 
 
 
311 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1445  hypothetical protein  29.92 
 
 
261 aa  60.1  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.154622 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0465  hypothetical protein  24.9 
 
 
270 aa  60.1  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0969494  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.44 
 
 
310 aa  59.7  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.38 
 
 
293 aa  60.1  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.67 
 
 
300 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.3 
 
 
278 aa  59.7  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  29.08 
 
 
308 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.02 
 
 
323 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  26.19 
 
 
308 aa  58.9  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  24.83 
 
 
296 aa  58.9  0.00000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  28.29 
 
 
300 aa  57.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  24.34 
 
 
296 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 
298 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  23.97 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.81 
 
 
321 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.05 
 
 
325 aa  57  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.95 
 
 
298 aa  56.2  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  29.83 
 
 
294 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0534  hypothetical protein  28.63 
 
 
261 aa  55.8  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.055739 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  29.83 
 
 
294 aa  55.8  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  25.81 
 
 
315 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3346  hypothetical protein  24.44 
 
 
331 aa  55.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.15 
 
 
303 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  23.26 
 
 
303 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.73 
 
 
317 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  25.69 
 
 
291 aa  53.5  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  29.3 
 
 
312 aa  53.1  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0438  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.2 
 
 
316 aa  53.1  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  24.66 
 
 
307 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0003  hypothetical protein  27.46 
 
 
288 aa  51.2  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0911  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.83 
 
 
294 aa  51.6  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0168694  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0088  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 
290 aa  50.4  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.529373  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.11 
 
 
293 aa  50.4  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2279  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.48 
 
 
301 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136903  normal  0.215844 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3095  integral membrane protein  25.93 
 
 
294 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194858  normal  0.101185 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0320  hypothetical protein  22.99 
 
 
310 aa  49.7  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0829  hypothetical protein  28.42 
 
 
267 aa  49.7  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  25.28 
 
 
302 aa  49.7  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.98 
 
 
310 aa  49.3  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  25.78 
 
 
317 aa  49.3  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  39.39 
 
 
353 aa  48.9  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  39.39 
 
 
356 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  29 
 
 
308 aa  48.9  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  39.39 
 
 
356 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  39.39 
 
 
356 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  39.39 
 
 
356 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  26.7 
 
 
294 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1002  hypothetical protein  26.59 
 
 
312 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.696154  normal  0.774388 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0391  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.84 
 
 
287 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598398  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  39.39 
 
 
356 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  39.39 
 
 
402 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  23.49 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  26.97 
 
 
289 aa  48.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  39.39 
 
 
356 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3097  hypothetical protein  25.63 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27047  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  23.53 
 
 
303 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25270  predicted permease, DMT superfamily  25.25 
 
 
291 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.206  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  25.27 
 
 
308 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  22.38 
 
 
288 aa  48.1  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.76 
 
 
313 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.579422 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  25 
 
 
294 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  33.33 
 
 
302 aa  46.6  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0331  hypothetical protein  22.3 
 
 
322 aa  46.6  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  25 
 
 
324 aa  47  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2455  hypothetical protein  26.78 
 
 
272 aa  46.6  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  28.5 
 
 
308 aa  46.6  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.14 
 
 
297 aa  46.6  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  26.7 
 
 
294 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00548  membrane protein  23.79 
 
 
291 aa  45.8  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  25.65 
 
 
294 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.89 
 
 
301 aa  45.8  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.138345  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1892  transporter, EamA family  25.18 
 
 
322 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0271761  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  25.65 
 
 
294 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  24.47 
 
 
322 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  24.81 
 
 
318 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02208  hypothetical protein  25.58 
 
 
313 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1633  hypothetical protein  23.76 
 
 
321 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  21.48 
 
 
288 aa  45.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4015  carboxylate/amino acid/amine transporter  24.25 
 
 
307 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972202  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3008  hypothetical protein  22.11 
 
 
333 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.645099  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  24.44 
 
 
290 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  23.92 
 
 
307 aa  44.3  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4167  carboxylate/amino acid/amine transporter  23.92 
 
 
307 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03485  hypothetical protein  23.92 
 
 
307 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>