114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0829 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0829  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  494  1e-139  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0465  hypothetical protein  60.87 
 
 		 270 aa  250  1e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0969494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1445  hypothetical protein  65 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.154622 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0534  hypothetical protein  66.14 
 
 		 261 aa  221  9e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.055739 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1225  hypothetical protein  44.44 
 
 		 274 aa  182  6e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000294223  normal  0.640031 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1515  hypothetical protein  28 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.910638  normal  0.799854 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1435  hypothetical protein  33.87 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.87 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2425  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.87 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0911  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.07 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0168694  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  28.47 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.73 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.07 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  33.14 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  33.14 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  33.03 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0320  hypothetical protein  22.76 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  28.51 
 
 		 308 aa  53.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2802  hypothetical protein  32.52 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10684  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  33.14 
 
 		 309 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  31.4 
 
 		 397 aa  53.1  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  26.98 
 
 		 298 aa  52.8  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.93 
 
 		 323 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0244  hypothetical protein  30.73 
 
 		 310 aa  52.4  0.000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 295 aa  52.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.11 
 
 		 289 aa  52  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  32.56 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3333  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.54 
 
 		 293 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222315  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  32.56 
 
 		 309 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  32.56 
 
 		 309 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  26.09 
 
 		 304 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.47 
 
 		 313 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.579422 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0929  hypothetical protein  30.95 
 
 		 292 aa  51.2  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  23.67 
 
 		 308 aa  50.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.98 
 
 		 288 aa  49.7  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  29.26 
 
 		 307 aa  50.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  23.67 
 
 		 308 aa  49.7  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.76 
 
 		 317 aa  49.3  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.41 
 
 		 301 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  28.64 
 
 		 297 aa  48.9  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.24 
 
 		 335 aa  48.9  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  25.54 
 
 		 300 aa  48.9  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  26.56 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3085  hypothetical protein  29.26 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0753098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.19 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  30.81 
 
 		 402 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  25.1 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.06 
 
 		 310 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  27.51 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  30.26 
 
 		 308 aa  47  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  30.16 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  23.93 
 
 		 302 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.84 
 
 		 277 aa  47  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  27.51 
 
 		 312 aa  47  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  28.2 
 
 		 315 aa  46.6  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  31.23 
 
 		 294 aa  46.6  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  30.08 
 
 		 297 aa  47  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3359  hypothetical protein  31.45 
 
 		 311 aa  46.6  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.76 
 
 		 282 aa  46.6  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4855  hypothetical protein  31.91 
 
 		 285 aa  46.2  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01032  Transporter involved in threonine and homoserine efflux  30.25 
 
 		 290 aa  46.2  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.614417  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2634  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.46 
 
 		 280 aa  45.4  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  29.26 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  23.03 
 
 		 289 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  30.38 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2766  hypothetical protein  20.26 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830467  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2394  hypothetical protein  28.14 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.319154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5689  hypothetical protein  25.64 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0190255  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  31.58 
 
 		 356 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  26.77 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  28.36 
 
 		 317 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.09 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  31.58 
 
 		 356 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  31.58 
 
 		 356 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  31.58 
 
 		 356 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  26.61 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0837  threonine and homoserine efflux system  30.29 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0124814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1687  threonine/homoserine efflux transporter  27.6 
 
 		 315 aa  43.9  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00780  threonine and homoserine efflux system  30.29 
 
 		 295 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2829  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.29 
 
 		 295 aa  43.5  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0520778  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2658  hypothetical protein  29.71 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2703  hypothetical protein  29.71 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.75974  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2688  hypothetical protein  29.71 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  24.19 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0870  threonine and homoserine efflux system  30.29 
 
 		 295 aa  43.5  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096225  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0883  threonine and homoserine efflux system  30.29 
 
 		 295 aa  43.5  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000921417  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2830  threonine and homoserine efflux system  30.29 
 
 		 295 aa  43.5  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2535  threonine and homoserine efflux system  30.29 
 
 		 295 aa  43.5  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000316984  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00797  hypothetical protein  30.29 
 
 		 295 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  27.89 
 
 		 304 aa  43.5  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0962  threonine and homoserine efflux system  30.29 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0232509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.46 
 
 		 298 aa  43.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  32.24 
 
 		 307 aa  42.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.25 
 
 		 324 aa  42.7  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  28.36 
 
 		 302 aa  42.7  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3902  hypothetical protein  36.25 
 
 		 309 aa  42.7  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.773994  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0130  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.79 
 
 		 325 aa  42.7  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0233351  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.4 
 
 		 310 aa  42.7  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  28 
 
 		 311 aa  42.7  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24340  predicted permease, DMT superfamily  32.17 
 
 		 287 aa  42.4  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557722  normal  0.167703 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>