62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0465 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0465  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  510  1e-143  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0969494  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0829  hypothetical protein  61.3 
 
 
267 aa  228  7e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1445  hypothetical protein  57.41 
 
 
261 aa  228  9e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.154622 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0534  hypothetical protein  58.56 
 
 
261 aa  215  7e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.055739 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1225  hypothetical protein  41.79 
 
 
274 aa  185  7e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000294223  normal  0.640031 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1515  hypothetical protein  24.53 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.910638  normal  0.799854 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0320  hypothetical protein  24.33 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  29.97 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  22.87 
 
 
300 aa  64.3  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.15 
 
 
278 aa  61.6  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  29.27 
 
 
317 aa  60.5  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1435  hypothetical protein  31.4 
 
 
327 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 
300 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  25.13 
 
 
289 aa  55.5  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.62 
 
 
282 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2425  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.62 
 
 
282 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  30.81 
 
 
317 aa  53.1  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.52 
 
 
296 aa  52.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.61 
 
 
289 aa  52.4  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  23.31 
 
 
304 aa  51.6  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.73 
 
 
293 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4038  hypothetical protein  26.05 
 
 
287 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  29.49 
 
 
315 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.38 
 
 
310 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.98 
 
 
289 aa  50.4  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  21.7 
 
 
298 aa  50.4  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  22.32 
 
 
308 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  22.88 
 
 
300 aa  50.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.97 
 
 
323 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  23.08 
 
 
308 aa  50.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00548  membrane protein  24.76 
 
 
291 aa  49.7  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.14 
 
 
295 aa  48.9  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.17 
 
 
293 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0149413 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0876  integral membrane protein  26.05 
 
 
290 aa  48.5  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00907858  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  27.9 
 
 
308 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2634  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.29 
 
 
280 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0947  integral membrane protein  26.05 
 
 
290 aa  48.1  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114087  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  27.62 
 
 
291 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1617  transporter  27.75 
 
 
296 aa  46.6  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  31.4 
 
 
297 aa  46.2  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0911  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.31 
 
 
294 aa  45.8  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0168694  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0237  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.79 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.792504  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.43 
 
 
313 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.579422 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  25.65 
 
 
290 aa  45.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2802  hypothetical protein  30.89 
 
 
278 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10684  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0627  hypothetical protein  30.61 
 
 
290 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  23.23 
 
 
293 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0243  hypothetical protein  28.03 
 
 
299 aa  43.9  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.19 
 
 
317 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.81 
 
 
317 aa  43.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.96 
 
 
282 aa  43.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317569  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 
299 aa  43.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  28.82 
 
 
294 aa  43.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  26.91 
 
 
295 aa  42.7  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1010  integral membrane protein  30.77 
 
 
150 aa  42.7  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00787572  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3359  hypothetical protein  26.67 
 
 
311 aa  42.7  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1606  hypothetical protein  30 
 
 
297 aa  42.7  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262739  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03168  permease of the drug/metabolite transporter  25.89 
 
 
347 aa  42.4  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11064  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.94 
 
 
309 aa  42.7  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2394  hypothetical protein  27.89 
 
 
281 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.319154  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  30.12 
 
 
296 aa  42.4  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  25.71 
 
 
315 aa  42  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>