More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0237 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0237  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
299 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.792504  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0243  hypothetical protein  98.66 
 
 
299 aa  566  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0298  hypothetical protein  83.9 
 
 
297 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1606  hypothetical protein  75.93 
 
 
297 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262739  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  41.55 
 
 
288 aa  157  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  30.82 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  35.45 
 
 
317 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.48 
 
 
293 aa  122  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.373624  normal  0.289625 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.78 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.364061  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.83 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0068  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.79 
 
 
304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0056  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.92 
 
 
304 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0052  hypothetical protein  35.79 
 
 
304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  30.74 
 
 
295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  30.39 
 
 
302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  29.1 
 
 
299 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  30.74 
 
 
295 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.12 
 
 
315 aa  105  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  32.99 
 
 
299 aa  105  9e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  26.73 
 
 
322 aa  102  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0163  hypothetical protein  23.53 
 
 
288 aa  102  8e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.532161  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 
293 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.89 
 
 
294 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 
300 aa  100  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  27.21 
 
 
305 aa  100  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  31.53 
 
 
300 aa  99.4  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  30.99 
 
 
305 aa  99.8  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1406  hypothetical protein  31.46 
 
 
312 aa  99.4  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0365604  normal  0.0466705 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3301  hypothetical protein  26.16 
 
 
296 aa  99.4  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00885964  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0849  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.4 
 
 
290 aa  99.4  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266368  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.98 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  29.57 
 
 
301 aa  98.6  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  28.98 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.68 
 
 
289 aa  97.4  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  28.62 
 
 
295 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  29.58 
 
 
288 aa  95.1  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.09 
 
 
312 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  25.53 
 
 
277 aa  94.4  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1696  hypothetical protein  30.85 
 
 
298 aa  93.6  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.591039 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  29.79 
 
 
288 aa  94  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.32 
 
 
296 aa  93.6  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97109  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32535  predicted protein  27.2 
 
 
370 aa  92.8  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.264951  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0350  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.26 
 
 
290 aa  92.4  8e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  27.24 
 
 
298 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.9 
 
 
343 aa  91.7  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.24 
 
 
289 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48145  predicted protein  29.47 
 
 
462 aa  90.9  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.196185  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  26.26 
 
 
301 aa  91.3  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0053  hypothetical protein  34.38 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.261978 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.35 
 
 
312 aa  91.3  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  33.76 
 
 
323 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1656  permeases of the drug/metabolite transporter  25.76 
 
 
307 aa  90.5  3e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.87 
 
 
297 aa  90.1  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.33 
 
 
301 aa  90.1  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0145  hypothetical protein  29.72 
 
 
299 aa  89.4  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  27.46 
 
 
303 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1116  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.18 
 
 
295 aa  89  8e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3470  hypothetical protein  30.63 
 
 
312 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461647  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  32.17 
 
 
316 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  31.82 
 
 
358 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.43 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5197  hypothetical protein  27.99 
 
 
288 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5662  hypothetical protein  27.99 
 
 
288 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33726  predicted protein  31.72 
 
 
486 aa  87  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  26.1 
 
 
306 aa  87  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3091  hypothetical protein  30.5 
 
 
294 aa  87  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1854  hypothetical protein  33.75 
 
 
316 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.135486 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3251  hypothetical protein  28.72 
 
 
311 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184302  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  27.15 
 
 
303 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.18 
 
 
308 aa  85.9  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0457  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.62 
 
 
313 aa  85.5  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  27.05 
 
 
303 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  27.05 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  27.05 
 
 
303 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  30.4 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  27.05 
 
 
303 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  25.74 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1518  hypothetical protein  29.39 
 
 
307 aa  84.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  27.05 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.44 
 
 
302 aa  84  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  32.26 
 
 
308 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  30.07 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  28.28 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  26.07 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  26.8 
 
 
303 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  30.42 
 
 
314 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  26.03 
 
 
294 aa  82.4  0.000000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0138  hypothetical protein  33.22 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.99 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  31.95 
 
 
297 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  30.2 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  30.2 
 
 
303 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.99 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1360  hypothetical protein  32.23 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170247  hitchhiker  0.00808749 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  28.62 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.34 
 
 
308 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.53 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2556  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 
302 aa  79  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782604  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.54 
 
 
304 aa  79  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3336  hypothetical protein  29.66 
 
 
325 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.547457  normal  0.396992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>