176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1116 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1116  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
295 aa  555  1e-157  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.58 
 
 
296 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97109  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  32.06 
 
 
319 aa  119  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  27.99 
 
 
301 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 
301 aa  109  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  32.49 
 
 
286 aa  109  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 
312 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  30.71 
 
 
293 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  30.96 
 
 
294 aa  105  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.28 
 
 
283 aa  102  6e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  26.85 
 
 
303 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  26.85 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  26.85 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.57 
 
 
343 aa  97.8  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  31.58 
 
 
296 aa  97.1  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  27.18 
 
 
301 aa  96.7  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  26.51 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  26.85 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  26.51 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  26.17 
 
 
303 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  26.51 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  25.84 
 
 
301 aa  94  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  28.52 
 
 
298 aa  92.4  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0457  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.37 
 
 
313 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1606  hypothetical protein  33.68 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262739  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0145  hypothetical protein  32.97 
 
 
299 aa  90.9  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.61 
 
 
302 aa  90.5  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  26.55 
 
 
301 aa  89.4  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.45 
 
 
289 aa  88.6  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  33.22 
 
 
308 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3091  hypothetical protein  30.88 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0298  hypothetical protein  33.23 
 
 
297 aa  86.7  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0138  hypothetical protein  34.04 
 
 
292 aa  85.1  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5197  hypothetical protein  27.56 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5662  hypothetical protein  27.56 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  28.52 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  31.16 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.01 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  28.4 
 
 
294 aa  82.8  0.000000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0243  hypothetical protein  34.02 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  31.85 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  28.24 
 
 
322 aa  81.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.66 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  29.62 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  32.88 
 
 
317 aa  80.5  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0237  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.68 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.792504  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.58 
 
 
308 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.91 
 
 
293 aa  79  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24860  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  27.71 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1656  permeases of the drug/metabolite transporter  25.1 
 
 
307 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0073  hypothetical protein  27.2 
 
 
282 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  27.08 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.27 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.45 
 
 
297 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.78 
 
 
297 aa  77  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  29.51 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  29.2 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  30.07 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.19 
 
 
308 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  28.92 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  27.37 
 
 
295 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.37 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4403  hypothetical protein  25.2 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0375849  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  27.37 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  28.4 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.47 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  28.73 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0068  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.89 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0052  hypothetical protein  30.47 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  28.83 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  28.01 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  30.63 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  30.6 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1728  permeases of the drug/metabolite transporter  26.51 
 
 
302 aa  72  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  24.64 
 
 
277 aa  71.6  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  30.25 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3470  hypothetical protein  28.08 
 
 
312 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461647  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.08 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  27.76 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  26.71 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.69 
 
 
252 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00124524  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  28.05 
 
 
336 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0056  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.42 
 
 
304 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1406  hypothetical protein  26.43 
 
 
312 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0365604  normal  0.0466705 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1560  hypothetical protein  25.78 
 
 
304 aa  68.9  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.590181  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  26.46 
 
 
288 aa  67  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1658  hypothetical protein  31.85 
 
 
300 aa  67  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3674  hypothetical protein  28.66 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.393093 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4511  hypothetical protein  28.66 
 
 
309 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.2378  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3853  hypothetical protein  28.66 
 
 
309 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.72 
 
 
308 aa  67  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461902  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4892  hypothetical protein  28.92 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131621  hitchhiker  0.000211269 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3251  hypothetical protein  26.92 
 
 
311 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184302  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  23.81 
 
 
299 aa  65.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  26.44 
 
 
288 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.64 
 
 
315 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0053  hypothetical protein  32.68 
 
 
300 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.261978 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 
294 aa  64.3  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.09 
 
 
287 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0425845  normal  0.73102 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>