119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0244 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0244  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  612  9.999999999999999e-175  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1687  threonine/homoserine efflux transporter  56.59 
 
 		 315 aa  357  9.999999999999999e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.91 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34860  predicted permease, DMT superfamily  29.87 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.12 
 
 		 276 aa  98.6  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3179  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.67 
 
 		 288 aa  94.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.047355 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3478  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.96 
 
 		 295 aa  93.2  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.89326 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.69 
 
 		 282 aa  89  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317569  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00780  threonine and homoserine efflux system  31.14 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2829  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.14 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0520778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0870  threonine and homoserine efflux system  31.14 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096225  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0883  threonine and homoserine efflux system  30.1 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000921417  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2535  threonine and homoserine efflux system  31.14 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000316984  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0962  threonine and homoserine efflux system  30.64 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0232509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00797  hypothetical protein  31.14 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2830  threonine and homoserine efflux system  30.8 
 
 		 295 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0837  threonine and homoserine efflux system  30.8 
 
 		 295 aa  87  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0124814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2634  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.08 
 
 		 280 aa  85.9  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3333  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222315  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24340  predicted permease, DMT superfamily  28.91 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557722  normal  0.167703 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3044  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.32 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2766  hypothetical protein  27.64 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830467  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3425  hypothetical protein  26.69 
 
 		 292 aa  79  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5689  hypothetical protein  28.01 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0190255  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3433  hypothetical protein  27.24 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302271  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0898  threonine and homoserine efflux system  28.99 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0870  threonine and homoserine efflux system  28.99 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3085  hypothetical protein  32.03 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0753098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46700  hypothetical protein  29.04 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.022597  decreased coverage  0.000000235263 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0961  threonine and homoserine efflux system  29.31 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0982  threonine and homoserine efflux system  29.31 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4022  hypothetical protein  29.04 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17200  predicted permease, DMT superfamily  30 
 
 		 358 aa  75.5  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0071959  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0929  hypothetical protein  26.64 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8572  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.92 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257363  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3433  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.04 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2802  hypothetical protein  29.46 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10684  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4814  threonine and homoserine efflux system  27.97 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.369871  normal  0.894599 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2875  threonine and homoserine efflux system  25.62 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00290146  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2238  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.24 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1874  hypothetical protein  26.91 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00146807  decreased coverage  0.00345269 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0196  hypothetical protein  27.43 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.389436  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4738  hypothetical protein  31.54 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4855  hypothetical protein  27.5 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5800  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.3 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1861  hypothetical protein  27.56 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.654734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0068  hypothetical protein  29.53 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2514  hypothetical protein  31.2 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292339  normal  0.385218 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1300  threonine and homoserine efflux system  27.56 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.332206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2395  hypothetical protein  24.74 
 
 		 288 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000810917 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3407  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.2 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615579 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0928  threonine and homoserine efflux system  27.47 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1587  threonine and homoserine efflux system  26.95 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00642491  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3168  hypothetical protein  27.38 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.302712  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01360  predicted permease, DMT superfamily  26.8 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.554543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0130  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.82 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0233351  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1994  putative integral membrane protein  38.05 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1520  hypothetical protein  24.55 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.965674  normal  0.0966984 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2007  hypothetical protein  24.19 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.965674  normal  0.319686 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1964  hypothetical protein  29.25 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1500  threonine and homoserine efflux system  26.54 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.6519e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1768  threonine and homoserine efflux system  26.54 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000270946  normal  0.0166943 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4262  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.43 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3499  hypothetical protein  25.76 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135558  normal  0.669558 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1605  threonine and homoserine efflux system  26.54 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140132  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2507  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.16 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1483  threonine and homoserine efflux system  27.54 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3181  hypothetical protein  28 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.547943  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2239  EamA family protein  25.94 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0001908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3217  hypothetical protein  26.54 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00240946  normal  0.367781 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2617  hypothetical protein  30.43 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1863  hypothetical protein  23.31 
 
 		 295 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000217515  normal  0.404567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5994  hypothetical protein  26.67 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0942193  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0646  hypothetical protein  30.12 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.140309 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2543  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.25 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  normal  0.409771 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01032  Transporter involved in threonine and homoserine efflux  29.24 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.614417  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0657  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.36 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2637  hypothetical protein  26.87 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000608588  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2969  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.74 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2274  hypothetical protein  25.78 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.485433  normal  0.0712607 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2840  hypothetical protein  27.96 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316251  normal  0.316711 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3904  hypothetical protein  26.39 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1976  hypothetical protein  33.82 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.487154 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0094  hypothetical protein  28.51 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.73224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4527  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.7 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0952883 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2658  hypothetical protein  23.67 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2703  hypothetical protein  23.67 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.75974  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2688  hypothetical protein  23.67 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4267  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.93 
 
 		 327 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0357814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02390  predicted permease, DMT superfamily  25.26 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.857756  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2390  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.14 
 
 		 288 aa  53.1  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1425  putative integral membrane protein  36.11 
 
 		 330 aa  52.8  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.48 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0625  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.19 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal  0.900274 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2218  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.05 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000223898  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1197  hypothetical protein  25.41 
 
 		 295 aa  50.8  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3928  hypothetical protein  36.08 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.501221  normal  0.176255 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  23.08 
 
 		 317 aa  50.1  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19920  predicted permease, DMT superfamily  23.45 
 
 		 331 aa  50.1  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.185467  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>