144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3407 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3407  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 291 aa  561  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615579 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4738  hypothetical protein  68.55 
 
 		 295 aa  360  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2840  hypothetical protein  62.64 
 
 		 300 aa  310  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316251  normal  0.316711 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4855  hypothetical protein  59.78 
 
 		 285 aa  299  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4814  threonine and homoserine efflux system  55.6 
 
 		 288 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.369871  normal  0.894599 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0094  hypothetical protein  56.57 
 
 		 299 aa  285  9e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.73224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3433  hypothetical protein  52.19 
 
 		 295 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302271  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3085  hypothetical protein  56.78 
 
 		 295 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0753098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46700  hypothetical protein  54.01 
 
 		 297 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.022597  decreased coverage  0.000000235263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4022  hypothetical protein  54.38 
 
 		 297 aa  265  7e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2958  hypothetical protein  65.48 
 
 		 303 aa  264  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.395284  normal  0.675669 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3499  hypothetical protein  51.93 
 
 		 295 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135558  normal  0.669558 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1863  hypothetical protein  51.23 
 
 		 295 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000217515  normal  0.404567 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2634  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.54 
 
 		 280 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2239  EamA family protein  50.88 
 
 		 295 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0001908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2875  threonine and homoserine efflux system  47.89 
 
 		 293 aa  256  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00290146  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3904  hypothetical protein  49.64 
 
 		 295 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0837  threonine and homoserine efflux system  49.27 
 
 		 295 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0124814  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00780  threonine and homoserine efflux system  48.91 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2829  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.91 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0520778  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00797  hypothetical protein  48.91 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0870  threonine and homoserine efflux system  48.91 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096225  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0883  threonine and homoserine efflux system  48.91 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000921417  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2830  threonine and homoserine efflux system  48.91 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2535  threonine and homoserine efflux system  48.91 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000316984  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3044  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.61 
 
 		 285 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0962  threonine and homoserine efflux system  48.91 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0232509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3217  hypothetical protein  49.64 
 
 		 295 aa  249  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00240946  normal  0.367781 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2802  hypothetical protein  52.17 
 
 		 278 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10684  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8572  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.1 
 
 		 305 aa  247  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257363  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0898  threonine and homoserine efflux system  49.65 
 
 		 295 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0870  threonine and homoserine efflux system  49.65 
 
 		 295 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0961  threonine and homoserine efflux system  49.29 
 
 		 295 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0982  threonine and homoserine efflux system  49.29 
 
 		 295 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3928  hypothetical protein  58.52 
 
 		 301 aa  246  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.501221  normal  0.176255 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1964  hypothetical protein  48.97 
 
 		 314 aa  245  8e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0196  hypothetical protein  49.27 
 
 		 305 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.389436  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1500  threonine and homoserine efflux system  50.38 
 
 		 295 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.6519e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1768  threonine and homoserine efflux system  50.38 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000270946  normal  0.0166943 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1605  threonine and homoserine efflux system  50.38 
 
 		 295 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140132  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0068  hypothetical protein  48.77 
 
 		 289 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1587  threonine and homoserine efflux system  48.57 
 
 		 295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00642491  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1300  threonine and homoserine efflux system  47.5 
 
 		 295 aa  235  5.0000000000000005e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.332206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2390  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.23 
 
 		 288 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01032  Transporter involved in threonine and homoserine efflux  47.39 
 
 		 290 aa  235  6e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.614417  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0928  threonine and homoserine efflux system  48.58 
 
 		 286 aa  235  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2514  hypothetical protein  51.44 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292339  normal  0.385218 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1483  threonine and homoserine efflux system  48.91 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0646  hypothetical protein  56.41 
 
 		 296 aa  233  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.140309 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0625  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.51 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal  0.900274 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2617  hypothetical protein  48.77 
 
 		 289 aa  229  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2637  hypothetical protein  47.96 
 
 		 320 aa  226  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000608588  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2766  hypothetical protein  47.45 
 
 		 281 aa  226  4e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830467  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0657  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.95 
 
 		 296 aa  224  9e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.7 
 
 		 293 aa  218  7.999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0929  hypothetical protein  46.82 
 
 		 292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1861  hypothetical protein  53.44 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.654734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.17 
 
 		 282 aa  209  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3181  hypothetical protein  48.47 
 
 		 281 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.547943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17200  predicted permease, DMT superfamily  43.42 
 
 		 358 aa  194  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0071959  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1197  hypothetical protein  47.7 
 
 		 295 aa  189  5e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5800  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.74 
 
 		 322 aa  189  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5994  hypothetical protein  43.59 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0942193  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3168  hypothetical protein  44.93 
 
 		 290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.302712  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2507  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.76 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3425  hypothetical protein  41.13 
 
 		 292 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2969  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.73 
 
 		 315 aa  161  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1976  hypothetical protein  40.93 
 
 		 298 aa  159  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.487154 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.36 
 
 		 301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0130  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.13 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0233351  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0975  hypothetical protein  40.81 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000600657 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1460  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.1 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2172  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.03 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2981  DMT family permease  38.95 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190114  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1846  hypothetical protein  38.72 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000284209 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1994  putative integral membrane protein  41.96 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4262  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.8 
 
 		 297 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2218  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.09 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000223898  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4527  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.04 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0952883 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5689  hypothetical protein  32.38 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0190255  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13040  predicted permease, DMT superfamily  42.28 
 
 		 293 aa  115  6.9999999999999995e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0141388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.77 
 
 		 288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4267  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.08 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0357814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02390  predicted permease, DMT superfamily  39.76 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.857756  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3392  hypothetical protein  36.73 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529802  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2658  hypothetical protein  34.3 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2703  hypothetical protein  34.3 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.75974  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2688  hypothetical protein  34.3 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7811  hypothetical protein  31.56 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1687  threonine/homoserine efflux transporter  34.72 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1557  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.21 
 
 		 319 aa  99.8  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3333  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.3 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222315  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2072  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.27 
 
 		 327 aa  95.9  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2602  hypothetical protein  35.83 
 
 		 277 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.86 
 
 		 330 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2563  hypothetical protein  36.29 
 
 		 277 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2608  hypothetical protein  36.29 
 
 		 277 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01360  predicted permease, DMT superfamily  32.32 
 
 		 301 aa  92.8  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.554543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2007  hypothetical protein  29.8 
 
 		 289 aa  92.4  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.965674  normal  0.319686 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1520  hypothetical protein  29.7 
 
 		 309 aa  92  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.965674  normal  0.0966984 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>