232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_34860 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_34860  predicted permease, DMT superfamily  100 
 
 		 288 aa  541  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.33 
 
 		 288 aa  287  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3478  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.52 
 
 		 295 aa  226  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.89326 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3179  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.3 
 
 		 288 aa  216  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.047355 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.76 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3333  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.09 
 
 		 293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222315  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24340  predicted permease, DMT superfamily  45.58 
 
 		 287 aa  166  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557722  normal  0.167703 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3433  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.77 
 
 		 330 aa  149  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1687  threonine/homoserine efflux transporter  35.69 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17200  predicted permease, DMT superfamily  38.81 
 
 		 358 aa  143  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0071959  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2395  hypothetical protein  40.15 
 
 		 288 aa  139  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000810917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5689  hypothetical protein  36.93 
 
 		 308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0190255  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3425  hypothetical protein  36.4 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2507  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.11 
 
 		 305 aa  129  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4267  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.92 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0357814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2007  hypothetical protein  36.15 
 
 		 289 aa  122  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.965674  normal  0.319686 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1520  hypothetical protein  36.15 
 
 		 309 aa  122  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.965674  normal  0.0966984 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1874  hypothetical protein  41.89 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00146807  decreased coverage  0.00345269 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3085  hypothetical protein  36.7 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0753098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2634  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.06 
 
 		 280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0929  hypothetical protein  32.77 
 
 		 292 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4262  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.46 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01360  predicted permease, DMT superfamily  39.41 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.554543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0244  hypothetical protein  29.87 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2658  hypothetical protein  36.64 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2703  hypothetical protein  36.64 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.75974  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5994  hypothetical protein  39.61 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0942193  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2688  hypothetical protein  36.64 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0130  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.85 
 
 		 325 aa  116  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0233351  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3392  hypothetical protein  37.93 
 
 		 277 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529802  normal  0.576892 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00780  threonine and homoserine efflux system  34.32 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2829  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.32 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0520778  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3044  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.61 
 
 		 285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0883  threonine and homoserine efflux system  34.32 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000921417  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2830  threonine and homoserine efflux system  34.32 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00797  hypothetical protein  34.32 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3433  hypothetical protein  32.61 
 
 		 295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302271  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2535  threonine and homoserine efflux system  34.32 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000316984  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0870  threonine and homoserine efflux system  34.32 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096225  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0962  threonine and homoserine efflux system  34.32 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0232509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2274  hypothetical protein  39.62 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.485433  normal  0.0712607 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2981  DMT family permease  36.09 
 
 		 296 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190114  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0837  threonine and homoserine efflux system  34.47 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0124814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1846  hypothetical protein  35.87 
 
 		 298 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000284209 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3133  hypothetical protein  40.31 
 
 		 288 aa  112  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.786366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1460  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.62 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0961  threonine and homoserine efflux system  32.32 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0982  threonine and homoserine efflux system  32.32 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0068  hypothetical protein  33.72 
 
 		 289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0898  threonine and homoserine efflux system  32.32 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0870  threonine and homoserine efflux system  32.32 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8572  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.04 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257363  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1964  hypothetical protein  32.53 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2563  hypothetical protein  39.44 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2608  hypothetical protein  39.44 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2602  hypothetical protein  39.04 
 
 		 277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2802  hypothetical protein  36.95 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10684  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3217  hypothetical protein  31.9 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00240946  normal  0.367781 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2617  hypothetical protein  33.88 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0094  hypothetical protein  36.09 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.73224  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2969  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.52 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1994  putative integral membrane protein  37.94 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1861  hypothetical protein  36.73 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.654734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1300  threonine and homoserine efflux system  33.21 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.332206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2875  threonine and homoserine efflux system  30.88 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00290146  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0196  hypothetical protein  32.65 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.389436  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01032  Transporter involved in threonine and homoserine efflux  30.24 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.614417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5800  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.11 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3168  hypothetical protein  35.84 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.302712  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2172  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.03 
 
 		 314 aa  102  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4022  hypothetical protein  35.31 
 
 		 297 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1976  hypothetical protein  36.23 
 
 		 298 aa  102  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.487154 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0928  threonine and homoserine efflux system  31.56 
 
 		 286 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4814  threonine and homoserine efflux system  34.57 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.369871  normal  0.894599 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4738  hypothetical protein  33.33 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2766  hypothetical protein  33.33 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830467  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2637  hypothetical protein  34.06 
 
 		 320 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000608588  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1863  hypothetical protein  32.62 
 
 		 295 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000217515  normal  0.404567 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4527  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.1 
 
 		 303 aa  99.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0952883 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1587  threonine and homoserine efflux system  31.02 
 
 		 295 aa  99  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00642491  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2239  EamA family protein  31.75 
 
 		 295 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0001908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2840  hypothetical protein  38.43 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316251  normal  0.316711 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3499  hypothetical protein  32.12 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135558  normal  0.669558 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1483  threonine and homoserine efflux system  30.59 
 
 		 295 aa  97.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46700  hypothetical protein  34.74 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.022597  decreased coverage  0.000000235263 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4855  hypothetical protein  35.63 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2390  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.54 
 
 		 288 aa  95.9  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1605  threonine and homoserine efflux system  30.66 
 
 		 295 aa  94.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140132  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1500  threonine and homoserine efflux system  30.29 
 
 		 295 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.6519e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0657  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.15 
 
 		 296 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1768  threonine and homoserine efflux system  31.97 
 
 		 293 aa  93.6  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000270946  normal  0.0166943 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2514  hypothetical protein  32.12 
 
 		 283 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292339  normal  0.385218 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1425  putative integral membrane protein  38.04 
 
 		 330 aa  90.9  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7811  hypothetical protein  32.1 
 
 		 306 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1197  hypothetical protein  35.32 
 
 		 295 aa  89.4  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2238  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.26 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3181  hypothetical protein  32.07 
 
 		 281 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.547943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3904  hypothetical protein  31.56 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.51 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>