136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3346 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3346  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  647    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0438  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.18 
 
 		 316 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0416  hypothetical protein  42.95 
 
 		 345 aa  195  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.848373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.63 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0742  hypothetical protein  29.84 
 
 		 314 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0622  hypothetical protein  38.22 
 
 		 203 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4399  hypothetical protein  30.59 
 
 		 308 aa  96.3  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  30.43 
 
 		 294 aa  88.2  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0625  hypothetical protein  39.23 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.82 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  25.91 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  26.37 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.63 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.64 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.25 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  24.58 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  24.34 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  24.34 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  24.01 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  24.01 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  24.01 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  24.01 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  23.68 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.99 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  24.01 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  28.16 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  24.33 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  24.34 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.76 
 
 		 307 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.18 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  24.76 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4191  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.168223  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.99 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.38 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.44 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3004  hypothetical protein  26.55 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315518  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  26.62 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.69 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2761  hypothetical protein  31.16 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14500  membrane protein  24.67 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00083685  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  26.64 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  24.1 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.68 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3517  hypothetical protein  31.3 
 
 		 333 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.281174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.71 
 
 		 297 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.28 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0320  hypothetical protein  21.4 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  24.4 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1515  hypothetical protein  24.44 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.910638  normal  0.799854 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  24.84 
 
 		 297 aa  55.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.22 
 
 		 317 aa  54.3  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  25.55 
 
 		 312 aa  53.9  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 		 291 aa  53.5  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 302 aa  53.1  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.76 
 
 		 359 aa  52  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.902863 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2339  hypothetical protein  27.21 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0842181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  24.63 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0371  hypothetical protein  21.39 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0749298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  24.36 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  25.74 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  26.09 
 
 		 302 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  24.58 
 
 		 300 aa  51.2  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.65 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2001  hypothetical protein  26.28 
 
 		 283 aa  51.2  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  27.69 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  24.76 
 
 		 308 aa  50.1  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.89 
 
 		 309 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  22.41 
 
 		 299 aa  49.7  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.11 
 
 		 299 aa  49.7  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  25.81 
 
 		 309 aa  49.3  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0911  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.68 
 
 		 294 aa  49.3  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0168694  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00780  threonine and homoserine efflux system  26.46 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2829  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.46 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0520778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0870  threonine and homoserine efflux system  26.46 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096225  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0883  threonine and homoserine efflux system  26.46 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000921417  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2830  threonine and homoserine efflux system  26.46 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  26.07 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2535  threonine and homoserine efflux system  26.46 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000316984  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00797  hypothetical protein  26.46 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0962  threonine and homoserine efflux system  26.46 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0232509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.58 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0837  threonine and homoserine efflux system  26.07 
 
 		 295 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0124814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  26.39 
 
 		 310 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  27.66 
 
 		 299 aa  47.8  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.35 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  22.51 
 
 		 302 aa  46.6  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  26.07 
 
 		 309 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  23.88 
 
 		 308 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 		 293 aa  46.6  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.918526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 304 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.484087 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.44 
 
 		 311 aa  46.6  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  24.03 
 
 		 293 aa  46.6  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  28.15 
 
 		 301 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  23.38 
 
 		 296 aa  46.6  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.37 
 
 		 295 aa  46.6  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.841785  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.35 
 
 		 300 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4331  hypothetical protein  21.4 
 
 		 316 aa  46.2  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.55 
 
 		 297 aa  46.2  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1300  threonine and homoserine efflux system  26.94 
 
 		 295 aa  46.2  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.332206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0563  hypothetical protein  25 
 
 		 320 aa  46.2  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>