142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0331 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0331  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  623  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  33.45 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2236  hypothetical protein  31.34 
 
 		 319 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560501  normal  0.770615 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  32.39 
 
 		 281 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2506  hypothetical protein  31.91 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1985  integral membrane protein, DUF6  32.98 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0790  hypothetical protein  31.32 
 
 		 532 aa  102  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356616  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1225  hypothetical protein  33.89 
 
 		 306 aa  102  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1255  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.79 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.813345  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  31.07 
 
 		 304 aa  99.4  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.96 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.579422 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3877  hypothetical protein  28.71 
 
 		 320 aa  97.1  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1364  hypothetical protein  24.56 
 
 		 325 aa  96.7  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1079  hypothetical protein  31.58 
 
 		 323 aa  89.4  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.901985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  27.44 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.52 
 
 		 382 aa  88.2  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  26.69 
 
 		 302 aa  86.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0562  hypothetical protein  29.18 
 
 		 328 aa  86.3  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.368396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2881  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.67 
 
 		 306 aa  85.9  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2234  hypothetical protein  28.01 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2187  hypothetical protein  31.39 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0754091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1984  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.27 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.825306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3210  hypothetical protein  28.47 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2384  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.6 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3236  hypothetical protein  29.54 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02208  hypothetical protein  24.92 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  30.29 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  30.29 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.24 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.98 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  23.64 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.7 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  27.27 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.38 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  30.03 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  30.03 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  25 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  30 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  30 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  28.28 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  28.24 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.65 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  22.44 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5553  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.69 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4331  hypothetical protein  26.79 
 
 		 316 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.26 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  25.89 
 
 		 312 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4738  hypothetical protein  27.51 
 
 		 295 aa  53.9  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.47 
 
 		 311 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.1 
 
 		 317 aa  53.1  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  25.18 
 
 		 308 aa  52.8  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1713  hypothetical protein  23.26 
 
 		 321 aa  52.4  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  28.5 
 
 		 289 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  27 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  29.69 
 
 		 309 aa  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  27.95 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.88 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  0.15573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3517  hypothetical protein  30.3 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.281174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  23.04 
 
 		 308 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3425  hypothetical protein  26.03 
 
 		 292 aa  50.4  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.05 
 
 		 298 aa  50.1  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15760  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  26.92 
 
 		 327 aa  50.1  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.941518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  23.62 
 
 		 289 aa  50.1  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0371  hypothetical protein  24 
 
 		 315 aa  50.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0749298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  26.79 
 
 		 312 aa  50.1  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.26 
 
 		 298 aa  49.7  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  23.85 
 
 		 303 aa  49.7  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.43 
 
 		 325 aa  49.3  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  21.92 
 
 		 312 aa  49.3  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  21.8 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0196  hypothetical protein  24.28 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  37.84 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  27.33 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.9 
 
 		 335 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  27.15 
 
 		 402 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.44 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  25.98 
 
 		 356 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  25.98 
 
 		 356 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  25.98 
 
 		 356 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  25.98 
 
 		 356 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  25.98 
 
 		 353 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  25.98 
 
 		 356 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  25.98 
 
 		 356 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  25.23 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.22 
 
 		 321 aa  47.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.92 
 
 		 317 aa  47  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1515  hypothetical protein  22.3 
 
 		 273 aa  46.6  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.910638  normal  0.799854 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  21.71 
 
 		 303 aa  46.6  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.12 
 
 		 278 aa  46.6  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.88 
 
 		 323 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  26.28 
 
 		 294 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  26.28 
 
 		 294 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  27.54 
 
 		 304 aa  45.8  0.0009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  23.74 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  26.92 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  24.64 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  29.01 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.77 
 
 		 292 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.77 
 
 		 367 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>