192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1958 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  531  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.18 
 
 
290 aa  242  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3950  hypothetical protein  52.82 
 
 
305 aa  240  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.395543  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  49.13 
 
 
289 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5166  hypothetical protein  48.78 
 
 
289 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0373  hypothetical protein  48.08 
 
 
325 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4637  hypothetical protein  48.78 
 
 
289 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  47.74 
 
 
289 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1987  hypothetical protein  50.35 
 
 
309 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5061  hypothetical protein  49.11 
 
 
293 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906972  normal  0.609153 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3444  hypothetical protein  47.4 
 
 
291 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3090  hypothetical protein  47.74 
 
 
323 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2005  hypothetical protein  47.86 
 
 
301 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0762  hypothetical protein  47.86 
 
 
301 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0587  hypothetical protein  47.86 
 
 
301 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.256755  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0697  hypothetical protein  47.86 
 
 
301 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.157594  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1652  hypothetical protein  47.86 
 
 
301 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.755611  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0514  hypothetical protein  47.86 
 
 
301 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317548  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2100  hypothetical protein  47.86 
 
 
301 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265012  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  46.62 
 
 
296 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0887  hypothetical protein  46.57 
 
 
301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.44 
 
 
296 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.11 
 
 
299 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4880  hypothetical protein  44.09 
 
 
304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00223528  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  39.16 
 
 
305 aa  171  9e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  36.69 
 
 
289 aa  169  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.01 
 
 
299 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  41.4 
 
 
285 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.93 
 
 
293 aa  160  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  41.46 
 
 
296 aa  158  8e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4718  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  43.06 
 
 
302 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  39.93 
 
 
307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  35.21 
 
 
289 aa  150  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  41.96 
 
 
307 aa  149  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.75 
 
 
305 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.96 
 
 
307 aa  149  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.89 
 
 
305 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.98 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  39.66 
 
 
283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.11 
 
 
295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.427238  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2187  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.66 
 
 
296 aa  139  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.397881  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  42.81 
 
 
298 aa  139  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0009  hypothetical protein  39.86 
 
 
289 aa  136  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0738  hypothetical protein  34.72 
 
 
295 aa  135  7.000000000000001e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0136  hypothetical protein  39.08 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  32.26 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  40.37 
 
 
302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3027  hypothetical protein  39.08 
 
 
296 aa  125  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810081  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  32.63 
 
 
295 aa  122  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  41.7 
 
 
292 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3591  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.01 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  36.17 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  31.34 
 
 
299 aa  115  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1930  hypothetical protein  38.78 
 
 
317 aa  115  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0562789 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2902  hypothetical protein  33.83 
 
 
298 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  34.63 
 
 
297 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20640  hypothetical protein  39.58 
 
 
292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14869  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1629  hypothetical protein  37.8 
 
 
306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  39.04 
 
 
293 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  33.45 
 
 
306 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2362  hypothetical protein  36.14 
 
 
291 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483253  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3358  hypothetical protein  33.68 
 
 
291 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157803  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3100  hypothetical protein  36.01 
 
 
291 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  decreased coverage  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  32.75 
 
 
297 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  32.87 
 
 
281 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  28.77 
 
 
307 aa  94.7  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  31.67 
 
 
319 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.47 
 
 
313 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.526494  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3229  hypothetical protein  35.21 
 
 
315 aa  89.4  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  hitchhiker  0.00000979467 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5253  hypothetical protein  30.53 
 
 
299 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  29.89 
 
 
312 aa  77  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  30.5 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0218  hypothetical protein  33.8 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0402  hypothetical protein  33.45 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3093  hypothetical protein  32.88 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.622922 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2461  hypothetical protein  33.45 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3075  hypothetical protein  32.53 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0206  hypothetical protein  33.45 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1416  hypothetical protein  30.03 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  31.69 
 
 
309 aa  72.4  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0878  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.36 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.754226  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3268  hypothetical protein  33.1 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2931  hypothetical protein  33.1 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3416  hypothetical protein  33.1 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824806  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2158  hypothetical protein  33.1 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  37.62 
 
 
286 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5922  hypothetical protein  29.11 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.34 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.07 
 
 
286 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  28.62 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3631  hypothetical protein  29.82 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6425  hypothetical protein  32.99 
 
 
293 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0180  hypothetical protein  32.98 
 
 
287 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.1 
 
 
324 aa  63.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3624  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.97 
 
 
287 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.79 
 
 
305 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00175319  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2704  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.37 
 
 
297 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1799  hypothetical protein  29.45 
 
 
310 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.39 
 
 
287 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2873  hypothetical protein  29.79 
 
 
298 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604973  normal  0.0800404 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>