70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0196 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0196  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  583  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1184  hypothetical protein  42.65 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432644  normal  0.172566 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1166  hypothetical protein  43.01 
 
 		 307 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.533406  normal  0.0102803 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3304  hypothetical protein  41.79 
 
 		 300 aa  166  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1048  hypothetical protein  39.79 
 
 		 323 aa  159  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.766524  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4245  hypothetical protein  42.65 
 
 		 307 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.691144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0897  hypothetical protein  39.79 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0962881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1200  hypothetical protein  42.81 
 
 		 307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  24.37 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.26 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  0.15573 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.75 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  29.2 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4191  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.73 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.168223  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.28 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  29.21 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1985  integral membrane protein, DUF6  29.13 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  24.66 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  29.11 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  28.77 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  32.61 
 
 		 302 aa  53.9  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  23.75 
 
 		 304 aa  52.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001539  permease  25 
 
 		 292 aa  52.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  22.91 
 
 		 300 aa  52.8  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  29.97 
 
 		 309 aa  52.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  28.19 
 
 		 309 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  28.19 
 
 		 309 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.33 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  27.07 
 
 		 293 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  27.23 
 
 		 316 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.78 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000893438  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4038  hypothetical protein  23.13 
 
 		 287 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1407  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.48 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  27.27 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  26.47 
 
 		 287 aa  50.4  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8407  hypothetical protein  29.41 
 
 		 314 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  28.51 
 
 		 309 aa  49.7  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0371  hypothetical protein  25.76 
 
 		 315 aa  49.3  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0749298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.37 
 
 		 311 aa  49.3  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.31 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1171  hypothetical protein  30.15 
 
 		 333 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.865104 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0331  hypothetical protein  24.28 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  28.08 
 
 		 324 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.72 
 
 		 296 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.48 
 
 		 295 aa  46.6  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  25.34 
 
 		 289 aa  45.8  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4984  hypothetical protein  25.94 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.35217 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  23.53 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  21.82 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  25.49 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2637  hypothetical protein  26.58 
 
 		 320 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000608588  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.32 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  19.37 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  24.48 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  26.27 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0562  hypothetical protein  29.26 
 
 		 328 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.368396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3915  hypothetical protein  29.73 
 
 		 316 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129104  normal  0.126529 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1128  hypothetical protein  29.6 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05469  hypothetical protein  25 
 
 		 292 aa  43.9  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 		 329 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  23.92 
 
 		 291 aa  43.5  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  25.51 
 
 		 304 aa  43.1  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  28.57 
 
 		 402 aa  43.5  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  27.95 
 
 		 302 aa  43.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4331  hypothetical protein  33.73 
 
 		 316 aa  43.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2236  hypothetical protein  25.32 
 
 		 319 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560501  normal  0.770615 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.98 
 
 		 325 aa  42.7  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 		 341 aa  42.7  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1436  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.45 
 
 		 331 aa  42.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.397565  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4964  hypothetical protein  27.49 
 
 		 365 aa  42.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.59 
 
 		 335 aa  42.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>