72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4245 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4245  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.691144  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1166  hypothetical protein  94.14 
 
 		 307 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.533406  normal  0.0102803 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1184  hypothetical protein  88.85 
 
 		 306 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432644  normal  0.172566 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1200  hypothetical protein  93.81 
 
 		 307 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0897  hypothetical protein  68.33 
 
 		 323 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0962881  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1048  hypothetical protein  66.67 
 
 		 323 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.766524  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3304  hypothetical protein  61.36 
 
 		 300 aa  295  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0196  hypothetical protein  42.32 
 
 		 303 aa  189  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24730  predicted permease, DMT superfamily  33.91 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  28.98 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  27.01 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  24.41 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.28 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3688  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.07 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  31.76 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  27.91 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0331  hypothetical protein  25.81 
 
 		 322 aa  53.5  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  27.67 
 
 		 312 aa  52.4  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  30.14 
 
 		 397 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  27.89 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  28.3 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  26.24 
 
 		 316 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4964  hypothetical protein  27.2 
 
 		 365 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  25 
 
 		 298 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1442  hypothetical protein  30.71 
 
 		 342 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.231485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  28.64 
 
 		 301 aa  49.7  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.16 
 
 		 307 aa  49.7  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2962  hypothetical protein  28.37 
 
 		 300 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176802  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  25.62 
 
 		 299 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.94 
 
 		 311 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  26.88 
 
 		 359 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2983  hypothetical protein  28.37 
 
 		 300 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3552  hypothetical protein  28.44 
 
 		 302 aa  49.3  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.963369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.46 
 
 		 325 aa  49.3  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  26.88 
 
 		 359 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  26.88 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  27.21 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4331  hypothetical protein  29.65 
 
 		 316 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2348  hypothetical protein  28.37 
 
 		 300 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30790  hypothetical protein  27.31 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.316745  hitchhiker  0.000000000195244 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2640  hypothetical protein  28.91 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  28.11 
 
 		 335 aa  47  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  27.65 
 
 		 402 aa  47  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.54 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  0.15573 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.07 
 
 		 321 aa  46.6  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.67 
 
 		 286 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  36 
 
 		 286 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4984  hypothetical protein  26.29 
 
 		 255 aa  46.6  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.35217 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.67 
 
 		 286 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4527  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 303 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0952883 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.53 
 
 		 340 aa  45.8  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2704  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.17 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  27.01 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3637  small multidrug resistance protein  32.08 
 
 		 112 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.700642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  27.01 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2040  hypothetical protein  35.06 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.136673  normal  0.653396 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  37.5 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  26.02 
 
 		 317 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6312  hypothetical protein  28.43 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.36 
 
 		 348 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3501  hypothetical protein  40.98 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  38.16 
 
 		 395 aa  43.9  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  40.79 
 
 		 286 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.9 
 
 		 359 aa  43.1  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.902863 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3915  hypothetical protein  38.81 
 
 		 316 aa  43.1  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129104  normal  0.126529 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4663  hypothetical protein  27.07 
 
 		 320 aa  43.1  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4262  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.8 
 
 		 297 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  25.2 
 
 		 305 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1985  integral membrane protein, DUF6  23.73 
 
 		 308 aa  42.7  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2930  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.76 
 
 		 316 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.98 
 
 		 301 aa  42.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1799  hypothetical protein  29.64 
 
 		 310 aa  42.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>