58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1166 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1166  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.533406  normal  0.0102803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1200  hypothetical protein  99.02 
 
 		 307 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1184  hypothetical protein  89.25 
 
 		 306 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432644  normal  0.172566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4245  hypothetical protein  94.14 
 
 		 307 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.691144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0897  hypothetical protein  67.88 
 
 		 323 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0962881  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1048  hypothetical protein  66.89 
 
 		 323 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.766524  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3304  hypothetical protein  62.37 
 
 		 300 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0196  hypothetical protein  42.66 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24730  predicted permease, DMT superfamily  34.85 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  25.08 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  26.58 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  28.69 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2962  hypothetical protein  29.33 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176802  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2983  hypothetical protein  29.33 
 
 		 300 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  27.09 
 
 		 299 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2348  hypothetical protein  29.33 
 
 		 300 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  30.93 
 
 		 308 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  29.13 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  25.12 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2640  hypothetical protein  28.91 
 
 		 299 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  28.46 
 
 		 315 aa  49.7  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3688  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 		 331 aa  49.7  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4527  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.13 
 
 		 303 aa  48.9  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0952883 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0331  hypothetical protein  25.58 
 
 		 322 aa  49.3  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  28.57 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4964  hypothetical protein  27.52 
 
 		 365 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6312  hypothetical protein  29.41 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.11 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  26.69 
 
 		 316 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.33 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30790  hypothetical protein  27.44 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.316745  hitchhiker  0.000000000195244 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  27.39 
 
 		 312 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3501  hypothetical protein  42.62 
 
 		 291 aa  46.6  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4331  hypothetical protein  29.65 
 
 		 316 aa  46.2  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  25.98 
 
 		 359 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  25.98 
 
 		 359 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  25.98 
 
 		 359 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  28.04 
 
 		 397 aa  45.8  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  26.87 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.49 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1442  hypothetical protein  30.64 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.231485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.51 
 
 		 359 aa  44.3  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.902863 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1985  integral membrane protein, DUF6  24.75 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0281  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.09 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0310  integral membrane protein  29.95 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.99 
 
 		 325 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.67 
 
 		 286 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.67 
 
 		 286 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  36 
 
 		 286 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3915  hypothetical protein  38.81 
 
 		 316 aa  43.1  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129104  normal  0.126529 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0371  hypothetical protein  24.55 
 
 		 315 aa  42.7  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0749298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2873  hypothetical protein  26.96 
 
 		 300 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2930  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.76 
 
 		 316 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.54 
 
 		 348 aa  42.7  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  26.53 
 
 		 309 aa  42.7  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.74 
 
 		 340 aa  42.7  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4262  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.35 
 
 		 297 aa  42.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  28.16 
 
 		 395 aa  42.4  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>