44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0897 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0897  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  625  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0962881  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1048  hypothetical protein  91.33 
 
 		 323 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.766524  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1184  hypothetical protein  69.46 
 
 		 306 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432644  normal  0.172566 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1166  hypothetical protein  67.88 
 
 		 307 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.533406  normal  0.0102803 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3304  hypothetical protein  73.56 
 
 		 300 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1200  hypothetical protein  67.88 
 
 		 307 aa  349  4e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4245  hypothetical protein  68.33 
 
 		 307 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.691144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0196  hypothetical protein  39.79 
 
 		 303 aa  168  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24730  predicted permease, DMT superfamily  29.39 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0614  hypothetical protein  27.16 
 
 		 293 aa  54.3  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  25.24 
 
 		 308 aa  53.9  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  25.28 
 
 		 315 aa  53.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1857  hypothetical protein  26.47 
 
 		 300 aa  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0328691  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  27.71 
 
 		 309 aa  49.7  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4527  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.5 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0952883 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  25.56 
 
 		 312 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30790  hypothetical protein  27.27 
 
 		 299 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.316745  hitchhiker  0.000000000195244 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  31.08 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4663  hypothetical protein  30.03 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  27.31 
 
 		 317 aa  47  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.78 
 
 		 348 aa  47  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0178  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.48 
 
 		 315 aa  46.6  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.85 
 
 		 325 aa  46.6  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4262  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.29 
 
 		 297 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3433  hypothetical protein  26.17 
 
 		 295 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302271  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  26.8 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  27.5 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  25.67 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.49 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  27.5 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4022  hypothetical protein  26.56 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  27.04 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46700  hypothetical protein  27.6 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.022597  decreased coverage  0.000000235263 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3085  hypothetical protein  25.09 
 
 		 295 aa  43.9  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0753098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  27.34 
 
 		 359 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.52 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1799  hypothetical protein  26.92 
 
 		 310 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  26.85 
 
 		 397 aa  43.5  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  27 
 
 		 299 aa  43.5  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.7 
 
 		 317 aa  43.1  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  25.25 
 
 		 289 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4331  hypothetical protein  27.03 
 
 		 316 aa  42.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  24.24 
 
 		 312 aa  42.7  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4226  hypothetical protein  28.93 
 
 		 320 aa  42.7  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>