41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3304 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3304  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0897  hypothetical protein  73.56 
 
 		 323 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0962881  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1048  hypothetical protein  71.86 
 
 		 323 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.766524  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1184  hypothetical protein  62.37 
 
 		 306 aa  342  4e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432644  normal  0.172566 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1166  hypothetical protein  62.37 
 
 		 307 aa  329  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.533406  normal  0.0102803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1200  hypothetical protein  62.37 
 
 		 307 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4245  hypothetical protein  61.36 
 
 		 307 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.691144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0196  hypothetical protein  41.61 
 
 		 303 aa  192  8e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  29.58 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4527  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.65 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0952883 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24730  predicted permease, DMT superfamily  33.19 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.8 
 
 		 348 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4663  hypothetical protein  34 
 
 		 320 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0614  hypothetical protein  28.39 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4262  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.57 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  28.52 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4226  hypothetical protein  33 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5800  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.27 
 
 		 322 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  25.41 
 
 		 302 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17200  predicted permease, DMT superfamily  29.46 
 
 		 358 aa  49.7  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0071959  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  29.52 
 
 		 357 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.12 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  28.57 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  27.41 
 
 		 298 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  26.18 
 
 		 299 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0331  hypothetical protein  24.76 
 
 		 322 aa  45.8  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1079  hypothetical protein  29.81 
 
 		 323 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.901985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1792  hypothetical protein  31.37 
 
 		 314 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.69 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01360  predicted permease, DMT superfamily  31.76 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.554543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.37 
 
 		 298 aa  43.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.53 
 
 		 340 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  31.31 
 
 		 334 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  22.17 
 
 		 298 aa  43.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  25.26 
 
 		 289 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3915  hypothetical protein  33.33 
 
 		 316 aa  42.7  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129104  normal  0.126529 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0689  hypothetical protein  33.63 
 
 		 281 aa  42.7  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.164127  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0737  hypothetical protein  33.63 
 
 		 281 aa  42.7  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8212  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.76 
 
 		 303 aa  42.7  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  28.63 
 
 		 309 aa  42.4  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4331  hypothetical protein  31.03 
 
 		 316 aa  42.4  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>