71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0371 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0371  hypothetical protein  100 
 
 
315 aa  627  1e-178  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0749298  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4331  hypothetical protein  49.84 
 
 
316 aa  319  5e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2930  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.92 
 
 
316 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0269  hypothetical protein  33.13 
 
 
583 aa  149  8e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3725  hypothetical protein  34.98 
 
 
728 aa  135  7.000000000000001e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0157  hypothetical protein  31.23 
 
 
751 aa  122  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.4 
 
 
310 aa  61.2  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  27.65 
 
 
308 aa  59.3  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.97 
 
 
295 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  27.19 
 
 
308 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  27.31 
 
 
302 aa  55.8  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  30.2 
 
 
316 aa  55.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  24.48 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  24.39 
 
 
300 aa  53.9  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.83 
 
 
313 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.579422 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  24.43 
 
 
302 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1364  hypothetical protein  22.56 
 
 
325 aa  50.8  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  26.64 
 
 
294 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0196  hypothetical protein  25.76 
 
 
303 aa  49.3  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  26.64 
 
 
294 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  27.07 
 
 
309 aa  49.3  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_002950  PG0333  hypothetical protein  26.7 
 
 
302 aa  49.3  0.00009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.950508 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0331  hypothetical protein  24.24 
 
 
322 aa  49.3  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0003  hypothetical protein  27.36 
 
 
288 aa  48.9  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  26.74 
 
 
309 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  26.55 
 
 
289 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.9 
 
 
299 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  0.15573 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3346  hypothetical protein  21.08 
 
 
331 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3496  hypothetical protein  25.76 
 
 
306 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  26.63 
 
 
308 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  25.13 
 
 
397 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3503  hypothetical protein  27.37 
 
 
307 aa  47.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1833  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.73 
 
 
291 aa  47  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.40235  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.79 
 
 
309 aa  46.6  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.8 
 
 
306 aa  46.6  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.03 
 
 
309 aa  46.2  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0438  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.62 
 
 
316 aa  46.6  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.55 
 
 
311 aa  46.2  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4181  hypothetical protein  21.59 
 
 
297 aa  46.2  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.59 
 
 
305 aa  46.2  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0316  hypothetical protein  23.15 
 
 
281 aa  45.8  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.238675  normal  0.667988 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.92 
 
 
382 aa  46.2  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.19 
 
 
296 aa  45.8  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.26 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  23.46 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  27.51 
 
 
296 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4191  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.58 
 
 
298 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.168223  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  26.92 
 
 
309 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0899  hypothetical protein  36 
 
 
125 aa  44.3  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1985  integral membrane protein, DUF6  34.43 
 
 
308 aa  43.9  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  23.62 
 
 
303 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  24.1 
 
 
296 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  26.92 
 
 
309 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4055  hypothetical protein  27.14 
 
 
318 aa  43.9  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  22.61 
 
 
281 aa  43.9  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  26.06 
 
 
302 aa  43.9  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  25.37 
 
 
274 aa  43.5  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3418  drug/metabolite exporter family protein  23.76 
 
 
302 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000357503  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  25.91 
 
 
309 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3369  drug/metabolite exporter family protein  23.76 
 
 
302 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00811973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3680  transporter, drug/metabolite exporter family  23.76 
 
 
302 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3704  transporter, drug/metabolite exporter family  23.76 
 
 
302 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3349  hypothetical protein  23.38 
 
 
302 aa  42.7  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000303507  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  22.12 
 
 
312 aa  42.7  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3697  hypothetical protein  23.76 
 
 
302 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  24.1 
 
 
312 aa  43.1  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  22.83 
 
 
294 aa  42.7  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.4 
 
 
330 aa  42.7  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.22 
 
 
293 aa  42.7  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  23.53 
 
 
293 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  25.91 
 
 
301 aa  42.4  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>