37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0550 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
293 aa  565  1e-160  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.84 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1440  hypothetical protein  27.21 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0416786  decreased coverage  0.00780704 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0834  hypothetical protein  28.77 
 
 
275 aa  68.9  0.00000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0292  hypothetical protein  26.83 
 
 
277 aa  60.8  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.379037  normal  0.0369953 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0071  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 
299 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0460  hypothetical protein  27.44 
 
 
277 aa  55.8  0.0000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4181  hypothetical protein  22.77 
 
 
297 aa  53.9  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 
315 aa  50.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213106  normal  0.0477313 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1460  lic-1 operon protein (LicB)  25.45 
 
 
310 aa  50.1  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.717026  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1221  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.88 
 
 
302 aa  48.9  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0371  hypothetical protein  24.48 
 
 
315 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0749298  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1359  hypothetical protein  30.08 
 
 
159 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  34.62 
 
 
315 aa  47  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  23.01 
 
 
312 aa  46.6  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00548  membrane protein  22.12 
 
 
291 aa  46.6  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  28.37 
 
 
289 aa  46.2  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0537  hypothetical protein  27.72 
 
 
274 aa  45.4  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0189141 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.11 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  24.07 
 
 
297 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  24.54 
 
 
297 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2687  hypothetical protein  33.33 
 
 
295 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.42391  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4737  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.07 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  24.66 
 
 
300 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.04 
 
 
299 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  0.15573 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0882  hypothetical protein  26.97 
 
 
296 aa  43.5  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000008536  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  27.05 
 
 
287 aa  43.5  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  25.46 
 
 
308 aa  43.5  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0190  hypothetical protein  24.81 
 
 
295 aa  43.1  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.86 
 
 
305 aa  43.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1265  hypothetical protein  27.42 
 
 
288 aa  42.7  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  37.29 
 
 
299 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  28.48 
 
 
315 aa  42.7  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1315  hypothetical protein  26.91 
 
 
302 aa  42.4  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3484  hypothetical protein  19.9 
 
 
288 aa  42.4  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  36.9 
 
 
289 aa  42.4  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  26.09 
 
 
304 aa  42.4  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>