20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1460 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1460  lic-1 operon protein (LicB)  100 
 
 		 310 aa  613  1e-175  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.717026  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0595  integral membrane protein  29.51 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437392  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0609  hypothetical protein  29.45 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.76 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2074  integral membrane protein  27.93 
 
 		 336 aa  85.9  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0941  hypothetical protein  28.94 
 
 		 343 aa  79  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0975  putative choline transport or trimethylamine permease  26.14 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4103099999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08310  membrane protein  24.45 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.229987 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.72 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1187  hypothetical protein  27 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1412  membrane spanning protein  25.56 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1367  transmembrane protein MttP  20.73 
 
 		 348 aa  62  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000313497  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1354  hypothetical protein  27.46 
 
 		 365 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.189044  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2311  trimethylamine transporter  19.64 
 
 		 347 aa  51.6  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0501876  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3285  hypothetical protein  25.93 
 
 		 362 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.55 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3288  hypothetical protein  24.35 
 
 		 359 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1504  trimethylamine permease  22.18 
 
 		 348 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0142032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  31.73 
 
 		 296 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  20 
 
 		 303 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>