More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0882 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0882  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  571  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000008536  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  38.43 
 
 		 274 aa  162  9e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.41 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  24.48 
 
 		 303 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  24.83 
 
 		 303 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  29.51 
 
 		 310 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  24.14 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  24.48 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  24.14 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  24.48 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  24.14 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  24.14 
 
 		 303 aa  93.6  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  23.45 
 
 		 303 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  28.28 
 
 		 345 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  24.14 
 
 		 303 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  24.91 
 
 		 304 aa  92.4  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.62 
 
 		 309 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  25 
 
 		 299 aa  89.7  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  29.25 
 
 		 306 aa  89  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  24.39 
 
 		 305 aa  86.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  24.2 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.94 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  26.15 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  26.25 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  26.85 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.74 
 
 		 325 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  26.37 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  27.15 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.53 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  26.95 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.08 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.55 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  25.09 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.89 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  25 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.3 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.52 
 
 		 306 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  25.95 
 
 		 300 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  23.73 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  29.48 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  23.96 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2030  hypothetical protein  26.62 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0852704 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.26 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.15 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  25.16 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  26.44 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1646  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.43 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  24.58 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  24.91 
 
 		 331 aa  72.4  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  27.51 
 
 		 317 aa  72.4  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.45 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.51 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.187128  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  24.91 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  28.12 
 
 		 308 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  26.03 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0328  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.64 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  26.12 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.07 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.71 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.73 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  24.83 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  25.61 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  25.35 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  25.35 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.63 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  25.26 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  28.79 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  27.18 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  27.18 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  25.95 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.54 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  26.37 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  26.37 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  24.72 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  26.37 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  26.37 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  26.37 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  26.99 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  26.37 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  26.37 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  28.92 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.46 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  22.44 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  27.04 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  29.8 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0771  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.86 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  33.85 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.37 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.01 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  28.92 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.28 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  26.85 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  25.74 
 
 		 309 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  27.65 
 
 		 287 aa  67  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  25.37 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3441  hypothetical protein  24.08 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0018566  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.5 
 
 		 290 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>